More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5964 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2131  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  100 
 
 
253 aa  513  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.099841  normal  0.052889 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5964  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  100 
 
 
253 aa  513  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115719  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2113  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  100 
 
 
253 aa  513  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0436359  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5419  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  98.42 
 
 
252 aa  503  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.912303  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2150  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  97.63 
 
 
252 aa  494  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0659015  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1157  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  94.86 
 
 
252 aa  485  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.572225  normal  0.0166271 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2023  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  99.13 
 
 
231 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2583  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  83.79 
 
 
249 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.484423  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  84.19 
 
 
249 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2638  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  84.19 
 
 
249 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2200  ABC transporter, ATP-binding protein  86.97 
 
 
240 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3118  ABC transporter, ATP-binding protein  86.97 
 
 
240 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1888  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  81.82 
 
 
249 aa  417  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1695  ABC transporter, ATP-binding protein  88.55 
 
 
227 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1445  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  82.21 
 
 
247 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303456  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2566  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  80.24 
 
 
247 aa  411  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0799342  normal  0.05105 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1567  ABC lipoprotein efflux pump, ATPase subunit  79.61 
 
 
247 aa  408  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1057  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  74.67 
 
 
242 aa  343  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0961  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  74.67 
 
 
242 aa  342  2e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00749478  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1118  lipoprotein releasing system ATP-binding ABC transporter  76.58 
 
 
244 aa  339  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107348  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1041  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  74.32 
 
 
249 aa  332  4e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1077  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  74.77 
 
 
244 aa  321  6e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0335181  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5400  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  67.58 
 
 
238 aa  294  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122098  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1211  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  65.02 
 
 
225 aa  291  6e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3699  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  65.04 
 
 
230 aa  288  6e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.752092 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2754  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  65.16 
 
 
226 aa  285  4e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3420  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  65.16 
 
 
226 aa  285  4e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0399135  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3180  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  64.84 
 
 
234 aa  283  3.0000000000000004e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269698  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2397  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  63.51 
 
 
232 aa  280  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1987  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  63.48 
 
 
233 aa  278  9e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.43138  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2835  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  59.56 
 
 
225 aa  273  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.21843  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  60.99 
 
 
225 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711904  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3255  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  62.78 
 
 
318 aa  270  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2747  putative lipoprotein releasing system ATP-binding ABC transporter  65.75 
 
 
233 aa  271  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.650298  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3231  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  61.78 
 
 
258 aa  270  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.15277  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1739  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  60.55 
 
 
228 aa  269  2e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1015  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  61.99 
 
 
224 aa  269  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1467  ABC transporter related  58.85 
 
 
232 aa  268  8.999999999999999e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  55.16 
 
 
231 aa  265  4e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0490  ABC transporter related  59.19 
 
 
241 aa  265  5e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2094  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  61.36 
 
 
225 aa  265  7e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0980636  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  61.64 
 
 
227 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  61.64 
 
 
227 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1760  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  63.68 
 
 
226 aa  262  4e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.585377  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  54.91 
 
 
227 aa  261  6e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2670  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  57.52 
 
 
233 aa  261  6e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  59.03 
 
 
236 aa  261  6e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  56.05 
 
 
231 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1173  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  56.56 
 
 
230 aa  261  6.999999999999999e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.659944  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  54.87 
 
 
236 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  54.46 
 
 
227 aa  261  1e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14700  lipoprotein-releasing ABC transporter  59.13 
 
 
232 aa  261  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.072484  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3858  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  57.08 
 
 
232 aa  259  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1251  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  60.18 
 
 
238 aa  259  3e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2625  lipoprotein ABC transporter, ATP-binding protein LolD  60.54 
 
 
224 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0225  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  58.37 
 
 
235 aa  258  9e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  54.91 
 
 
230 aa  257  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0782  ABC lipoprotein exporter, ATPase subunit, LolD  58.26 
 
 
226 aa  257  1e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000690329  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  55.16 
 
 
253 aa  257  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  55.16 
 
 
253 aa  257  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  57.4 
 
 
231 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.214498  normal  0.0731118 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2403  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  57.4 
 
 
231 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.017802  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  57.08 
 
 
230 aa  256  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0788  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  58.26 
 
 
226 aa  256  2e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00288546  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1955  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  57.4 
 
 
231 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00212141  normal  0.0513198 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  55.16 
 
 
253 aa  256  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2392  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  57.4 
 
 
231 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000179176  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.15 
 
 
238 aa  255  4e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1542  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  57.73 
 
 
237 aa  253  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  58.45 
 
 
232 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390667  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1473  ABC transporter, ATP-binding protein  54.79 
 
 
228 aa  252  3e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1905  ABC transporter  57.46 
 
 
232 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.030671  hitchhiker  0.00477686 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.51 
 
 
233 aa  251  5.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  55.25 
 
 
233 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1696  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  57.99 
 
 
232 aa  251  7e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0743106 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3587  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  57.99 
 
 
232 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  55.09 
 
 
242 aa  251  9.000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2784  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  55.11 
 
 
235 aa  251  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0359571  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2110  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  58.82 
 
 
227 aa  250  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327519  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01531  hypothetical protein  54.79 
 
 
235 aa  250  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1672  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  57.99 
 
 
232 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.50356  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00596  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  56.56 
 
 
236 aa  250  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820221  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.6 
 
 
239 aa  250  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  53.88 
 
 
235 aa  249  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0939  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  55.61 
 
 
233 aa  250  2e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1047  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  55.61 
 
 
233 aa  250  2e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  54.15 
 
 
233 aa  249  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1649  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  54.67 
 
 
235 aa  249  3e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1810  putative ATP-binding component of ABC transporter  53.98 
 
 
228 aa  249  3e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.512088  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  55.11 
 
 
234 aa  248  8e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  53.81 
 
 
229 aa  248  8e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2476  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  54.67 
 
 
235 aa  248  9e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1608  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  55.51 
 
 
237 aa  247  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109115  normal  0.0760989 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.71 
 
 
233 aa  246  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  53.71 
 
 
233 aa  246  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  53.71 
 
 
233 aa  246  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  53.71 
 
 
233 aa  246  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  55.11 
 
 
234 aa  246  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  53.71 
 
 
233 aa  247  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  55.11 
 
 
234 aa  246  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>