More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3973 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3973  ABC transporter related protein  100 
 
 
275 aa  550  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155103  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  59.62 
 
 
225 aa  257  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  62.2 
 
 
224 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3744  ABC transporter related  56.81 
 
 
230 aa  251  8.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.319618  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  58.29 
 
 
223 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  58.77 
 
 
224 aa  250  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  56.87 
 
 
238 aa  249  5e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  59.81 
 
 
230 aa  248  5e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  56.4 
 
 
233 aa  248  6e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  57.82 
 
 
224 aa  247  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  58.02 
 
 
230 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1250  putative ATP-binding component of a transport system  59.81 
 
 
227 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.40949e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2845  ABC transporter-related protein  61.5 
 
 
246 aa  243  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  56.6 
 
 
253 aa  243  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  56.6 
 
 
253 aa  242  5e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3016  ABC transporter related  59.72 
 
 
227 aa  241  7e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  56.6 
 
 
253 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  57.35 
 
 
225 aa  240  2e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711904  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3382  ABC transporter related  55.98 
 
 
225 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08621  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  53.95 
 
 
222 aa  238  1e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  55.92 
 
 
231 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  56.4 
 
 
229 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  53.21 
 
 
238 aa  233  3e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2476  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  54.98 
 
 
235 aa  233  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1119  ABC transporter related  59.5 
 
 
224 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.986751  normal  0.0229909 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  54.03 
 
 
239 aa  232  5e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  54.5 
 
 
231 aa  232  6e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2784  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  54.98 
 
 
235 aa  231  9e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0359571  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.77 
 
 
236 aa  231  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  54.21 
 
 
233 aa  230  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  55.02 
 
 
234 aa  230  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  54.03 
 
 
242 aa  229  4e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0890  ABC transporter related  56.94 
 
 
233 aa  228  7e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.999916  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2392  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  55.66 
 
 
231 aa  228  7e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000179176  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1955  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  55.66 
 
 
231 aa  228  7e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00212141  normal  0.0513198 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  55.66 
 
 
231 aa  228  7e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.214498  normal  0.0731118 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2403  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  55.66 
 
 
231 aa  228  7e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.017802  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2202  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.61 
 
 
227 aa  228  8e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.15426 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0612  ABC transporter related  53 
 
 
228 aa  227  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0037706  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.83 
 
 
230 aa  227  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1473  ABC transporter, ATP-binding protein  55.5 
 
 
228 aa  227  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  55.61 
 
 
233 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6890  ABC transporter related  53.33 
 
 
226 aa  227  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  55.61 
 
 
233 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  55.61 
 
 
233 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  55.61 
 
 
233 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  55.61 
 
 
233 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  55.45 
 
 
227 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0341  ABC transporter related  54.15 
 
 
226 aa  227  2e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1649  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  55.02 
 
 
235 aa  226  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  55.45 
 
 
227 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1692  ABC transporter, ATP-binding protein  57 
 
 
219 aa  225  5.0000000000000005e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.623229 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1139  ABC transporter-related protein  58.49 
 
 
225 aa  225  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1810  putative ATP-binding component of ABC transporter  52.53 
 
 
228 aa  225  5.0000000000000005e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.512088  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1208  ABC transporter related  58.49 
 
 
225 aa  225  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2361  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.08 
 
 
227 aa  224  8e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0014315  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  54.07 
 
 
235 aa  224  9e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2835  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.55 
 
 
225 aa  224  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.21843  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3012  ABC transporter related  54.04 
 
 
217 aa  224  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.134737 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0982  ABC transporter related protein  55.22 
 
 
220 aa  224  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.452379 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1034  ABC transporter related  56.65 
 
 
232 aa  224  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2094  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.55 
 
 
225 aa  223  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0980636  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2233  ABC-type lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.53 
 
 
201 aa  223  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.991286 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0642  ABC transporter related  52.61 
 
 
231 aa  223  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0483  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  52.61 
 
 
231 aa  223  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2995  ABC transporter related  57.82 
 
 
254 aa  223  4e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  54.5 
 
 
233 aa  222  4e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  54.21 
 
 
233 aa  222  6e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  53.05 
 
 
234 aa  222  6e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  54.21 
 
 
233 aa  222  7e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  54.21 
 
 
233 aa  221  7e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  54.21 
 
 
233 aa  221  7e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  54.21 
 
 
233 aa  222  7e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  54.21 
 
 
233 aa  221  7e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  54.21 
 
 
233 aa  221  7e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  54.21 
 
 
233 aa  222  7e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  54.21 
 
 
233 aa  221  7e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01531  hypothetical protein  53.59 
 
 
235 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  53.05 
 
 
234 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  53.05 
 
 
234 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0943  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.61 
 
 
227 aa  221  9.999999999999999e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.66 
 
 
227 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  50.71 
 
 
227 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14700  lipoprotein-releasing ABC transporter  54.17 
 
 
232 aa  219  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.072484  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  49.09 
 
 
223 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.53 
 
 
236 aa  218  7.999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  47.46 
 
 
256 aa  218  8.999999999999998e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3255  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.94 
 
 
318 aa  218  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2110  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  54.17 
 
 
227 aa  217  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327519  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3858  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.08 
 
 
232 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0939  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.56 
 
 
233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1047  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  52.56 
 
 
233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1672  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  54.5 
 
 
232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.50356  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3587  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  54.03 
 
 
232 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1739  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.42 
 
 
228 aa  215  5e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1905  ABC transporter  53.08 
 
 
232 aa  215  7e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.030671  hitchhiker  0.00477686 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3231  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.47 
 
 
258 aa  214  8e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.15277  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  54.03 
 
 
232 aa  214  9e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390667  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1619  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  55.5 
 
 
235 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.281163  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1696  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.55 
 
 
232 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0743106 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>