More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2863 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2863  ABC transporter related  100 
 
 		 232 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.479401  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2599  ABC transporter related  94.83 
 
 		 232 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.215852  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3274  ABC transporter related  93.1 
 
 		 232 aa  448  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991934  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2429  ABC transporter related  88.69 
 
 		 232 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.506044  normal  0.0627468 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2195  ABC transporter related  84.48 
 
 		 232 aa  409  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0336091  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4529  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein lolD  86.15 
 
 		 233 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.830407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1863  ABC transporter, ATPase subunit  83.19 
 
 		 232 aa  402  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0577867  normal  0.0321889 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4461  ABC transporter related  68.56 
 
 		 247 aa  318  3.9999999999999996e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.856819  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0699  ABC transporter related  67.86 
 
 		 229 aa  317  1e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1795  ABC transporter related  68.61 
 
 		 229 aa  315  3e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.219829  normal  0.943815 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2039  ABC transporter related  64.19 
 
 		 237 aa  315  3e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4146  ABC transporter related  64.04 
 
 		 234 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4410  ABC transporter related  63.44 
 
 		 234 aa  308  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1064  ABC transporter related  64.47 
 
 		 236 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.608919  normal  0.101956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1194  ABC transporter related  64.47 
 
 		 236 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0999  ABC transporter related  64.47 
 
 		 236 aa  297  7e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.115476 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0920  ABC transporter related  65.75 
 
 		 228 aa  293  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1042  ABC transporter related  65.32 
 
 		 229 aa  289  3e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1373  ABC transporter related  63.06 
 
 		 227 aa  285  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1281  ABC transporter related  63.51 
 
 		 227 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0118107  normal  0.276429 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2403  ABC transporter related  60.81 
 
 		 227 aa  281  6.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155422  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (lipoprotein)  61.61 
 
 		 229 aa  280  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00216433  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0824  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  61.26 
 
 		 227 aa  280  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.617096  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0818  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  60.81 
 
 		 227 aa  277  1e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3203  ABC transporter related  59.01 
 
 		 242 aa  266  2.9999999999999995e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0796  ABC transporter, ATP-binding protein  59.01 
 
 		 226 aa  261  6e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.109288  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1377  ABC transporter related  60.83 
 
 		 229 aa  256  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0531793  normal  0.0760119 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0748  ABC transporter related  56.05 
 
 		 227 aa  252  3e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0776  ABC lipoprotein efflux transporter, ATPase subunit, LolD  55.2 
 
 		 224 aa  248  5e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2432  ABC transporter related  56.11 
 
 		 224 aa  240  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.109204  normal  0.0982915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2810  ABC transporter related  52.49 
 
 		 230 aa  238  8e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0257216  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1579  ABC transporter component  54.19 
 
 		 252 aa  237  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132522  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3315  ABC transporter related  52.73 
 
 		 227 aa  237  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.0682474 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3345  ABC transporter related  57.4 
 
 		 237 aa  237  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0941  ABC transporter related  55.66 
 
 		 225 aa  235  5.0000000000000005e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0403  ABC transporter related  55.66 
 
 		 224 aa  231  9e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1845  ABC transporter related  55.56 
 
 		 227 aa  229  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141516  normal  0.653489 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1839  ABC transporter related  52.31 
 
 		 220 aa  227  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  51.85 
 
 		 224 aa  226  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1176  ABC transporter related  51.6 
 
 		 225 aa  224  8e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.79 
 
 		 236 aa  224  9e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  51.39 
 
 		 224 aa  223  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1766  ABC transporter related  51.36 
 
 		 224 aa  219  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0656003  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2094  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 		 225 aa  218  6e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0980636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  50.7 
 
 		 225 aa  215  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1034  ABC transporter related  48.2 
 
 		 232 aa  214  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  49.07 
 
 		 224 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.54 
 
 		 239 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.16 
 
 		 238 aa  210  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.54 
 
 		 231 aa  211  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1810  putative ATP-binding component of ABC transporter  44.55 
 
 		 228 aa  209  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.512088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.21 
 
 		 231 aa  210  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1251  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.4 
 
 		 238 aa  210  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2345  ABC transporter related  49.77 
 
 		 223 aa  209  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.144574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  44.84 
 
 		 227 aa  209  4e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  49.32 
 
 		 223 aa  208  5e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  45.29 
 
 		 227 aa  208  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.29 
 
 		 227 aa  208  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1905  ABC transporter  46.72 
 
 		 232 aa  208  6e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.030671  hitchhiker  0.00477686 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  45.7 
 
 		 238 aa  208  7e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2361  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.5 
 
 		 227 aa  207  9e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0014315  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.17 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.16 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.17 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.17 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1041  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.25 
 
 		 249 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.17 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.17 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14700  lipoprotein-releasing ABC transporter  46.43 
 
 		 232 aa  206  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.072484  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1888  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.7 
 
 		 249 aa  206  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.7 
 
 		 233 aa  206  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  47.22 
 
 		 235 aa  206  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00596  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.5 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820221  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  46.7 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.7 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.7 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0961  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47 
 
 		 242 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00749478  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.7 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0385  ABC transporter ATP-binding protein  44.84 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1057  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47 
 
 		 242 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.7 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0943  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.99 
 
 		 227 aa  206  3e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  46.7 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.7 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.87 
 
 		 234 aa  205  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.95 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1118  lipoprotein releasing system ATP-binding ABC transporter  46.36 
 
 		 244 aa  204  7e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107348  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1077  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.71 
 
 		 244 aa  204  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0335181  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3016  ABC transporter related  50 
 
 		 227 aa  204  7e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1567  ABC lipoprotein efflux pump, ATPase subunit  46.29 
 
 		 247 aa  204  8e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2583  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.98 
 
 		 249 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.484423  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  45.07 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2200  ABC transporter, ATP-binding protein  46.98 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3118  ABC transporter, ATP-binding protein  46.98 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1695  ABC transporter, ATP-binding protein  46.98 
 
 		 227 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  46.98 
 
 		 249 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2638  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.98 
 
 		 249 aa  203  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0349  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.39 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3478  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  45.62 
 
 		 258 aa  203  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.741929  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.6 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>