More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3012 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3012  ABC transporter related  100 
 
 
217 aa  439  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.134737 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6890  ABC transporter related  65.74 
 
 
226 aa  296  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0341  ABC transporter related  63.93 
 
 
226 aa  289  3e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08621  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  64.25 
 
 
222 aa  287  1e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0982  ABC transporter related protein  59.53 
 
 
220 aa  276  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.452379 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2233  ABC-type lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  62.19 
 
 
201 aa  268  5.9999999999999995e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.991286 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0759  hypothetical protein  59.72 
 
 
231 aa  267  8.999999999999999e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1692  ABC transporter, ATP-binding protein  58.14 
 
 
219 aa  262  3e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.623229 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2735  ABC transporter related  61.75 
 
 
223 aa  261  6e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.31749  normal  0.728727 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  52.05 
 
 
223 aa  236  2e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1796  ABC transporter related protein  57.97 
 
 
229 aa  236  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0860  ABC transporter-related protein  52 
 
 
228 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0674344  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1577  ABC transporter related  52 
 
 
226 aa  232  4.0000000000000004e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.039457 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  50.45 
 
 
224 aa  228  4e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  50.45 
 
 
230 aa  228  5e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  50.91 
 
 
224 aa  228  7e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1480  ATPase  51.57 
 
 
235 aa  227  9e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3858  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.4 
 
 
232 aa  224  7e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3973  ABC transporter related protein  54.04 
 
 
275 aa  224  9e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155103  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14700  lipoprotein-releasing ABC transporter  47.73 
 
 
232 aa  224  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.072484  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3016  ABC transporter related  50.69 
 
 
227 aa  223  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  50.45 
 
 
225 aa  222  4e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.32 
 
 
239 aa  222  4e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.73 
 
 
231 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  49.77 
 
 
223 aa  221  4.9999999999999996e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.27 
 
 
238 aa  221  7e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.93 
 
 
233 aa  221  9e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1695  ABC transporter, ATP-binding protein  48.4 
 
 
227 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5419  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.49 
 
 
252 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.912303  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  47.73 
 
 
227 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5964  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.95 
 
 
253 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115719  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.86 
 
 
253 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.73 
 
 
227 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2113  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.95 
 
 
253 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0436359  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2131  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.95 
 
 
253 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.099841  normal  0.052889 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1905  ABC transporter  46.82 
 
 
232 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.030671  hitchhiker  0.00477686 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  47.25 
 
 
227 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  49.09 
 
 
238 aa  219  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2110  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  46.82 
 
 
227 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327519  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1542  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.31 
 
 
237 aa  219  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3587  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.82 
 
 
232 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1672  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.27 
 
 
232 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.50356  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2150  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.49 
 
 
252 aa  219  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0659015  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2023  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.49 
 
 
231 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1888  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.4 
 
 
249 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.82 
 
 
232 aa  218  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390667  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1015  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.85 
 
 
224 aa  218  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2200  ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 
240 aa  218  6e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2583  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.95 
 
 
249 aa  218  6e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.484423  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3118  ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 
240 aa  218  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2638  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.95 
 
 
249 aa  218  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 
249 aa  218  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01531  hypothetical protein  48.64 
 
 
235 aa  218  7e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0920  ABC transporter related  50.23 
 
 
228 aa  218  7e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1810  putative ATP-binding component of ABC transporter  47.49 
 
 
228 aa  218  7.999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.512088  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.4 
 
 
253 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.4 
 
 
253 aa  217  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1649  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.39 
 
 
235 aa  217  8.999999999999998e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1445  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.49 
 
 
247 aa  217  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303456  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1696  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.36 
 
 
232 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0743106 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5400  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.47 
 
 
238 aa  217  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122098  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1118  lipoprotein releasing system ATP-binding ABC transporter  49.31 
 
 
244 aa  216  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107348  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  48.4 
 
 
230 aa  216  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1866  ABC transporter related  53.33 
 
 
231 aa  216  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  50.23 
 
 
229 aa  216  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3219  ABC transporter, ATP-binding protein  48.42 
 
 
248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1373  ABC transporter related  50 
 
 
227 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1608  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.18 
 
 
237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109115  normal  0.0760989 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  48.64 
 
 
235 aa  215  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3420  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.95 
 
 
226 aa  215  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0399135  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2754  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.95 
 
 
226 aa  215  4e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1041  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.75 
 
 
249 aa  214  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.4 
 
 
231 aa  214  7e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1281  ABC transporter related  49.55 
 
 
227 aa  214  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0118107  normal  0.276429 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  52.13 
 
 
224 aa  214  8e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0225  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.58 
 
 
235 aa  213  9.999999999999999e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.49 
 
 
234 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.25 
 
 
227 aa  213  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0461  ABC transporter-related protein  50.25 
 
 
227 aa  213  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.880159  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1250  putative ATP-binding component of a transport system  52 
 
 
227 aa  213  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.40949e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.49 
 
 
234 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.49 
 
 
234 aa  213  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0979  ATPase  52 
 
 
241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.103912  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0425  ABC transporter related  50.75 
 
 
234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3231  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.36 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.15277  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 
233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1473  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 
228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1157  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.58 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.572225  normal  0.0166271 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1034  ABC transporter related  47.64 
 
 
232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1077  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.24 
 
 
244 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0335181  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2810  ABC transporter related  45.91 
 
 
230 aa  212  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0257216  normal  0.633294 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  50 
 
 
233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50 
 
 
233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2835  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.73 
 
 
225 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.21843  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50 
 
 
233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  50 
 
 
233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.52 
 
 
236 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.18 
 
 
236 aa  211  4.9999999999999996e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.47 
 
 
234 aa  211  5.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1211  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.93 
 
 
225 aa  211  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>