More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1766 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1766  ABC transporter related  100 
 
 		 224 aa  438  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0656003  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1176  ABC transporter related  72.32 
 
 		 225 aa  321  7e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2345  ABC transporter related  75.89 
 
 		 223 aa  320  9.999999999999999e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.144574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1579  ABC transporter component  64.35 
 
 		 252 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132522  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3345  ABC transporter related  61.54 
 
 		 237 aa  243  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1377  ABC transporter related  57.4 
 
 		 229 aa  241  3.9999999999999997e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0531793  normal  0.0760119 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2810  ABC transporter related  54.75 
 
 		 230 aa  241  7.999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0257216  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3203  ABC transporter related  54.95 
 
 		 242 aa  241  7.999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0941  ABC transporter related  58.45 
 
 		 225 aa  241  7.999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4146  ABC transporter related  55.91 
 
 		 234 aa  239  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0748  ABC transporter related  56 
 
 		 227 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4461  ABC transporter related  59.33 
 
 		 247 aa  238  6.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.856819  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3315  ABC transporter related  55.8 
 
 		 227 aa  237  9e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.0682474 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2039  ABC transporter related  55 
 
 		 237 aa  237  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4410  ABC transporter related  55.45 
 
 		 234 aa  234  9e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1194  ABC transporter related  58.37 
 
 		 236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1064  ABC transporter related  58.37 
 
 		 236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.608919  normal  0.101956 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1839  ABC transporter related  57.08 
 
 		 220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1042  ABC transporter related  53.85 
 
 		 229 aa  232  4.0000000000000004e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  50.67 
 
 		 227 aa  231  6e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0699  ABC transporter related  52.27 
 
 		 229 aa  231  6e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3274  ABC transporter related  53.18 
 
 		 232 aa  231  6e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991934  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  51.12 
 
 		 227 aa  230  1e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (lipoprotein)  52.27 
 
 		 229 aa  229  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00216433  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1845  ABC transporter related  56.25 
 
 		 227 aa  229  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141516  normal  0.653489 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1795  ABC transporter related  52.91 
 
 		 229 aa  229  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.219829  normal  0.943815 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2599  ABC transporter related  52.27 
 
 		 232 aa  228  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.215852  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2863  ABC transporter related  51.36 
 
 		 232 aa  228  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.479401  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0999  ABC transporter related  57.92 
 
 		 236 aa  228  5e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.115476 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2195  ABC transporter related  54.13 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0336091  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0824  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  53 
 
 		 227 aa  224  8e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.617096  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2403  ABC transporter related  52.07 
 
 		 227 aa  224  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155422  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4529  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein lolD  52.56 
 
 		 233 aa  222  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.830407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1373  ABC transporter related  52.53 
 
 		 227 aa  222  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0818  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  52.53 
 
 		 227 aa  222  4e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0776  ABC lipoprotein efflux transporter, ATPase subunit, LolD  58 
 
 		 224 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1863  ABC transporter, ATPase subunit  51.83 
 
 		 232 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0577867  normal  0.0321889 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1281  ABC transporter related  52.07 
 
 		 227 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0118107  normal  0.276429 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0920  ABC transporter related  51.85 
 
 		 228 aa  219  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2429  ABC transporter related  51.39 
 
 		 232 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.506044  normal  0.0627468 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0796  ABC transporter, ATP-binding protein  51.4 
 
 		 226 aa  218  7e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.109288  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  45.7 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1473  ABC transporter, ATP-binding protein  46.61 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01531  hypothetical protein  47.06 
 
 		 235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5400  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.68 
 
 		 238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  46.15 
 
 		 235 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.42 
 
 		 230 aa  213  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  51.34 
 
 		 227 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.53 
 
 		 234 aa  212  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.64 
 
 		 227 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00596  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.86 
 
 		 236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820221  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.89 
 
 		 227 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  45.87 
 
 		 227 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  44.64 
 
 		 230 aa  212  4.9999999999999996e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  47.93 
 
 		 256 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3699  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.55 
 
 		 230 aa  211  7e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752092 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2835  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.98 
 
 		 225 aa  210  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.21843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.09 
 
 		 234 aa  210  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2432  ABC transporter related  54.5 
 
 		 224 aa  210  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.109204  normal  0.0982915 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.09 
 
 		 234 aa  210  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 224 aa  210  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0086  ABC transporter related  52.7 
 
 		 231 aa  209  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0522946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3012  ABC transporter related  46.58 
 
 		 217 aa  209  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.134737 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1211  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.98 
 
 		 225 aa  209  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.98 
 
 		 253 aa  209  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1649  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.64 
 
 		 235 aa  208  5e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.82 
 
 		 234 aa  208  6e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0349  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.98 
 
 		 240 aa  208  6e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  45.54 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1542  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.55 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.49 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  51.17 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3231  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.43 
 
 		 258 aa  206  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.15277  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0385  ABC transporter ATP-binding protein  47.53 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.54 
 
 		 253 aa  206  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3180  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.4 
 
 		 234 aa  206  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1810  putative ATP-binding component of ABC transporter  46.19 
 
 		 228 aa  206  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.512088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2754  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.86 
 
 		 226 aa  205  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3420  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.86 
 
 		 226 aa  205  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0399135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  46.54 
 
 		 223 aa  205  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.43 
 
 		 233 aa  204  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.43 
 
 		 233 aa  204  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.43 
 
 		 233 aa  204  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.43 
 
 		 233 aa  204  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.43 
 
 		 233 aa  204  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.09 
 
 		 253 aa  204  8e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.66 
 
 		 238 aa  204  8e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.39 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2147  ABC transporter related  45.66 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.352493 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.17 
 
 		 236 aa  204  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  47.09 
 
 		 233 aa  202  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  47.09 
 
 		 233 aa  202  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.09 
 
 		 233 aa  202  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.09 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.09 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.09 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.09 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.09 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.09 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>