More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1839 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1839  ABC transporter related  100 
 
 		 220 aa  437  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0776  ABC lipoprotein efflux transporter, ATPase subunit, LolD  72.73 
 
 		 224 aa  316  1e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3315  ABC transporter related  71.36 
 
 		 227 aa  309  2e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.0682474 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0748  ABC transporter related  70.37 
 
 		 227 aa  304  7e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2432  ABC transporter related  71.82 
 
 		 224 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.109204  normal  0.0982915 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1845  ABC transporter related  71.82 
 
 		 227 aa  293  1e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141516  normal  0.653489 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0403  ABC transporter related  73.18 
 
 		 224 aa  289  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1194  ABC transporter related  63.08 
 
 		 236 aa  249  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1064  ABC transporter related  63.08 
 
 		 236 aa  249  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.608919  normal  0.101956 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4410  ABC transporter related  65.64 
 
 		 234 aa  249  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2039  ABC transporter related  64.1 
 
 		 237 aa  249  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1281  ABC transporter related  60 
 
 		 227 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0118107  normal  0.276429 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1795  ABC transporter related  60.75 
 
 		 229 aa  248  8e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.219829  normal  0.943815 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0699  ABC transporter related  60.28 
 
 		 229 aa  248  8e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1373  ABC transporter related  59.53 
 
 		 227 aa  246  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3203  ABC transporter related  59.07 
 
 		 242 aa  246  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0920  ABC transporter related  60 
 
 		 228 aa  245  4.9999999999999997e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1042  ABC transporter related  57.6 
 
 		 229 aa  243  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0796  ABC transporter, ATP-binding protein  57.34 
 
 		 226 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.109288  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0824  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  60.47 
 
 		 227 aa  242  3e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.617096  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1377  ABC transporter related  59.91 
 
 		 229 aa  242  3e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0531793  normal  0.0760119 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (lipoprotein)  59.07 
 
 		 229 aa  241  9e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00216433  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0999  ABC transporter related  62.15 
 
 		 236 aa  240  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.115476 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4146  ABC transporter related  64.25 
 
 		 234 aa  239  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0818  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  60 
 
 		 227 aa  239  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4461  ABC transporter related  57.94 
 
 		 247 aa  237  8e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.856819  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2403  ABC transporter related  58.14 
 
 		 227 aa  237  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155422  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3345  ABC transporter related  61.57 
 
 		 237 aa  235  5.0000000000000005e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1176  ABC transporter related  58.71 
 
 		 225 aa  234  6e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2810  ABC transporter related  54.84 
 
 		 230 aa  234  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0257216  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1579  ABC transporter component  63.59 
 
 		 252 aa  232  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132522  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2195  ABC transporter related  54.63 
 
 		 232 aa  231  6e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0336091  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2429  ABC transporter related  56.13 
 
 		 232 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.506044  normal  0.0627468 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1863  ABC transporter, ATPase subunit  54.42 
 
 		 232 aa  229  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0577867  normal  0.0321889 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2599  ABC transporter related  53.7 
 
 		 232 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.215852  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2345  ABC transporter related  56.42 
 
 		 223 aa  229  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.144574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3274  ABC transporter related  53.49 
 
 		 232 aa  228  6e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991934  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2863  ABC transporter related  52.31 
 
 		 232 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.479401  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0941  ABC transporter related  57.34 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4529  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein lolD  53.49 
 
 		 233 aa  226  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.830407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1766  ABC transporter related  57.08 
 
 		 224 aa  221  7e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0656003  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  50.92 
 
 		 224 aa  218  5e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  52.75 
 
 		 223 aa  218  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  50.92 
 
 		 230 aa  218  5e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  51.38 
 
 		 224 aa  217  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  52.04 
 
 		 229 aa  216  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1473  ABC transporter, ATP-binding protein  49.54 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  51.38 
 
 		 224 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.32 
 
 		 253 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1445  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.16 
 
 		 247 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 239 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.23 
 
 		 253 aa  211  7e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.23 
 
 		 231 aa  211  9e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  48.4 
 
 		 227 aa  211  1e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  51.83 
 
 		 225 aa  210  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.37 
 
 		 238 aa  210  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0174  ABC transporter, ATP-binding protein  47.96 
 
 		 235 aa  211  1e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.926259  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.44 
 
 		 236 aa  210  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3478  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  47.25 
 
 		 258 aa  209  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.741929  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  49.77 
 
 		 230 aa  209  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  47.49 
 
 		 227 aa  209  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 253 aa  209  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  47.44 
 
 		 238 aa  208  4e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00596  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.24 
 
 		 236 aa  209  4e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820221  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1041  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.23 
 
 		 249 aa  208  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1057  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.66 
 
 		 242 aa  208  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0961  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.66 
 
 		 242 aa  208  5e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00749478  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  46.54 
 
 		 227 aa  208  6e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2397  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.38 
 
 		 232 aa  208  7e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.98 
 
 		 231 aa  207  7e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1118  lipoprotein releasing system ATP-binding ABC transporter  50.7 
 
 		 244 aa  207  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107348  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  47.89 
 
 		 242 aa  207  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01531  hypothetical protein  48.17 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  47.91 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2835  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.21843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.98 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  49.31 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1542  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.54 
 
 		 237 aa  206  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.91 
 
 		 233 aa  206  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4228  ABC transporter related  48.86 
 
 		 229 aa  206  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  0.619304 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2094  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.91 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0980636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0117  ABC transporter  44.8 
 
 		 226 aa  205  4e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.4 
 
 		 233 aa  205  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.85 
 
 		 227 aa  205  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  48.4 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.4 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  48.4 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.4 
 
 		 233 aa  205  6e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.91 
 
 		 233 aa  204  6e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.4 
 
 		 233 aa  205  6e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.4 
 
 		 233 aa  205  6e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1841  ABC transporter related  47.03 
 
 		 226 aa  204  6e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.656554  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.4 
 
 		 233 aa  205  6e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.4 
 
 		 233 aa  204  7e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3587  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 232 aa  204  8e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1810  putative ATP-binding component of ABC transporter  48.28 
 
 		 228 aa  204  8e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.512088  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 232 aa  204  9e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390667  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1567  ABC lipoprotein efflux pump, ATPase subunit  49.77 
 
 		 247 aa  203  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  47.25 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1696  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.32 
 
 		 232 aa  203  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0743106 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>