More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2159 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  76.37 
 
 		 654 aa  1015    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  76.22 
 
 		 654 aa  983    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  100 
 
 		 656 aa  1320    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  94.22 
 
 		 657 aa  1226    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  76.37 
 
 		 654 aa  987    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  59.06 
 
 		 666 aa  740    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  83.11 
 
 		 657 aa  1088    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  52.51 
 
 		 661 aa  652    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  76.78 
 
 		 663 aa  1024    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  76.93 
 
 		 663 aa  1028    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1684  ABC transporter related  78.08 
 
 		 656 aa  999    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  52.82 
 
 		 671 aa  641    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  52.29 
 
 		 652 aa  633  1e-180  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  50.99 
 
 		 644 aa  613  9.999999999999999e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  50.53 
 
 		 653 aa  595  1e-168  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  51.67 
 
 		 651 aa  592  1e-168  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  49.47 
 
 		 645 aa  575  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  46.6 
 
 		 687 aa  558  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  47.42 
 
 		 648 aa  559  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  46.88 
 
 		 649 aa  548  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  46.58 
 
 		 649 aa  546  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  45.52 
 
 		 681 aa  545  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  45.08 
 
 		 652 aa  543  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  45.52 
 
 		 681 aa  545  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  47.2 
 
 		 651 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3236  hypothetical protein  49.16 
 
 		 650 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  46.89 
 
 		 650 aa  535  1e-151  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  44.46 
 
 		 643 aa  535  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2219  ABC transporter related  46.18 
 
 		 652 aa  536  1e-151  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  44.89 
 
 		 656 aa  534  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2832  syringolide efflux protein SyfD  47.05 
 
 		 668 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237626  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  44.51 
 
 		 656 aa  530  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  45.92 
 
 		 648 aa  526  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  45.92 
 
 		 648 aa  526  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  45.92 
 
 		 648 aa  526  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  44.49 
 
 		 647 aa  526  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.92 
 
 		 648 aa  526  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.77 
 
 		 648 aa  525  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.92 
 
 		 648 aa  526  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  44.78 
 
 		 649 aa  525  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.92 
 
 		 648 aa  526  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.77 
 
 		 648 aa  524  1e-147  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  43.59 
 
 		 682 aa  522  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  47.15 
 
 		 653 aa  525  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  44.25 
 
 		 667 aa  525  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  47.13 
 
 		 648 aa  525  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  43.59 
 
 		 682 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  44.1 
 
 		 667 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  43.01 
 
 		 678 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  45.25 
 
 		 653 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.01 
 
 		 678 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  45.39 
 
 		 647 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  43.01 
 
 		 678 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.37 
 
 		 646 aa  516  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0926  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  46.54 
 
 		 653 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0835  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  46.76 
 
 		 653 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.077145  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  45.08 
 
 		 650 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44.7 
 
 		 648 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2185  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  46.26 
 
 		 653 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44.8 
 
 		 648 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  43.07 
 
 		 653 aa  515  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44.65 
 
 		 648 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44.49 
 
 		 648 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44.49 
 
 		 648 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  41.79 
 
 		 696 aa  505  9.999999999999999e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5133  ABC transporter related  49.31 
 
 		 640 aa  506  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.316349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1297  ABC transporter related  46.73 
 
 		 652 aa  500  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1867  ABC transporter related  43.84 
 
 		 655 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2453  ABC transporter related  45.66 
 
 		 676 aa  491  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  41.99 
 
 		 648 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  41.99 
 
 		 648 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0572  macrolide ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.75 
 
 		 665 aa  480  1e-134  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.412698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  39.73 
 
 		 642 aa  481  1e-134  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  44.18 
 
 		 654 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  42.41 
 
 		 646 aa  481  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  43.73 
 
 		 668 aa  476  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  43.73 
 
 		 668 aa  476  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  44.59 
 
 		 654 aa  474  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  40.06 
 
 		 640 aa  473  1e-132  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0562  ABC transporter related  42.81 
 
 		 665 aa  469  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.49 
 
 		 647 aa  469  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  39.76 
 
 		 641 aa  466  9.999999999999999e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  40.18 
 
 		 642 aa  459  9.999999999999999e-129  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2115  ABC transporter related  44.51 
 
 		 647 aa  457  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0097  macrolide-specific ABC-type efflux carrier MacB  41.87 
 
 		 668 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  38.6 
 
 		 641 aa  449  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  38.3 
 
 		 641 aa  443  1e-123  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  38.15 
 
 		 641 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  38.22 
 
 		 643 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  39.94 
 
 		 657 aa  422  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  40.36 
 
 		 707 aa  421  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  39.22 
 
 		 653 aa  422  1e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  39.07 
 
 		 656 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  39.31 
 
 		 657 aa  414  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  38.18 
 
 		 658 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  38.97 
 
 		 670 aa  403  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6611  ABC transporter related  41.6 
 
 		 660 aa  405  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.961968 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  37.07 
 
 		 715 aa  402  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  38.28 
 
 		 657 aa  390  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3414  ABC transporter related  62.39 
 
 		 306 aa  278  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>