More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2735 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2735  ABC transporter related  100 
 
 		 223 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.31749  normal  0.728727 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0982  ABC transporter related protein  66.82 
 
 		 220 aa  297  7e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.452379 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0759  hypothetical protein  60.81 
 
 		 231 aa  281  4.0000000000000003e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3012  ABC transporter related  61.75 
 
 		 217 aa  277  9e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.134737 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0341  ABC transporter related  60.91 
 
 		 226 aa  274  1.0000000000000001e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6890  ABC transporter related  63.08 
 
 		 226 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08621  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  61.26 
 
 		 222 aa  271  4.0000000000000004e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2233  ABC-type lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  63.86 
 
 		 201 aa  261  4.999999999999999e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.991286 
 
 
-
 
NC_002950  PG1692  ABC transporter, ATP-binding protein  56.42 
 
 		 219 aa  248  5e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.623229 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  53.15 
 
 		 224 aa  237  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  53.15 
 
 		 224 aa  236  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1577  ABC transporter related  53.54 
 
 		 226 aa  236  3e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.039457 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1796  ABC transporter related protein  57.02 
 
 		 229 aa  235  3e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  52.44 
 
 		 238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0860  ABC transporter-related protein  56.19 
 
 		 228 aa  229  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0674344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0461  ABC transporter-related protein  51.63 
 
 		 227 aa  228  6e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.880159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0425  ABC transporter related  54.27 
 
 		 234 aa  226  3e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  50.45 
 
 		 230 aa  225  4e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 		 253 aa  225  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2018  ABC transporter related  49.34 
 
 		 238 aa  224  5.0000000000000005e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 		 253 aa  224  7e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3219  ABC transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 		 248 aa  224  8e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.46 
 
 		 233 aa  224  8e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 		 253 aa  224  8e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01531  hypothetical protein  53.6 
 
 		 235 aa  224  9e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.45 
 
 		 238 aa  223  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1480  ATPase  53.33 
 
 		 235 aa  223  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.47 
 
 		 239 aa  223  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0473  ABC transporter related  49.32 
 
 		 238 aa  222  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.23 
 
 		 231 aa  222  4e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1473  ABC transporter, ATP-binding protein  52.27 
 
 		 228 aa  221  6e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  52.21 
 
 		 235 aa  221  9e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  48.18 
 
 		 223 aa  220  9.999999999999999e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  46.26 
 
 		 227 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.55 
 
 		 231 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.5 
 
 		 236 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  50.68 
 
 		 230 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.45 
 
 		 233 aa  218  7e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1866  ABC transporter related  52.65 
 
 		 231 aa  217  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1564  ABC transporter related protein  48.17 
 
 		 226 aa  216  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  50.46 
 
 		 229 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0481  ABC transporter related  48.4 
 
 		 241 aa  215  4e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  51.8 
 
 		 225 aa  215  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3744  ABC transporter related  52.51 
 
 		 230 aa  215  4e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.319618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1208  ABC transporter related  54.13 
 
 		 225 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1139  ABC transporter-related protein  54.13 
 
 		 225 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1701  ATPase  50.75 
 
 		 240 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.620814 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2039  ABC transporter related  49.08 
 
 		 237 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1955  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.45 
 
 		 231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00212141  normal  0.0513198 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4410  ABC transporter related  49.08 
 
 		 234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0264  ATPase  48.61 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.45 
 
 		 231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.214498  normal  0.0731118 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2403  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.45 
 
 		 231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.017802  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2392  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.45 
 
 		 231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000179176  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1685  ABC transporter related  52.86 
 
 		 237 aa  212  2.9999999999999995e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000384234  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4461  ABC transporter related  50 
 
 		 247 aa  212  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.856819  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  50.95 
 
 		 224 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3016  ABC transporter related  50.23 
 
 		 227 aa  211  7e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2202  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.96 
 
 		 227 aa  210  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.15426 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1739  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.32 
 
 		 228 aa  209  2e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0943  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 		 227 aa  210  2e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.46 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4146  ABC transporter related  47.71 
 
 		 234 aa  209  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1119  ABC transporter related  52.43 
 
 		 224 aa  208  4e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.986751  normal  0.0229909 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2454  ABC transporter related  65.54 
 
 		 292 aa  208  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368798  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3973  ABC transporter related protein  52.74 
 
 		 275 aa  208  5e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155103  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3478  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  48.86 
 
 		 258 aa  207  8e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.741929  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  44.74 
 
 		 227 aa  207  8e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  49.06 
 
 		 242 aa  207  9e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  52.48 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  52.48 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0225  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 		 235 aa  206  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  47.27 
 
 		 230 aa  206  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  49.55 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  47.3 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  50.93 
 
 		 228 aa  206  3e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1041  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.71 
 
 		 249 aa  205  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.27 
 
 		 232 aa  204  6e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390667  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  48.87 
 
 		 240 aa  205  6e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  47.09 
 
 		 234 aa  204  6e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1034  ABC transporter related  47.96 
 
 		 232 aa  204  6e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1099  ABC transporter related  52 
 
 		 230 aa  204  8e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3587  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.27 
 
 		 232 aa  204  8e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  44.8 
 
 		 241 aa  204  8e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2845  ABC transporter-related protein  51.24 
 
 		 246 aa  204  8e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0782  ABC lipoprotein exporter, ATPase subunit, LolD  46.79 
 
 		 226 aa  204  1e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000690329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  47.93 
 
 		 227 aa  204  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  48.62 
 
 		 223 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  45.91 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  49.76 
 
 		 248 aa  203  1e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1251  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.74 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  48.62 
 
 		 242 aa  202  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0920  ABC transporter related  47.06 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0788  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.79 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00288546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2670  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.82 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1672  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.27 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.50356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  46.36 
 
 		 221 aa  202  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1696  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.78 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0743106 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1608  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.76 
 
 		 237 aa  202  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109115  normal  0.0760989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>