More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3315 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3315  ABC transporter related  100 
 
 		 227 aa  451  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.0682474 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0776  ABC lipoprotein efflux transporter, ATPase subunit, LolD  71.56 
 
 		 224 aa  315  3e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1839  ABC transporter related  71.36 
 
 		 220 aa  309  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0748  ABC transporter related  68.3 
 
 		 227 aa  303  1.0000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2432  ABC transporter related  71.56 
 
 		 224 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.109204  normal  0.0982915 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0403  ABC transporter related  73.78 
 
 		 224 aa  296  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1845  ABC transporter related  69.33 
 
 		 227 aa  293  1e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141516  normal  0.653489 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1377  ABC transporter related  60.44 
 
 		 229 aa  262  3e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0531793  normal  0.0760119 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4461  ABC transporter related  58.56 
 
 		 247 aa  249  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.856819  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1281  ABC transporter related  57.73 
 
 		 227 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0118107  normal  0.276429 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1373  ABC transporter related  57.27 
 
 		 227 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1176  ABC transporter related  57.66 
 
 		 225 aa  246  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1795  ABC transporter related  56 
 
 		 229 aa  244  6e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.219829  normal  0.943815 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1579  ABC transporter component  56.83 
 
 		 252 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132522  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2039  ABC transporter related  55.41 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4146  ABC transporter related  56.5 
 
 		 234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4410  ABC transporter related  56.5 
 
 		 234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1064  ABC transporter related  58.18 
 
 		 236 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.608919  normal  0.101956 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0699  ABC transporter related  56.11 
 
 		 229 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3274  ABC transporter related  54.09 
 
 		 232 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991934  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1194  ABC transporter related  58.18 
 
 		 236 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2599  ABC transporter related  54.09 
 
 		 232 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.215852  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_004310  BR0824  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  55.8 
 
 		 227 aa  239  2.9999999999999997e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.617096  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1042  ABC transporter related  53.78 
 
 		 229 aa  239  4e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2403  ABC transporter related  54.46 
 
 		 227 aa  238  5.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155422  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (lipoprotein)  55 
 
 		 229 aa  238  8e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00216433  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1863  ABC transporter, ATPase subunit  53.39 
 
 		 232 aa  237  1e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0577867  normal  0.0321889 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2863  ABC transporter related  52.73 
 
 		 232 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.479401  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2195  ABC transporter related  53.64 
 
 		 232 aa  236  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0336091  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0818  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  55.36 
 
 		 227 aa  236  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3203  ABC transporter related  55.71 
 
 		 242 aa  235  5.0000000000000005e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0920  ABC transporter related  54.75 
 
 		 228 aa  235  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3345  ABC transporter related  58.37 
 
 		 237 aa  234  6e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2429  ABC transporter related  53.67 
 
 		 232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.506044  normal  0.0627468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0999  ABC transporter related  57.73 
 
 		 236 aa  231  5e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.115476 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2810  ABC transporter related  53.64 
 
 		 230 aa  229  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0257216  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1766  ABC transporter related  55.8 
 
 		 224 aa  227  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0656003  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0941  ABC transporter related  54.67 
 
 		 225 aa  226  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2345  ABC transporter related  59.9 
 
 		 223 aa  226  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.144574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4529  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein lolD  52.86 
 
 		 233 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.830407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0796  ABC transporter, ATP-binding protein  56.92 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.109288  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  53.52 
 
 		 223 aa  214  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1445  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.53 
 
 		 247 aa  208  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303456  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  44.25 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  50.23 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  44.25 
 
 		 227 aa  206  3e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0961  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.07 
 
 		 242 aa  205  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00749478  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1057  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.07 
 
 		 242 aa  205  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1473  ABC transporter, ATP-binding protein  47.91 
 
 		 228 aa  205  5e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  48.18 
 
 		 224 aa  205  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0086  ABC transporter related  50.9 
 
 		 231 aa  205  6e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0522946  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  50.7 
 
 		 224 aa  203  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1567  ABC lipoprotein efflux pump, ATPase subunit  50 
 
 		 247 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1118  lipoprotein releasing system ATP-binding ABC transporter  49.53 
 
 		 244 aa  202  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107348  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  47.27 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1888  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.53 
 
 		 249 aa  202  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1041  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.4 
 
 		 249 aa  201  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01531  hypothetical protein  46.76 
 
 		 235 aa  201  6e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  47.71 
 
 		 227 aa  201  9e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  45.83 
 
 		 235 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1157  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.77 
 
 		 252 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.572225  normal  0.0166271 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2023  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.32 
 
 		 231 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2150  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.32 
 
 		 252 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0659015  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.71 
 
 		 227 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1695  ABC transporter, ATP-binding protein  48.6 
 
 		 227 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2200  ABC transporter, ATP-binding protein  48.6 
 
 		 240 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  48.6 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2638  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.6 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3118  ABC transporter, ATP-binding protein  48.6 
 
 		 240 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2566  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.6 
 
 		 247 aa  199  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0799342  normal  0.05105 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2131  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.88 
 
 		 253 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.099841  normal  0.052889 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5419  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.43 
 
 		 252 aa  199  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.912303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5964  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.88 
 
 		 253 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115719  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2113  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.88 
 
 		 253 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0436359  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2583  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.13 
 
 		 249 aa  198  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.484423  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1077  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.25 
 
 		 244 aa  198  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0335181  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.19 
 
 		 227 aa  198  6e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  45.58 
 
 		 238 aa  197  7.999999999999999e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1542  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 		 237 aa  197  9e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3973  ABC transporter related protein  47.64 
 
 		 275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.36 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  44.25 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.25 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  44.25 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0174  ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.926259  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.25 
 
 		 233 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.25 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.13 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.13 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.13 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.13 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.13 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.25 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.25 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.25 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.25 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.56 
 
 		 238 aa  196  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.66 
 
 		 233 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.25 
 
 		 236 aa  194  7e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>