More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3559 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3559  ABC transporter related  100 
 
 
239 aa  471  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3410  ABC transporter, ATPase subunit  98.33 
 
 
239 aa  464  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.072759  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2827  ABC transporter related  65.22 
 
 
243 aa  290  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  65.04 
 
 
246 aa  278  5e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4228  ABC transporter related  63.8 
 
 
229 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  0.619304 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0086  ABC transporter related  62.61 
 
 
231 aa  269  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0522946  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1841  ABC transporter related  60.45 
 
 
226 aa  267  8e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.656554  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3881  ABC transporter related  61.16 
 
 
229 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.770849  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1471  ABC transporter related  59.82 
 
 
232 aa  264  8e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3826  ABC transporter related  59.55 
 
 
225 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1849  lipoprotein-releasing system (ABC transporter), ATP-binding protein lolD  57.69 
 
 
234 aa  257  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.115729  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3253  ABC transporter-related protein  58.87 
 
 
230 aa  249  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12235  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  50 
 
 
256 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  52 
 
 
225 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  48.86 
 
 
227 aa  216  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  50.22 
 
 
230 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  53.02 
 
 
233 aa  214  7e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  50.21 
 
 
648 aa  214  8e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  50.66 
 
 
237 aa  214  8e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  52.21 
 
 
671 aa  214  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.52 
 
 
233 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  52.56 
 
 
233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  48.62 
 
 
235 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  52.56 
 
 
233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  52.56 
 
 
233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.56 
 
 
233 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  52.56 
 
 
233 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.49 
 
 
227 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  52.56 
 
 
233 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  52.56 
 
 
233 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  50.9 
 
 
240 aa  211  1e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  52.51 
 
 
224 aa  209  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0461  ABC transporter-related protein  45.33 
 
 
227 aa  209  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.880159  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  52.09 
 
 
233 aa  209  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  50.68 
 
 
223 aa  210  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2345  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
233 aa  209  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  49.53 
 
 
227 aa  208  5e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.77 
 
 
230 aa  208  5e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  52.09 
 
 
233 aa  208  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1211  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.56 
 
 
225 aa  208  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1672  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.34 
 
 
232 aa  208  6e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.50356  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  52.09 
 
 
233 aa  208  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  52.09 
 
 
233 aa  208  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  52.09 
 
 
233 aa  208  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  52.09 
 
 
233 aa  208  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  47.21 
 
 
646 aa  207  8e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  48.86 
 
 
249 aa  208  8e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  49.07 
 
 
227 aa  207  9e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  46.88 
 
 
230 aa  207  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3258  ABC transporter, ATP-binding protein  50.45 
 
 
233 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.219344  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3144  ABC transporter, ATP-binding protein  50.45 
 
 
233 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1473  ABC-transporter ATP binding protein  50.45 
 
 
233 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.1 
 
 
233 aa  207  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  50.67 
 
 
224 aa  207  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  49.12 
 
 
238 aa  206  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  47.77 
 
 
241 aa  206  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  48.21 
 
 
649 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  48.21 
 
 
649 aa  206  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  46.58 
 
 
238 aa  206  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.77 
 
 
225 aa  206  3e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711904  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2018  ABC transporter related  46.72 
 
 
238 aa  206  3e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3478  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  45.5 
 
 
258 aa  206  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.741929  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  49.31 
 
 
222 aa  205  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4094  ABC transporter related  51.12 
 
 
226 aa  206  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  49.09 
 
 
252 aa  205  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2086  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
233 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2377  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
233 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1392  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
233 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  50.45 
 
 
224 aa  205  6e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1113  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
233 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2625  lipoprotein ABC transporter, ATP-binding protein LolD  48.91 
 
 
224 aa  204  8e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3587  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.4 
 
 
232 aa  204  8e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.85 
 
 
231 aa  204  8e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.4 
 
 
232 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390667  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  47.95 
 
 
249 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1696  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.4 
 
 
232 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0743106 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  47.53 
 
 
231 aa  204  1e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.02 
 
 
234 aa  204  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0747  ABC transporter related  47.95 
 
 
221 aa  203  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2748  ABC transporter component  50.89 
 
 
231 aa  203  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00767275  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.73 
 
 
238 aa  203  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  47.73 
 
 
235 aa  203  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.32 
 
 
239 aa  203  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  47.03 
 
 
244 aa  203  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2507  ABC transporter related  51.33 
 
 
231 aa  203  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  49.09 
 
 
715 aa  203  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1118  lipoprotein releasing system ATP-binding ABC transporter  49.78 
 
 
244 aa  202  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107348  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  47.75 
 
 
242 aa  202  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  45.29 
 
 
236 aa  202  3e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3016  ABC transporter related  51.13 
 
 
227 aa  202  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0473  ABC transporter related  45.69 
 
 
238 aa  203  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  48.91 
 
 
234 aa  202  4e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  46.22 
 
 
238 aa  202  4e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  48.91 
 
 
234 aa  202  4e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2476  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.32 
 
 
235 aa  202  4e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  48.65 
 
 
644 aa  202  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  48.66 
 
 
277 aa  202  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  44.84 
 
 
286 aa  202  5e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  49.12 
 
 
661 aa  201  6e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  48.51 
 
 
653 aa  201  7e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>