More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1579 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1579  ABC transporter component  100 
 
 		 252 aa  503  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132522  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1373  ABC transporter related  63.01 
 
 		 227 aa  278  8e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4146  ABC transporter related  61.78 
 
 		 234 aa  275  4e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4410  ABC transporter related  62.22 
 
 		 234 aa  275  6e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1281  ABC transporter related  63.47 
 
 		 227 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0118107  normal  0.276429 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2039  ABC transporter related  60.26 
 
 		 237 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3203  ABC transporter related  60.55 
 
 		 242 aa  273  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (lipoprotein)  63.01 
 
 		 229 aa  271  8.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00216433  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4461  ABC transporter related  60.43 
 
 		 247 aa  270  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.856819  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_004310  BR0824  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  60.73 
 
 		 227 aa  270  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.617096  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2403  ABC transporter related  60.73 
 
 		 227 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155422  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1042  ABC transporter related  59.82 
 
 		 229 aa  268  5.9999999999999995e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0818  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  60.27 
 
 		 227 aa  267  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0941  ABC transporter related  62.56 
 
 		 225 aa  267  1e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1194  ABC transporter related  65.32 
 
 		 236 aa  266  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1064  ABC transporter related  65.32 
 
 		 236 aa  266  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.608919  normal  0.101956 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1766  ABC transporter related  64.35 
 
 		 224 aa  266  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0656003  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0920  ABC transporter related  60.81 
 
 		 228 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0699  ABC transporter related  59.64 
 
 		 229 aa  263  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2810  ABC transporter related  59.19 
 
 		 230 aa  263  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0257216  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3345  ABC transporter related  62.56 
 
 		 237 aa  261  6.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0776  ABC lipoprotein efflux transporter, ATPase subunit, LolD  60.63 
 
 		 224 aa  261  8e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1795  ABC transporter related  61.82 
 
 		 229 aa  259  3e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.219829  normal  0.943815 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0999  ABC transporter related  63.51 
 
 		 236 aa  256  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.115476 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3274  ABC transporter related  55.51 
 
 		 232 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991934  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2599  ABC transporter related  56.39 
 
 		 232 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.215852  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2429  ABC transporter related  59.45 
 
 		 232 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.506044  normal  0.0627468 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1377  ABC transporter related  59.82 
 
 		 229 aa  255  4e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0531793  normal  0.0760119 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3315  ABC transporter related  56.83 
 
 		 227 aa  255  5e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.0682474 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2195  ABC transporter related  56.83 
 
 		 232 aa  255  6e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0336091  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0796  ABC transporter, ATP-binding protein  57.53 
 
 		 226 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.109288  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1863  ABC transporter, ATPase subunit  58.06 
 
 		 232 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0577867  normal  0.0321889 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4529  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein lolD  56.83 
 
 		 233 aa  252  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.830407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2863  ABC transporter related  54.19 
 
 		 232 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.479401  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2345  ABC transporter related  59.62 
 
 		 223 aa  248  8e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.144574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2432  ABC transporter related  60.18 
 
 		 224 aa  247  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.109204  normal  0.0982915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1176  ABC transporter related  56.76 
 
 		 225 aa  247  1e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1839  ABC transporter related  63.59 
 
 		 220 aa  244  8e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0748  ABC transporter related  57.6 
 
 		 227 aa  244  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0403  ABC transporter related  60.18 
 
 		 224 aa  241  6e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1845  ABC transporter related  57.52 
 
 		 227 aa  237  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141516  normal  0.653489 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.43 
 
 		 236 aa  226  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1034  ABC transporter related  52.51 
 
 		 232 aa  223  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  47.69 
 
 		 227 aa  221  8e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  48.15 
 
 		 227 aa  220  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.26 
 
 		 239 aa  219  3e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1542  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.55 
 
 		 237 aa  218  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 		 253 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  50.91 
 
 		 225 aa  216  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  46.98 
 
 		 238 aa  216  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  49.54 
 
 		 229 aa  216  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0086  ABC transporter related  53.1 
 
 		 231 aa  216  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0522946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.3 
 
 		 230 aa  214  7e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  49.18 
 
 		 246 aa  214  9e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.55 
 
 		 253 aa  214  9e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3478  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  48 
 
 		 258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.741929  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5400  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.14 
 
 		 238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0483  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  50.68 
 
 		 231 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0642  ABC transporter related  50.68 
 
 		 231 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1047  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  48.87 
 
 		 233 aa  213  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0939  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.87 
 
 		 233 aa  213  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  49.78 
 
 		 227 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.78 
 
 		 227 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  49.07 
 
 		 230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1251  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.83 
 
 		 238 aa  212  4.9999999999999996e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.06 
 
 		 238 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.42 
 
 		 231 aa  211  7e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.09 
 
 		 236 aa  211  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00596  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.73 
 
 		 236 aa  210  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820221  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0225  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.89 
 
 		 235 aa  210  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  46.85 
 
 		 646 aa  210  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1608  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.13 
 
 		 237 aa  210  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109115  normal  0.0760989 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3012  ABC transporter related  49.25 
 
 		 217 aa  209  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.134737 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  44.39 
 
 		 256 aa  209  3e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  49.76 
 
 		 224 aa  209  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  44.55 
 
 		 227 aa  209  4e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  47.95 
 
 		 224 aa  208  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  47.49 
 
 		 224 aa  208  8e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3699  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.93 
 
 		 230 aa  207  9e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752092 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14700  lipoprotein-releasing ABC transporter  49.78 
 
 		 232 aa  207  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.072484  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2835  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.18 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.21843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.54 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.91 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1695  ABC transporter, ATP-binding protein  51.18 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1473  ABC transporter, ATP-binding protein  46.76 
 
 		 228 aa  207  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3118  ABC transporter, ATP-binding protein  51.18 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1888  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.44 
 
 		 249 aa  206  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2200  ABC transporter, ATP-binding protein  51.18 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  51.18 
 
 		 249 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2638  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.18 
 
 		 249 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2583  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.18 
 
 		 249 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.484423  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  45.45 
 
 		 678 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44.14 
 
 		 649 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  45.45 
 
 		 678 aa  206  4e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11004  adhesion ABC transporter ATP-binding protein  46.3 
 
 		 237 aa  206  4e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.7798e-57  normal  0.515996 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  45.45 
 
 		 678 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.5 
 
 		 648 aa  205  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1118  lipoprotein releasing system ATP-binding ABC transporter  50 
 
 		 244 aa  205  6e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107348  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  47.2 
 
 		 235 aa  205  6e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>