More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0961 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_0961  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  100 
 
 
242 aa  485  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00749478  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1057  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  99.59 
 
 
242 aa  482  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1118  lipoprotein releasing system ATP-binding ABC transporter  89.75 
 
 
244 aa  432  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107348  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1077  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  77.87 
 
 
244 aa  371  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0335181  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1041  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  78.35 
 
 
249 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2131  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  74.67 
 
 
253 aa  342  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.099841  normal  0.052889 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5964  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  74.67 
 
 
253 aa  342  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115719  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2150  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  75.11 
 
 
252 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0659015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2113  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  74.67 
 
 
253 aa  342  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0436359  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2023  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  76 
 
 
231 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5419  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  74.24 
 
 
252 aa  340  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.912303  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1157  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  72.53 
 
 
252 aa  339  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.572225  normal  0.0166271 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2566  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  72.22 
 
 
247 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0799342  normal  0.05105 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1888  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  73.91 
 
 
249 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2583  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  75.23 
 
 
249 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.484423  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1567  ABC lipoprotein efflux pump, ATPase subunit  72.22 
 
 
247 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  74.77 
 
 
249 aa  332  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2638  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  74.77 
 
 
249 aa  332  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3118  ABC transporter, ATP-binding protein  74.77 
 
 
240 aa  332  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2200  ABC transporter, ATP-binding protein  74.77 
 
 
240 aa  332  4e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1695  ABC transporter, ATP-binding protein  74.32 
 
 
227 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1445  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  70.21 
 
 
247 aa  327  7e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303456  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5400  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  65.47 
 
 
238 aa  281  5.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122098  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2397  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  63.96 
 
 
232 aa  279  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3699  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  66.21 
 
 
230 aa  276  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.752092 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3420  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  64.84 
 
 
226 aa  276  3e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0399135  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2754  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  64.84 
 
 
226 aa  276  3e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1211  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  63.93 
 
 
225 aa  274  8e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1015  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  63.35 
 
 
224 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1760  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  66.36 
 
 
226 aa  272  3e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.585377  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3180  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  64.84 
 
 
234 aa  272  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269698  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1987  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  66.21 
 
 
233 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.43138  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  58.85 
 
 
236 aa  271  5.000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3231  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  63.84 
 
 
258 aa  271  6e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.15277  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  62.56 
 
 
225 aa  270  1e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711904  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2094  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  61.36 
 
 
225 aa  270  1e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0980636  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1173  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  57.99 
 
 
230 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.659944  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  59.55 
 
 
227 aa  268  5e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  62.1 
 
 
227 aa  267  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  58.64 
 
 
227 aa  266  2e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  61.64 
 
 
227 aa  265  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1542  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  60 
 
 
237 aa  265  5e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1467  ABC transporter related  60.73 
 
 
232 aa  265  5.999999999999999e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2747  putative lipoprotein releasing system ATP-binding ABC transporter  61.74 
 
 
233 aa  264  8.999999999999999e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.650298  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00596  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  57.33 
 
 
236 aa  262  3e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820221  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2835  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  60.27 
 
 
225 aa  261  4.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.21843  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2784  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  58.56 
 
 
235 aa  261  6.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0359571  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2670  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  58.67 
 
 
233 aa  261  1e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0490  ABC transporter related  59.82 
 
 
241 aa  260  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  58.56 
 
 
230 aa  259  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3255  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  61.4 
 
 
318 aa  259  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1810  putative ATP-binding component of ABC transporter  55.86 
 
 
228 aa  258  8e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.512088  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  55.25 
 
 
231 aa  257  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14700  lipoprotein-releasing ABC transporter  59.19 
 
 
232 aa  256  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.072484  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1200  ABC transporter related protein  58.56 
 
 
237 aa  256  2e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.105172 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2476  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  57.66 
 
 
235 aa  256  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  55.61 
 
 
231 aa  256  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1047  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  56.95 
 
 
233 aa  256  3e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1251  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  59.82 
 
 
238 aa  256  3e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0939  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  56.95 
 
 
233 aa  256  3e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  56.31 
 
 
234 aa  255  5e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.81 
 
 
236 aa  254  7e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3858  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  57.21 
 
 
232 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.72 
 
 
238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1473  ABC transporter, ATP-binding protein  56.62 
 
 
228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2625  lipoprotein ABC transporter, ATP-binding protein LolD  62.56 
 
 
224 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  56.16 
 
 
235 aa  252  4.0000000000000004e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  56.76 
 
 
233 aa  251  6e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  54.26 
 
 
253 aa  251  6e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3587  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  57.99 
 
 
232 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1649  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  56.31 
 
 
235 aa  251  9.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1608  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  56.71 
 
 
237 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109115  normal  0.0760989 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  57.99 
 
 
232 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390667  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1905  ABC transporter  58.9 
 
 
232 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.030671  hitchhiker  0.00477686 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0782  ABC lipoprotein exporter, ATPase subunit, LolD  56.82 
 
 
226 aa  250  1e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000690329  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  56.76 
 
 
233 aa  250  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  54.26 
 
 
253 aa  250  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1672  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  57.99 
 
 
232 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.50356  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1696  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  57.53 
 
 
232 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0743106 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2110  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  59.36 
 
 
227 aa  249  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327519  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  55.61 
 
 
238 aa  250  2e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  56.31 
 
 
233 aa  249  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  54.26 
 
 
230 aa  249  3e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0225  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  57.33 
 
 
235 aa  249  3e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  56.31 
 
 
233 aa  249  4e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  56.31 
 
 
233 aa  249  4e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  56.31 
 
 
233 aa  249  4e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.81 
 
 
253 aa  248  4e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  55.86 
 
 
229 aa  249  4e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  56.31 
 
 
233 aa  249  4e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  56.31 
 
 
233 aa  248  5e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  56.31 
 
 
233 aa  248  5e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0788  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  56.82 
 
 
226 aa  248  5e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00288546  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  56.31 
 
 
233 aa  248  5e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  56.76 
 
 
233 aa  248  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01531  hypothetical protein  55.71 
 
 
235 aa  248  6e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0349  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  55.65 
 
 
240 aa  248  6e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  56.76 
 
 
233 aa  248  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  56.76 
 
 
233 aa  248  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  56.76 
 
 
233 aa  248  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>