More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0748 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0748  ABC transporter related  100 
 
 		 227 aa  447  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0776  ABC lipoprotein efflux transporter, ATPase subunit, LolD  74.77 
 
 		 224 aa  324  7e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2432  ABC transporter related  74.77 
 
 		 224 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.109204  normal  0.0982915 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1839  ABC transporter related  70.37 
 
 		 220 aa  304  7e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3315  ABC transporter related  68.3 
 
 		 227 aa  303  1.0000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.0682474 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1845  ABC transporter related  69.47 
 
 		 227 aa  299  2e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141516  normal  0.653489 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0403  ABC transporter related  73.87 
 
 		 224 aa  293  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1377  ABC transporter related  65.33 
 
 		 229 aa  284  8e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0531793  normal  0.0760119 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4461  ABC transporter related  61.09 
 
 		 247 aa  261  6.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.856819  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1795  ABC transporter related  59.91 
 
 		 229 aa  259  3e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.219829  normal  0.943815 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2039  ABC transporter related  56.95 
 
 		 237 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1042  ABC transporter related  58.85 
 
 		 229 aa  257  9e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2599  ABC transporter related  57.85 
 
 		 232 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.215852  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0699  ABC transporter related  59.38 
 
 		 229 aa  257  1e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1863  ABC transporter, ATPase subunit  57.85 
 
 		 232 aa  254  6e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0577867  normal  0.0321889 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2195  ABC transporter related  57.85 
 
 		 232 aa  254  6e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0336091  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3203  ABC transporter related  57.78 
 
 		 242 aa  253  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4410  ABC transporter related  56.95 
 
 		 234 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1064  ABC transporter related  58.3 
 
 		 236 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.608919  normal  0.101956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1194  ABC transporter related  58.3 
 
 		 236 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2863  ABC transporter related  56.05 
 
 		 232 aa  252  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.479401  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1373  ABC transporter related  57.73 
 
 		 227 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1281  ABC transporter related  58.18 
 
 		 227 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0118107  normal  0.276429 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2429  ABC transporter related  57.53 
 
 		 232 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.506044  normal  0.0627468 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3274  ABC transporter related  55.16 
 
 		 232 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991934  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4146  ABC transporter related  56.5 
 
 		 234 aa  248  5e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0920  ABC transporter related  57.47 
 
 		 228 aa  247  8e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0999  ABC transporter related  58.3 
 
 		 236 aa  246  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.115476 
 
 
-
 
NC_004310  BR0824  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  57.47 
 
 		 227 aa  246  3e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.617096  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4529  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein lolD  56.5 
 
 		 233 aa  246  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.830407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2810  ABC transporter related  56.11 
 
 		 230 aa  243  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0257216  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2403  ABC transporter related  55.66 
 
 		 227 aa  244  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155422  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0818  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  57.01 
 
 		 227 aa  243  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (lipoprotein)  55.66 
 
 		 229 aa  243  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00216433  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0941  ABC transporter related  57.46 
 
 		 225 aa  239  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3345  ABC transporter related  58.8 
 
 		 237 aa  238  5e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2345  ABC transporter related  56.36 
 
 		 223 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.144574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0796  ABC transporter, ATP-binding protein  59.09 
 
 		 226 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.109288  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1579  ABC transporter component  57.6 
 
 		 252 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132522  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1766  ABC transporter related  56 
 
 		 224 aa  230  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0656003  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1176  ABC transporter related  53.15 
 
 		 225 aa  225  5.0000000000000005e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  51.35 
 
 		 227 aa  221  7e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.9 
 
 		 227 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1041  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.02 
 
 		 249 aa  218  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1118  lipoprotein releasing system ATP-binding ABC transporter  51.35 
 
 		 244 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107348  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1810  putative ATP-binding component of ABC transporter  48.23 
 
 		 228 aa  218  8.999999999999998e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.512088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  50.67 
 
 		 223 aa  217  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.58 
 
 		 231 aa  216  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  46.88 
 
 		 227 aa  216  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  47.75 
 
 		 238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3420  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.91 
 
 		 226 aa  215  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0399135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2754  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.91 
 
 		 226 aa  215  4e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  52.25 
 
 		 224 aa  215  5e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  46.88 
 
 		 227 aa  215  5e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2835  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.12 
 
 		 225 aa  214  5.9999999999999996e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.21843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  52.7 
 
 		 225 aa  214  9e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1057  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.55 
 
 		 242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0961  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.55 
 
 		 242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00749478  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.87 
 
 		 233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.68 
 
 		 236 aa  211  7e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48 
 
 		 233 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3699  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.79 
 
 		 230 aa  210  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752092 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  43.69 
 
 		 227 aa  211  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2131  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.88 
 
 		 253 aa  210  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.099841  normal  0.052889 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2397  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 		 232 aa  210  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5964  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.88 
 
 		 253 aa  210  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115719  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2113  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.88 
 
 		 253 aa  210  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0436359  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2023  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.88 
 
 		 231 aa  209  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1905  ABC transporter  50 
 
 		 232 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.030671  hitchhiker  0.00477686 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1888  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.79 
 
 		 249 aa  209  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2150  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.88 
 
 		 252 aa  209  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0659015  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1796  ABC transporter related protein  52.49 
 
 		 229 aa  209  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  48.64 
 
 		 230 aa  209  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.95 
 
 		 227 aa  209  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  48.2 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2638  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.34 
 
 		 249 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5419  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.44 
 
 		 252 aa  208  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.912303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  51.34 
 
 		 249 aa  209  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1608  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 		 237 aa  209  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109115  normal  0.0760989 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2200  ABC transporter, ATP-binding protein  51.34 
 
 		 240 aa  208  5e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3118  ABC transporter, ATP-binding protein  51.34 
 
 		 240 aa  208  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1157  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.88 
 
 		 252 aa  208  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.572225  normal  0.0166271 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  48.2 
 
 		 224 aa  208  6e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1467  ABC transporter related  50.89 
 
 		 232 aa  207  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3587  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.55 
 
 		 232 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2094  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.93 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0980636  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.55 
 
 		 232 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390667  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1695  ABC transporter, ATP-binding protein  51.61 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1077  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.67 
 
 		 244 aa  206  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0335181  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00596  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.67 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820221  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1473  ABC transporter, ATP-binding protein  46.76 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2583  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.89 
 
 		 249 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.484423  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48 
 
 		 253 aa  206  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  49.34 
 
 		 229 aa  206  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1696  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.09 
 
 		 232 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0743106 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2110  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  49.55 
 
 		 227 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327519  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1251  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.88 
 
 		 238 aa  206  3e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14700  lipoprotein-releasing ABC transporter  50 
 
 		 232 aa  206  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.072484  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3180  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.91 
 
 		 234 aa  205  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.32 
 
 		 239 aa  205  4e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>