More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1863 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1863  ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
232 aa  471  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0577867  normal  0.0321889 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2195  ABC transporter related  93.53 
 
 
232 aa  447  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0336091  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2599  ABC transporter related  86.21 
 
 
232 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.215852  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3274  ABC transporter related  84.05 
 
 
232 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991934  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4529  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein lolD  84.42 
 
 
233 aa  400  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.830407  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2863  ABC transporter related  83.19 
 
 
232 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.479401  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2429  ABC transporter related  85.52 
 
 
232 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.506044  normal  0.0627468 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1795  ABC transporter related  67.41 
 
 
229 aa  308  4e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.219829  normal  0.943815 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2039  ABC transporter related  62.88 
 
 
237 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0699  ABC transporter related  66.96 
 
 
229 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4461  ABC transporter related  66.38 
 
 
247 aa  302  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.856819  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1064  ABC transporter related  65.35 
 
 
236 aa  301  6.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.608919  normal  0.101956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1194  ABC transporter related  65.35 
 
 
236 aa  301  6.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4146  ABC transporter related  63.16 
 
 
234 aa  299  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4410  ABC transporter related  63.56 
 
 
234 aa  299  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0999  ABC transporter related  65.35 
 
 
236 aa  297  7e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.115476 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1042  ABC transporter related  63.39 
 
 
229 aa  281  6.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0920  ABC transporter related  63.93 
 
 
228 aa  281  7.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0824  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  63.93 
 
 
227 aa  280  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.617096  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0818  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  63.47 
 
 
227 aa  278  6e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2403  ABC transporter related  62.1 
 
 
227 aa  277  8e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155422  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (lipoprotein)  61.33 
 
 
229 aa  277  9e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00216433  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1373  ABC transporter related  60.62 
 
 
227 aa  276  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1281  ABC transporter related  60.62 
 
 
227 aa  274  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0118107  normal  0.276429 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0796  ABC transporter, ATP-binding protein  60.27 
 
 
226 aa  264  8.999999999999999e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.109288  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3203  ABC transporter related  57.21 
 
 
242 aa  258  6e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0748  ABC transporter related  57.85 
 
 
227 aa  254  6e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0776  ABC lipoprotein efflux transporter, ATPase subunit, LolD  58.64 
 
 
224 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1377  ABC transporter related  59.26 
 
 
229 aa  248  5e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0531793  normal  0.0760119 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2432  ABC transporter related  59.55 
 
 
224 aa  248  8e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.109204  normal  0.0982915 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1579  ABC transporter component  58.06 
 
 
252 aa  240  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132522  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0403  ABC transporter related  59.09 
 
 
224 aa  239  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0941  ABC transporter related  58.14 
 
 
225 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3315  ABC transporter related  53.39 
 
 
227 aa  237  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.0682474 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1845  ABC transporter related  57.66 
 
 
227 aa  236  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141516  normal  0.653489 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2810  ABC transporter related  52.25 
 
 
230 aa  234  6e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0257216  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3345  ABC transporter related  57.01 
 
 
237 aa  233  1.0000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1839  ABC transporter related  54.42 
 
 
220 aa  229  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1176  ABC transporter related  51.39 
 
 
225 aa  216  4e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495851  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48 
 
 
236 aa  214  7e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  50.7 
 
 
225 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  45.74 
 
 
227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  49.07 
 
 
224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00596  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.45 
 
 
236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820221  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  49.07 
 
 
224 aa  211  4.9999999999999996e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  48.61 
 
 
224 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1810  putative ATP-binding component of ABC transporter  45.66 
 
 
228 aa  210  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.512088  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1034  ABC transporter related  49.12 
 
 
232 aa  210  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1766  ABC transporter related  51.83 
 
 
224 aa  210  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0656003  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.91 
 
 
234 aa  208  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.91 
 
 
234 aa  208  6e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0349  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.74 
 
 
240 aa  206  3e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.45 
 
 
234 aa  205  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.79 
 
 
234 aa  205  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2094  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.53 
 
 
225 aa  205  4e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0980636  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.26 
 
 
233 aa  205  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.26 
 
 
233 aa  205  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.26 
 
 
233 aa  205  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.26 
 
 
233 aa  205  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.26 
 
 
233 aa  205  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.37 
 
 
231 aa  204  7e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2345  ABC transporter related  50.23 
 
 
223 aa  204  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.144574  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1542  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.87 
 
 
237 aa  204  7e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  0.32706 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  45.79 
 
 
233 aa  204  9e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.75 
 
 
227 aa  204  9e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.79 
 
 
233 aa  204  9e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  45.79 
 
 
233 aa  204  9e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3478  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  46.48 
 
 
258 aa  204  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.741929  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  45.45 
 
 
227 aa  203  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0385  ABC transporter ATP-binding protein  45.29 
 
 
240 aa  204  1e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  44.59 
 
 
238 aa  204  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.65 
 
 
238 aa  204  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.33 
 
 
233 aa  203  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.33 
 
 
233 aa  203  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.33 
 
 
233 aa  203  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.33 
 
 
233 aa  203  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  45.79 
 
 
223 aa  202  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1888  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.89 
 
 
249 aa  202  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.64 
 
 
230 aa  202  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  44.98 
 
 
227 aa  202  4e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.07 
 
 
253 aa  202  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.33 
 
 
233 aa  201  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.07 
 
 
253 aa  202  5e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  47.39 
 
 
249 aa  201  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2638  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.39 
 
 
249 aa  201  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2583  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.39 
 
 
249 aa  201  6e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.484423  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1251  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.34 
 
 
238 aa  201  7e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.33 
 
 
233 aa  201  8e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2200  ABC transporter, ATP-binding protein  47.39 
 
 
240 aa  201  8e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3118  ABC transporter, ATP-binding protein  47.39 
 
 
240 aa  201  8e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1695  ABC transporter, ATP-binding protein  47.39 
 
 
227 aa  201  9e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2023  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.82 
 
 
231 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1041  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.15 
 
 
249 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  46.51 
 
 
227 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.39 
 
 
233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0961  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.48 
 
 
242 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00749478  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  46.73 
 
 
223 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.6 
 
 
253 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2150  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.82 
 
 
252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0659015  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2566  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.34 
 
 
247 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0799342  normal  0.05105 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>