More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3826 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3826  ABC transporter related  100 
 
 		 225 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1471  ABC transporter related  83.56 
 
 		 232 aa  387  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3881  ABC transporter related  83.11 
 
 		 229 aa  381  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.770849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1841  ABC transporter related  81.33 
 
 		 226 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.656554  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4228  ABC transporter related  75 
 
 		 229 aa  351  5.9999999999999994e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  0.619304 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1849  lipoprotein-releasing system (ABC transporter), ATP-binding protein lolD  70.67 
 
 		 234 aa  325  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.115729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2827  ABC transporter related  67.87 
 
 		 243 aa  299  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0086  ABC transporter related  60.99 
 
 		 231 aa  275  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0522946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3410  ABC transporter, ATPase subunit  60 
 
 		 239 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.072759  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3559  ABC transporter related  59.55 
 
 		 239 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  56.31 
 
 		 246 aa  251  7e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0461  ABC transporter-related protein  46.61 
 
 		 227 aa  228  6e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.880159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3253  ABC transporter-related protein  53.18 
 
 		 230 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12235  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 		 227 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  50.45 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  49.11 
 
 		 224 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1701  ATPase  47.75 
 
 		 240 aa  219  3e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.620814 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2018  ABC transporter related  47.75 
 
 		 238 aa  219  3e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  50 
 
 		 225 aa  218  7e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0481  ABC transporter related  46.22 
 
 		 241 aa  218  7.999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.95 
 
 		 227 aa  214  5.9999999999999996e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.42 
 
 		 230 aa  214  8e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.87 
 
 		 233 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.87 
 
 		 233 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.87 
 
 		 233 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.87 
 
 		 233 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.87 
 
 		 233 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0264  ATPase  45.95 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  47.51 
 
 		 233 aa  212  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  47.11 
 
 		 223 aa  212  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  47.51 
 
 		 233 aa  212  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.51 
 
 		 233 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.51 
 
 		 233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.51 
 
 		 233 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.51 
 
 		 233 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.51 
 
 		 233 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.51 
 
 		 233 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  48.42 
 
 		 230 aa  211  5.999999999999999e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.51 
 
 		 233 aa  211  9e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.96 
 
 		 238 aa  211  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  46.4 
 
 		 256 aa  209  2e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0473  ABC transporter related  44.8 
 
 		 238 aa  210  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  44.44 
 
 		 235 aa  208  4e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.4 
 
 		 233 aa  208  5e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0425  ABC transporter related  44.8 
 
 		 234 aa  208  6e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  49.77 
 
 		 230 aa  208  7e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.95 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  45.98 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3973  ABC transporter related protein  50.74 
 
 		 275 aa  206  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155103  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  46.58 
 
 		 227 aa  205  5e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0747  ABC transporter related  47.95 
 
 		 221 aa  205  5e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1473  ABC transporter, ATP-binding protein  45.95 
 
 		 228 aa  205  5e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  43.89 
 
 		 286 aa  204  8e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4094  ABC transporter related  49.32 
 
 		 226 aa  204  9e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  47.51 
 
 		 229 aa  204  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  47.06 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  47.2 
 
 		 238 aa  202  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0894  ABC transporter related  47.51 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.552759  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.95 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0699  ABC transporter related  49.08 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.95 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0748  ABC transporter related  50.23 
 
 		 227 aa  202  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  45.66 
 
 		 227 aa  202  3e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3195  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.91 
 
 		 227 aa  202  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  46.43 
 
 		 224 aa  202  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3478  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  45.98 
 
 		 258 aa  202  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.741929  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  48.4 
 
 		 230 aa  202  4e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.25 
 
 		 233 aa  202  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  47.3 
 
 		 224 aa  201  7e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  44.34 
 
 		 235 aa  201  8e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  47.06 
 
 		 226 aa  201  8e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.25 
 
 		 234 aa  201  9e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.49 
 
 		 253 aa  201  9e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2810  ABC transporter related  45.29 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0257216  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.4 
 
 		 231 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  44.14 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  45.37 
 
 		 242 aa  200  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3587  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.06 
 
 		 232 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.61 
 
 		 236 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0943  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.05 
 
 		 227 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  47.96 
 
 		 237 aa  199  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  45.74 
 
 		 236 aa  199  3e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  48 
 
 		 238 aa  199  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.49 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  47.11 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1839  ABC transporter related  47.47 
 
 		 220 aa  199  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  48.43 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0776  ABC lipoprotein efflux transporter, ATPase subunit, LolD  49.11 
 
 		 224 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3420  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.03 
 
 		 226 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0399135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2754  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.03 
 
 		 226 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  45.25 
 
 		 238 aa  198  3.9999999999999996e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  47.11 
 
 		 234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  47.11 
 
 		 254 aa  198  3.9999999999999996e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1542  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.95 
 
 		 237 aa  198  5e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1696  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.61 
 
 		 232 aa  198  6e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0743106 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1377  ABC transporter related  47.96 
 
 		 229 aa  198  6e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0531793  normal  0.0760119 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.61 
 
 		 232 aa  197  7e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390667  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  48.2 
 
 		 233 aa  198  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  45.66 
 
 		 246 aa  197  7e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  45.98 
 
 		 234 aa  197  7.999999999999999e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>