More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0699 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0699  ABC transporter related  100 
 
 		 229 aa  462  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1795  ABC transporter related  76.75 
 
 		 229 aa  353  2e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.219829  normal  0.943815 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2039  ABC transporter related  70.8 
 
 		 237 aa  330  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4146  ABC transporter related  68.75 
 
 		 234 aa  317  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2863  ABC transporter related  67.86 
 
 		 232 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.479401  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4410  ABC transporter related  68.3 
 
 		 234 aa  317  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3274  ABC transporter related  68.75 
 
 		 232 aa  315  5e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991934  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2429  ABC transporter related  70.59 
 
 		 232 aa  314  6e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.506044  normal  0.0627468 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4461  ABC transporter related  68.89 
 
 		 247 aa  314  7e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.856819  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2599  ABC transporter related  68.75 
 
 		 232 aa  314  8e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.215852  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4529  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein lolD  69.64 
 
 		 233 aa  311  4.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.830407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2195  ABC transporter related  67.86 
 
 		 232 aa  309  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0336091  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1863  ABC transporter, ATPase subunit  66.96 
 
 		 232 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0577867  normal  0.0321889 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0999  ABC transporter related  69.33 
 
 		 236 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.115476 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1194  ABC transporter related  68.58 
 
 		 236 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1064  ABC transporter related  68.58 
 
 		 236 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.608919  normal  0.101956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1373  ABC transporter related  66.97 
 
 		 227 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1042  ABC transporter related  67.11 
 
 		 229 aa  302  3.0000000000000004e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1281  ABC transporter related  66.52 
 
 		 227 aa  299  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0118107  normal  0.276429 
 
 
-
 
NC_004310  BR0824  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  66.52 
 
 		 227 aa  293  1e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.617096  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0920  ABC transporter related  65.77 
 
 		 228 aa  292  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2403  ABC transporter related  64.25 
 
 		 227 aa  291  4e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155422  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0818  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  66.06 
 
 		 227 aa  291  8e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (lipoprotein)  62.95 
 
 		 229 aa  285  2.9999999999999996e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00216433  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0796  ABC transporter, ATP-binding protein  61.54 
 
 		 226 aa  276  3e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.109288  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3203  ABC transporter related  60.79 
 
 		 242 aa  268  4e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0941  ABC transporter related  60 
 
 		 225 aa  258  5.0000000000000005e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0748  ABC transporter related  59.38 
 
 		 227 aa  257  1e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1579  ABC transporter component  59.64 
 
 		 252 aa  255  5e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132522  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1377  ABC transporter related  60.27 
 
 		 229 aa  255  5e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0531793  normal  0.0760119 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2810  ABC transporter related  55.75 
 
 		 230 aa  253  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0257216  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1839  ABC transporter related  60.28 
 
 		 220 aa  248  8e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0776  ABC lipoprotein efflux transporter, ATPase subunit, LolD  57.92 
 
 		 224 aa  247  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3315  ABC transporter related  56.11 
 
 		 227 aa  242  3.9999999999999997e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.0682474 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2432  ABC transporter related  57.92 
 
 		 224 aa  239  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.109204  normal  0.0982915 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3345  ABC transporter related  58.82 
 
 		 237 aa  238  5e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1845  ABC transporter related  59.46 
 
 		 227 aa  237  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141516  normal  0.653489 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  52.27 
 
 		 224 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  51.36 
 
 		 224 aa  228  6e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0403  ABC transporter related  57.92 
 
 		 224 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1766  ABC transporter related  52.27 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0656003  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1041  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.55 
 
 		 249 aa  218  7e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1176  ABC transporter related  51.85 
 
 		 225 aa  214  5.9999999999999996e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1649  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.09 
 
 		 235 aa  213  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.21 
 
 		 233 aa  212  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  44.8 
 
 		 238 aa  212  3.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1057  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.84 
 
 		 242 aa  211  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0961  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.84 
 
 		 242 aa  211  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00749478  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2345  ABC transporter related  51.38 
 
 		 223 aa  211  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.144574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1077  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.09 
 
 		 244 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0335181  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.09 
 
 		 238 aa  210  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1118  lipoprotein releasing system ATP-binding ABC transporter  48.17 
 
 		 244 aa  209  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107348  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  44.84 
 
 		 227 aa  210  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  46.82 
 
 		 235 aa  209  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2784  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.87 
 
 		 235 aa  209  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0359571  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  49.54 
 
 		 223 aa  208  5e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00596  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.62 
 
 		 236 aa  207  8e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820221  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1695  ABC transporter, ATP-binding protein  48.37 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  46.05 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2638  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.37 
 
 		 249 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1888  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.84 
 
 		 249 aa  207  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2200  ABC transporter, ATP-binding protein  48.37 
 
 		 240 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  48.37 
 
 		 249 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3118  ABC transporter, ATP-binding protein  48.37 
 
 		 240 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3012  ABC transporter related  48.11 
 
 		 217 aa  206  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.134737 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  48.58 
 
 		 230 aa  206  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  46.05 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.29 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.29 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.29 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01531  hypothetical protein  45.91 
 
 		 235 aa  206  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0943  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.18 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.24 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.29 
 
 		 233 aa  205  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.29 
 
 		 233 aa  205  4e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.29 
 
 		 233 aa  205  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.29 
 
 		 233 aa  205  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  44.29 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.29 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.29 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  44.29 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.29 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2583  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.91 
 
 		 249 aa  205  5e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.484423  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.47 
 
 		 231 aa  205  6e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2476  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.95 
 
 		 235 aa  204  7e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.95 
 
 		 236 aa  204  8e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1034  ABC transporter related  48.21 
 
 		 232 aa  204  8e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.75 
 
 		 233 aa  204  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.75 
 
 		 233 aa  204  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.75 
 
 		 233 aa  204  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1608  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.37 
 
 		 237 aa  204  9e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109115  normal  0.0760989 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1810  putative ATP-binding component of ABC transporter  45 
 
 		 228 aa  204  9e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.512088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.75 
 
 		 233 aa  204  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.95 
 
 		 253 aa  204  9e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.75 
 
 		 233 aa  204  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.95 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.95 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1542  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.3 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1157  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.37 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.572225  normal  0.0166271 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3826  ABC transporter related  49.08 
 
 		 225 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>