More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2018 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2018  ABC transporter related  100 
 
 		 238 aa  486  1e-136  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0473  ABC transporter related  86.9 
 
 		 238 aa  417  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0481  ABC transporter related  88.6 
 
 		 241 aa  414  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1701  ATPase  85.22 
 
 		 240 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.620814 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0264  ATPase  78.3 
 
 		 246 aa  382  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0425  ABC transporter related  78.32 
 
 		 234 aa  366  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0461  ABC transporter-related protein  74.34 
 
 		 227 aa  358  4e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.880159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  53.85 
 
 		 256 aa  227  2e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.73 
 
 		 238 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  53 
 
 		 227 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3826  ABC transporter related  47.75 
 
 		 225 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2827  ABC transporter related  48.09 
 
 		 243 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4228  ABC transporter related  47.11 
 
 		 229 aa  218  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  0.619304 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.6 
 
 		 233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.6 
 
 		 233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.6 
 
 		 233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  51.22 
 
 		 246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.6 
 
 		 233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  49.1 
 
 		 223 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  46.41 
 
 		 239 aa  216  4e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.5 
 
 		 227 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  50.23 
 
 		 230 aa  214  7e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 		 253 aa  214  8e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2202  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.77 
 
 		 227 aa  214  8e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.15426 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0908  ABC transporter related  50.97 
 
 		 235 aa  214  9e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  47.12 
 
 		 233 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  47.12 
 
 		 233 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1841  ABC transporter related  45.05 
 
 		 226 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.656554  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.12 
 
 		 233 aa  214  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2535  ABC transporter related  49.78 
 
 		 230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.14801  normal  0.635881 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  51.76 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.12 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2735  ABC transporter related  49.34 
 
 		 223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.31749  normal  0.728727 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.76 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.08 
 
 		 233 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.08 
 
 		 233 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.08 
 
 		 233 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6890  ABC transporter related  50.75 
 
 		 226 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.08 
 
 		 233 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.08 
 
 		 233 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  48.34 
 
 		 225 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.52 
 
 		 253 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3881  ABC transporter related  46.19 
 
 		 229 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.770849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.12 
 
 		 233 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  44.78 
 
 		 238 aa  212  4.9999999999999996e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  46.26 
 
 		 227 aa  211  5.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.49 
 
 		 231 aa  211  7e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3231  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 		 258 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.15277  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.2 
 
 		 231 aa  211  9e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.1 
 
 		 236 aa  211  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3587  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.24 
 
 		 232 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.03 
 
 		 230 aa  210  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1672  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.24 
 
 		 232 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.50356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  48.79 
 
 		 235 aa  210  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.24 
 
 		 232 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390667  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  50.25 
 
 		 223 aa  210  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.75 
 
 		 233 aa  209  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0943  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.12 
 
 		 227 aa  209  2e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0833  ABC transporter related  47.56 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1849  lipoprotein-releasing system (ABC transporter), ATP-binding protein lolD  45.45 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.115729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1471  ABC transporter related  45.18 
 
 		 232 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1696  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.74 
 
 		 232 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0743106 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  46.26 
 
 		 228 aa  209  4e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.31 
 
 		 239 aa  209  4e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1564  ABC transporter related protein  45.09 
 
 		 226 aa  208  5e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3858  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.75 
 
 		 232 aa  208  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1047  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  45.45 
 
 		 233 aa  208  5e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1542  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.09 
 
 		 237 aa  208  5e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0939  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 233 aa  208  5e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  49.28 
 
 		 224 aa  208  6e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0782  ABC lipoprotein exporter, ATPase subunit, LolD  46.86 
 
 		 226 aa  208  6e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000690329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1608  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.5 
 
 		 237 aa  208  6e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109115  normal  0.0760989 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14700  lipoprotein-releasing ABC transporter  50.24 
 
 		 232 aa  208  7e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.072484  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1739  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.19 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2670  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.38 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  52.22 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  46.19 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  48.26 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0982  ABC transporter related protein  48.26 
 
 		 220 aa  207  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.452379 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00596  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.64 
 
 		 236 aa  207  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820221  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0788  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.38 
 
 		 226 aa  207  2e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00288546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2864  ABC transporter related  53.03 
 
 		 230 aa  206  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1211  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.29 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3559  ABC transporter related  46.72 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  48.08 
 
 		 242 aa  206  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  44.25 
 
 		 235 aa  206  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.74 
 
 		 236 aa  205  5e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1473  ABC transporter, ATP-binding protein  45.63 
 
 		 228 aa  204  7e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.25 
 
 		 233 aa  204  7e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3744  ABC transporter related  48.76 
 
 		 230 aa  204  8e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.319618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3973  ABC transporter related protein  49.76 
 
 		 275 aa  204  8e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0341  ABC transporter related  48.04 
 
 		 226 aa  204  9e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3255  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.06 
 
 		 318 aa  204  9e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1649  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.57 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0411  ABC transporter related  50.25 
 
 		 287 aa  204  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2392  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.49 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000179176  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1955  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.49 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00212141  normal  0.0513198 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.23 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.93 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>