More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4228 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4228  ABC transporter related  100 
 
 		 229 aa  464  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  0.619304 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1841  ABC transporter related  79.91 
 
 		 226 aa  367  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.656554  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3881  ABC transporter related  79.3 
 
 		 229 aa  360  8e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.770849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1471  ABC transporter related  79.02 
 
 		 232 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3826  ABC transporter related  75 
 
 		 225 aa  351  5.9999999999999994e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1849  lipoprotein-releasing system (ABC transporter), ATP-binding protein lolD  66.08 
 
 		 234 aa  311  5.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.115729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2827  ABC transporter related  68.56 
 
 		 243 aa  300  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3410  ABC transporter, ATPase subunit  65.16 
 
 		 239 aa  278  6e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.072759  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3559  ABC transporter related  63.8 
 
 		 239 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0086  ABC transporter related  60.89 
 
 		 231 aa  266  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0522946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  58.93 
 
 		 246 aa  257  8e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3253  ABC transporter-related protein  54.09 
 
 		 230 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12235  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  48.42 
 
 		 227 aa  222  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.87 
 
 		 227 aa  221  8e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1701  ATPase  48.26 
 
 		 240 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.620814 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  48.66 
 
 		 256 aa  220  9.999999999999999e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2018  ABC transporter related  47.11 
 
 		 238 aa  218  3.9999999999999997e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  49.11 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0473  ABC transporter related  46.43 
 
 		 238 aa  215  4e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  48.66 
 
 		 233 aa  214  8e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.66 
 
 		 233 aa  214  8e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  48.66 
 
 		 233 aa  214  8e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.66 
 
 		 233 aa  214  9e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.66 
 
 		 233 aa  214  9e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.66 
 
 		 233 aa  214  9e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.66 
 
 		 233 aa  214  9e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.66 
 
 		 233 aa  213  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.66 
 
 		 233 aa  213  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.66 
 
 		 233 aa  213  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.66 
 
 		 233 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.66 
 
 		 233 aa  213  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.66 
 
 		 233 aa  213  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0481  ABC transporter related  45.33 
 
 		 241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.66 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3478  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  45.98 
 
 		 258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.741929  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0264  ATPase  46.22 
 
 		 246 aa  211  7e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0461  ABC transporter-related protein  44.8 
 
 		 227 aa  211  7.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.880159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.98 
 
 		 233 aa  210  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.32 
 
 		 233 aa  209  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  49.34 
 
 		 225 aa  209  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0747  ABC transporter related  49.32 
 
 		 221 aa  209  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.72 
 
 		 234 aa  208  5e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  46.98 
 
 		 242 aa  208  6e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1251  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 238 aa  208  6e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.76 
 
 		 230 aa  208  6e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1211  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.56 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  42.98 
 
 		 230 aa  206  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0425  ABC transporter related  44.3 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1839  ABC transporter related  48.86 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.61 
 
 		 238 aa  205  4e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1845  ABC transporter related  50.67 
 
 		 227 aa  205  4e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141516  normal  0.653489 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1542  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.66 
 
 		 237 aa  205  5e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2784  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.29 
 
 		 235 aa  205  6e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0359571  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.46 
 
 		 234 aa  205  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  48.21 
 
 		 224 aa  204  7e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.46 
 
 		 234 aa  204  7e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.46 
 
 		 234 aa  204  7e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2345  ABC transporter related  49.11 
 
 		 223 aa  204  8e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.144574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2476  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.85 
 
 		 235 aa  204  9e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  48.87 
 
 		 230 aa  204  9e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3420  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.95 
 
 		 226 aa  204  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0399135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2754  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.95 
 
 		 226 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  46.19 
 
 		 227 aa  203  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1057  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.11 
 
 		 242 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0961  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.11 
 
 		 242 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00749478  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  46.88 
 
 		 223 aa  202  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  48.21 
 
 		 224 aa  202  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0748  ABC transporter related  49.32 
 
 		 227 aa  201  6e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  45.29 
 
 		 227 aa  201  7e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3699  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.53 
 
 		 230 aa  201  7e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752092 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  47.53 
 
 		 251 aa  201  8e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1118  lipoprotein releasing system ATP-binding ABC transporter  47.56 
 
 		 244 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107348  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  47.06 
 
 		 230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1649  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.09 
 
 		 235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0776  ABC lipoprotein efflux transporter, ATPase subunit, LolD  47.32 
 
 		 224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2748  ABC transporter component  50.23 
 
 		 231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00767275  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  43.3 
 
 		 235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.77 
 
 		 227 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  47.11 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  47.77 
 
 		 227 aa  199  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  47.32 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.49 
 
 		 239 aa  199  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  47.35 
 
 		 715 aa  199  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3231  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.96 
 
 		 258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.15277  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  47.58 
 
 		 241 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.37 
 
 		 232 aa  198  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390667  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  46.55 
 
 		 228 aa  198  5e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1015  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.51 
 
 		 224 aa  198  5e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2023  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.9 
 
 		 231 aa  198  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  47.77 
 
 		 237 aa  198  6e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1810  putative ATP-binding component of ABC transporter  44.64 
 
 		 228 aa  198  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.512088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2131  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.9 
 
 		 253 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.099841  normal  0.052889 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5964  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.9 
 
 		 253 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115719  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2113  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.9 
 
 		 253 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0436359  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3973  ABC transporter related protein  48.64 
 
 		 275 aa  197  9e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155103  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  47.37 
 
 		 238 aa  197  9e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2150  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.9 
 
 		 252 aa  197  9e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0659015  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3587  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.93 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5419  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.46 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.912303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1173  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.9 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.659944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>