More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0425 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0425  ABC transporter related  100 
 
 
234 aa  474  1e-133  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0461  ABC transporter-related protein  83.63 
 
 
227 aa  396  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.880159  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2018  ABC transporter related  78.32 
 
 
238 aa  366  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0473  ABC transporter related  74.14 
 
 
238 aa  359  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0481  ABC transporter related  76.32 
 
 
241 aa  358  4e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1701  ATPase  73.93 
 
 
240 aa  352  2.9999999999999997e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.620814 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0264  ATPase  72.37 
 
 
246 aa  350  8.999999999999999e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  57.65 
 
 
227 aa  239  4e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  56.85 
 
 
256 aa  233  3e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  55.61 
 
 
227 aa  227  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  48.47 
 
 
239 aa  224  7e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2535  ABC transporter related  54.37 
 
 
230 aa  222  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.14801  normal  0.635881 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  57.07 
 
 
239 aa  222  4.9999999999999996e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.22 
 
 
238 aa  221  9e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6890  ABC transporter related  52.74 
 
 
226 aa  220  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  57.14 
 
 
232 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  47.19 
 
 
233 aa  219  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.19 
 
 
233 aa  219  3e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  47.19 
 
 
233 aa  219  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.19 
 
 
233 aa  219  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.19 
 
 
233 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  50.66 
 
 
226 aa  219  3.9999999999999997e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.19 
 
 
233 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.19 
 
 
233 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.19 
 
 
233 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  50.48 
 
 
246 aa  218  5e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  54.73 
 
 
233 aa  218  6e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0908  ABC transporter related  50.49 
 
 
235 aa  218  7.999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.19 
 
 
233 aa  217  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  49.33 
 
 
230 aa  217  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  47.81 
 
 
235 aa  217  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  55.45 
 
 
235 aa  216  2e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  48.44 
 
 
228 aa  217  2e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.5 
 
 
236 aa  216  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  50.44 
 
 
229 aa  217  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.62 
 
 
233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.62 
 
 
233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.62 
 
 
233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.62 
 
 
233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.62 
 
 
233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2735  ABC transporter related  54.27 
 
 
223 aa  216  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.31749  normal  0.728727 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.46 
 
 
233 aa  215  4e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.14 
 
 
253 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  49.76 
 
 
235 aa  214  7e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.55 
 
 
231 aa  214  7e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.14 
 
 
253 aa  214  7e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.14 
 
 
253 aa  214  7e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  53.73 
 
 
241 aa  214  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  47.79 
 
 
230 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.79 
 
 
231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  51.76 
 
 
223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3012  ABC transporter related  50.75 
 
 
217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.134737 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  50.72 
 
 
229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.76 
 
 
233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.49 
 
 
236 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  48.21 
 
 
237 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  48.57 
 
 
228 aa  212  3.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.87 
 
 
233 aa  212  4.9999999999999996e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  48.54 
 
 
238 aa  211  5.999999999999999e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  50.95 
 
 
253 aa  211  7e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  48.68 
 
 
248 aa  211  7.999999999999999e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01531  hypothetical protein  48.83 
 
 
235 aa  211  7.999999999999999e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  48.91 
 
 
230 aa  211  9e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1564  ABC transporter related protein  50 
 
 
226 aa  211  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  46.09 
 
 
249 aa  210  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  46.12 
 
 
227 aa  211  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  52.94 
 
 
226 aa  210  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3212  cyclic nucleotide-binding protein  46.75 
 
 
388 aa  209  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1739  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.08 
 
 
228 aa  209  2e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0943  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.77 
 
 
227 aa  210  2e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2202  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.25 
 
 
227 aa  209  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.15426 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1542  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.83 
 
 
237 aa  210  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  51.64 
 
 
242 aa  209  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  46.75 
 
 
388 aa  209  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.76 
 
 
239 aa  209  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  52.94 
 
 
226 aa  209  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  52.94 
 
 
226 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  52.94 
 
 
226 aa  209  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  52.94 
 
 
226 aa  209  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  52.94 
 
 
226 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1015  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.75 
 
 
224 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  52.94 
 
 
226 aa  209  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  52.45 
 
 
226 aa  209  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  52.94 
 
 
226 aa  208  5e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  52.45 
 
 
226 aa  208  5e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  52.45 
 
 
226 aa  208  5e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5400  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.75 
 
 
238 aa  208  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122098  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3826  ABC transporter related  44.8 
 
 
225 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  52.45 
 
 
226 aa  207  8e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3231  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.9 
 
 
258 aa  207  9e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.15277  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  51.71 
 
 
246 aa  207  9e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00596  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.25 
 
 
236 aa  207  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820221  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  50.99 
 
 
234 aa  207  1e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3858  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.25 
 
 
232 aa  206  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  51.5 
 
 
234 aa  206  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0225  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.34 
 
 
235 aa  206  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  51.5 
 
 
234 aa  206  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4228  ABC transporter related  44.3 
 
 
229 aa  206  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  0.619304 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  50 
 
 
224 aa  206  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0341  ABC transporter related  48.53 
 
 
226 aa  207  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>