More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4461 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4461  ABC transporter related  100 
 
 		 247 aa  490  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.856819  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3274  ABC transporter related  69.43 
 
 		 232 aa  319  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991934  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2863  ABC transporter related  68.56 
 
 		 232 aa  318  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.479401  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2039  ABC transporter related  69.3 
 
 		 237 aa  316  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0699  ABC transporter related  68.89 
 
 		 229 aa  314  8e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2599  ABC transporter related  71.23 
 
 		 232 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.215852  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1795  ABC transporter related  69.51 
 
 		 229 aa  313  1.9999999999999998e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.219829  normal  0.943815 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4146  ABC transporter related  67.83 
 
 		 234 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2429  ABC transporter related  70.32 
 
 		 232 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.506044  normal  0.0627468 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2195  ABC transporter related  68.56 
 
 		 232 aa  310  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0336091  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4410  ABC transporter related  68.44 
 
 		 234 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4529  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein lolD  67.25 
 
 		 233 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.830407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1863  ABC transporter, ATPase subunit  66.38 
 
 		 232 aa  302  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0577867  normal  0.0321889 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1064  ABC transporter related  69 
 
 		 236 aa  300  1e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.608919  normal  0.101956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1194  ABC transporter related  69 
 
 		 236 aa  300  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1373  ABC transporter related  66.82 
 
 		 227 aa  297  9e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0999  ABC transporter related  69 
 
 		 236 aa  296  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.115476 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1042  ABC transporter related  66.22 
 
 		 229 aa  296  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2403  ABC transporter related  65.02 
 
 		 227 aa  295  5e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155422  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1281  ABC transporter related  66.37 
 
 		 227 aa  293  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0118107  normal  0.276429 
 
 
-
 
NC_004310  BR0824  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  63.68 
 
 		 227 aa  288  4e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.617096  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0818  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  63.23 
 
 		 227 aa  286  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0920  ABC transporter related  64.13 
 
 		 228 aa  286  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0776  ABC lipoprotein efflux transporter, ATPase subunit, LolD  65.45 
 
 		 224 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (lipoprotein)  62.9 
 
 		 229 aa  275  5e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00216433  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2810  ABC transporter related  59.64 
 
 		 230 aa  262  4e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0257216  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0748  ABC transporter related  61.09 
 
 		 227 aa  261  8e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0796  ABC transporter, ATP-binding protein  60.09 
 
 		 226 aa  260  1e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.109288  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3203  ABC transporter related  60.45 
 
 		 242 aa  261  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2432  ABC transporter related  64.55 
 
 		 224 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.109204  normal  0.0982915 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1579  ABC transporter component  60.43 
 
 		 252 aa  259  3e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132522  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1377  ABC transporter related  60.63 
 
 		 229 aa  256  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0531793  normal  0.0760119 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0941  ABC transporter related  60.91 
 
 		 225 aa  255  4e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0403  ABC transporter related  64.55 
 
 		 224 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3315  ABC transporter related  58.56 
 
 		 227 aa  249  2e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.0682474 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3345  ABC transporter related  60 
 
 		 237 aa  248  8e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1845  ABC transporter related  60.09 
 
 		 227 aa  245  4e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141516  normal  0.653489 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1176  ABC transporter related  56.88 
 
 		 225 aa  243  3e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1839  ABC transporter related  57.94 
 
 		 220 aa  237  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  52.27 
 
 		 224 aa  232  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  51.36 
 
 		 224 aa  231  6e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  51.13 
 
 		 233 aa  231  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  51.58 
 
 		 233 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  51.58 
 
 		 233 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  51.58 
 
 		 233 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  51.58 
 
 		 233 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  51.58 
 
 		 233 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.68 
 
 		 233 aa  228  6e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50.68 
 
 		 233 aa  228  6e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50.68 
 
 		 233 aa  228  6e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50.68 
 
 		 233 aa  228  6e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2345  ABC transporter related  56.42 
 
 		 223 aa  228  8e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.144574  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  50.68 
 
 		 233 aa  228  9e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50.68 
 
 		 233 aa  228  9e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  50.68 
 
 		 233 aa  228  9e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50.23 
 
 		 233 aa  226  4e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2784  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  51.83 
 
 		 235 aa  225  6e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0359571  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1766  ABC transporter related  59.33 
 
 		 224 aa  224  7e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0656003  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.45 
 
 		 233 aa  224  7e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  48.4 
 
 		 238 aa  224  1e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  50.43 
 
 		 249 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2638  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.43 
 
 		 249 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3118  ABC transporter, ATP-binding protein  50.43 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.1 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1041  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.97 
 
 		 249 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2200  ABC transporter, ATP-binding protein  50.43 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 		 239 aa  223  3e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  53.42 
 
 		 225 aa  222  4e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  51.83 
 
 		 224 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.39 
 
 		 231 aa  221  8e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2476  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  51.38 
 
 		 235 aa  221  8e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  51.38 
 
 		 234 aa  221  9e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1695  ABC transporter, ATP-binding protein  52.31 
 
 		 227 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  51.38 
 
 		 234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1077  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.75 
 
 		 244 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0335181  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1888  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.66 
 
 		 249 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  51.38 
 
 		 234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 		 231 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2583  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.36 
 
 		 249 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.484423  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.32 
 
 		 233 aa  218  5e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  51.17 
 
 		 223 aa  218  6e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.55 
 
 		 253 aa  218  6e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1118  lipoprotein releasing system ATP-binding ABC transporter  51.87 
 
 		 244 aa  218  7e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107348  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.55 
 
 		 253 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.54 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1057  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.4 
 
 		 242 aa  217  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0961  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.4 
 
 		 242 aa  217  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00749478  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.55 
 
 		 253 aa  217  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  50.46 
 
 		 230 aa  217  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  50.46 
 
 		 229 aa  216  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1473  ABC transporter, ATP-binding protein  48.15 
 
 		 228 aa  215  4e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.73 
 
 		 236 aa  215  4e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  47.42 
 
 		 227 aa  215  5e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1649  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  51.17 
 
 		 235 aa  215  5e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1251  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.08 
 
 		 238 aa  215  7e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50 
 
 		 234 aa  214  9e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3231  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.09 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.15277  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2094  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  54.95 
 
 		 225 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0980636  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  46.95 
 
 		 227 aa  212  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0943  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.83 
 
 		 227 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>