More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4529 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4529  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein lolD  100 
 
 		 233 aa  471  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.830407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2599  ABC transporter related  87.45 
 
 		 232 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.215852  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2863  ABC transporter related  86.15 
 
 		 232 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.479401  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2195  ABC transporter related  85.28 
 
 		 232 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0336091  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1863  ABC transporter, ATPase subunit  84.42 
 
 		 232 aa  400  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0577867  normal  0.0321889 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3274  ABC transporter related  85.28 
 
 		 232 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991934  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2429  ABC transporter related  86.43 
 
 		 232 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.506044  normal  0.0627468 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2039  ABC transporter related  65.94 
 
 		 237 aa  314  7e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0699  ABC transporter related  69.64 
 
 		 229 aa  311  5.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1795  ABC transporter related  67.56 
 
 		 229 aa  308  4e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.219829  normal  0.943815 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4410  ABC transporter related  65.09 
 
 		 234 aa  304  9.000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4461  ABC transporter related  67.25 
 
 		 247 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.856819  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4146  ABC transporter related  65.52 
 
 		 234 aa  301  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1064  ABC transporter related  65.79 
 
 		 236 aa  293  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.608919  normal  0.101956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1194  ABC transporter related  65.79 
 
 		 236 aa  293  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0999  ABC transporter related  64.91 
 
 		 236 aa  286  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.115476 
 
 
-
 
NC_004310  BR0824  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  63.06 
 
 		 227 aa  280  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.617096  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1042  ABC transporter related  63.96 
 
 		 229 aa  280  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2403  ABC transporter related  61.71 
 
 		 227 aa  279  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155422  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (lipoprotein)  62.5 
 
 		 229 aa  278  4e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00216433  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0818  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  62.61 
 
 		 227 aa  278  8e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0920  ABC transporter related  64.84 
 
 		 228 aa  277  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1373  ABC transporter related  61.71 
 
 		 227 aa  270  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0796  ABC transporter, ATP-binding protein  59.91 
 
 		 226 aa  269  2e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.109288  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1281  ABC transporter related  61.71 
 
 		 227 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0118107  normal  0.276429 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3203  ABC transporter related  57.58 
 
 		 242 aa  259  4e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0776  ABC lipoprotein efflux transporter, ATPase subunit, LolD  57.92 
 
 		 224 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1377  ABC transporter related  58.64 
 
 		 229 aa  247  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0531793  normal  0.0760119 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2432  ABC transporter related  58.82 
 
 		 224 aa  246  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.109204  normal  0.0982915 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0748  ABC transporter related  56.5 
 
 		 227 aa  246  3e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1579  ABC transporter component  56.83 
 
 		 252 aa  239  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132522  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0403  ABC transporter related  58.37 
 
 		 224 aa  238  8e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0941  ABC transporter related  55.66 
 
 		 225 aa  235  4e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2810  ABC transporter related  52.94 
 
 		 230 aa  230  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0257216  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3345  ABC transporter related  56.5 
 
 		 237 aa  229  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1839  ABC transporter related  53.49 
 
 		 220 aa  226  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1845  ABC transporter related  56.48 
 
 		 227 aa  225  4e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141516  normal  0.653489 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3315  ABC transporter related  52.86 
 
 		 227 aa  224  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.0682474 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1888  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 		 249 aa  215  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1176  ABC transporter related  52.63 
 
 		 225 aa  215  5e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  50.23 
 
 		 224 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1766  ABC transporter related  52.56 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0656003  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  49.54 
 
 		 224 aa  211  4.9999999999999996e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 249 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2638  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 		 249 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2583  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 		 249 aa  211  7e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.484423  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1695  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 227 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3118  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 240 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2200  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 240 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1567  ABC lipoprotein efflux pump, ATPase subunit  48.62 
 
 		 247 aa  210  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.02 
 
 		 236 aa  210  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00596  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.85 
 
 		 236 aa  209  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820221  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2566  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.17 
 
 		 247 aa  208  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0799342  normal  0.05105 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1542  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.58 
 
 		 237 aa  206  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  44 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2345  ABC transporter related  49.32 
 
 		 223 aa  205  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.144574  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3478  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  44.75 
 
 		 258 aa  204  7e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.741929  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  49.3 
 
 		 225 aa  204  7e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1211  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.89 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  47.2 
 
 		 224 aa  202  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1905  ABC transporter  46.75 
 
 		 232 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.030671  hitchhiker  0.00477686 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.05 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2094  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.99 
 
 		 225 aa  203  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0980636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.39 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0349  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.74 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  44.34 
 
 		 238 aa  202  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.12 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1034  ABC transporter related  47.11 
 
 		 232 aa  201  6e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0385  ABC transporter ATP-binding protein  45.29 
 
 		 240 aa  201  7e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1015  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.44 
 
 		 224 aa  201  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.45 
 
 		 234 aa  201  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45 
 
 		 230 aa  201  8e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.58 
 
 		 233 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  45.09 
 
 		 227 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.58 
 
 		 233 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.45 
 
 		 234 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3231  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.18 
 
 		 258 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.15277  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.58 
 
 		 233 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.09 
 
 		 227 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.58 
 
 		 233 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.45 
 
 		 234 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  45.58 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5400  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.48 
 
 		 238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122098  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2110  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  47.32 
 
 		 227 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327519  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.04 
 
 		 227 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1445  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.51 
 
 		 247 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  45.58 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.58 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2754  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.92 
 
 		 226 aa  199  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2150  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.02 
 
 		 252 aa  199  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0659015  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2023  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.02 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3420  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.92 
 
 		 226 aa  199  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0399135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14700  lipoprotein-releasing ABC transporter  45.22 
 
 		 232 aa  199  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.072484  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.8 
 
 		 231 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3255  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.64 
 
 		 318 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1118  lipoprotein releasing system ATP-binding ABC transporter  46.95 
 
 		 244 aa  199  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107348  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  45.85 
 
 		 227 aa  198  5e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5964  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.53 
 
 		 253 aa  198  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115719  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2131  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.53 
 
 		 253 aa  198  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.099841  normal  0.052889 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2113  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.53 
 
 		 253 aa  198  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0436359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>