More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2827 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2827  ABC transporter related  100 
 
 
243 aa  479  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3881  ABC transporter related  68.75 
 
 
229 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.770849  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1841  ABC transporter related  68 
 
 
226 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.656554  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4228  ABC transporter related  68.56 
 
 
229 aa  300  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  0.619304 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3826  ABC transporter related  67.87 
 
 
225 aa  299  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1849  lipoprotein-releasing system (ABC transporter), ATP-binding protein lolD  66.67 
 
 
234 aa  295  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.115729  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1471  ABC transporter related  66.67 
 
 
232 aa  291  8e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3559  ABC transporter related  65.22 
 
 
239 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3410  ABC transporter, ATPase subunit  64.35 
 
 
239 aa  286  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.072759  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  62.83 
 
 
246 aa  265  5e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0086  ABC transporter related  63.23 
 
 
231 aa  262  4.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0522946  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3253  ABC transporter-related protein  58.15 
 
 
230 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12235  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3478  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  47.7 
 
 
258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.741929  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  50 
 
 
238 aa  219  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.9 
 
 
233 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  48.9 
 
 
233 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  48.9 
 
 
233 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.9 
 
 
233 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0747  ABC transporter related  49.55 
 
 
221 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.9 
 
 
233 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2018  ABC transporter related  48.09 
 
 
238 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.9 
 
 
233 aa  218  7e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 
227 aa  218  7e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.9 
 
 
233 aa  218  7e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.9 
 
 
233 aa  218  7e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.9 
 
 
233 aa  218  7e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  47.56 
 
 
230 aa  217  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.34 
 
 
233 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.34 
 
 
233 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.34 
 
 
233 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.34 
 
 
233 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.34 
 
 
233 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.1 
 
 
227 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.54 
 
 
233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1701  ATPase  48.47 
 
 
240 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.620814 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  53.33 
 
 
225 aa  216  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.51 
 
 
239 aa  215  5e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  51.49 
 
 
654 aa  214  8e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0961  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.23 
 
 
242 aa  214  9e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00749478  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  47.77 
 
 
230 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4094  ABC transporter related  53.15 
 
 
226 aa  214  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1057  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.23 
 
 
242 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.46 
 
 
233 aa  214  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1118  lipoprotein releasing system ATP-binding ABC transporter  52.89 
 
 
244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107348  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0481  ABC transporter related  45.83 
 
 
241 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.32 
 
 
253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  49.12 
 
 
229 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  53.77 
 
 
224 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.88 
 
 
253 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  48.02 
 
 
237 aa  211  9e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0264  ATPase  47.6 
 
 
246 aa  211  1e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.88 
 
 
253 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  46.26 
 
 
238 aa  211  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  43.81 
 
 
230 aa  210  1e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  50 
 
 
656 aa  209  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  44.74 
 
 
642 aa  209  3e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  51.14 
 
 
253 aa  209  4e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1467  ABC transporter related  50 
 
 
232 aa  209  4e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  50.43 
 
 
657 aa  208  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  44.1 
 
 
247 aa  208  5e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0461  ABC transporter-related protein  44.89 
 
 
227 aa  208  5e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.880159  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3219  ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 
248 aa  208  6e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.27 
 
 
233 aa  208  6e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  50.44 
 
 
654 aa  208  7e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  50.67 
 
 
224 aa  208  7e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  48.54 
 
 
654 aa  208  7e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  51.34 
 
 
227 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.33 
 
 
225 aa  207  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711904  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2754  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 
226 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  48.44 
 
 
269 aa  207  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1167  ABC transporter related  48.02 
 
 
235 aa  207  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  51.75 
 
 
657 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0473  ABC transporter related  45.65 
 
 
238 aa  206  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3420  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 
226 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0399135  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  49.77 
 
 
224 aa  206  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  45.54 
 
 
225 aa  206  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  47.23 
 
 
652 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  46.05 
 
 
252 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.89 
 
 
227 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  46.64 
 
 
228 aa  206  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  48.88 
 
 
228 aa  206  3e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  48.65 
 
 
230 aa  206  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.08 
 
 
234 aa  206  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1684  ABC transporter related  50.85 
 
 
656 aa  205  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  43.75 
 
 
225 aa  206  4e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.98 
 
 
231 aa  205  5e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2437  ABC transporter related  47.77 
 
 
231 aa  205  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  49.79 
 
 
663 aa  205  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.64 
 
 
238 aa  205  6e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1211  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.45 
 
 
225 aa  204  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2397  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.77 
 
 
232 aa  204  9e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14700  lipoprotein-releasing ABC transporter  52.89 
 
 
232 aa  204  9e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.072484  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.58 
 
 
231 aa  204  9e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  47.16 
 
 
279 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  49.79 
 
 
663 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  45.29 
 
 
237 aa  203  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  44.2 
 
 
246 aa  203  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.96 
 
 
648 aa  203  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1041  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.45 
 
 
249 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1251  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.33 
 
 
238 aa  203  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>