More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2810 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2810  ABC transporter related  100 
 
 
230 aa  466  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0257216  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1377  ABC transporter related  63.35 
 
 
229 aa  283  1.0000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0531793  normal  0.0760119 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3203  ABC transporter related  60.18 
 
 
242 aa  264  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2039  ABC transporter related  58.18 
 
 
237 aa  262  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4461  ABC transporter related  59.64 
 
 
247 aa  262  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.856819  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0941  ABC transporter related  57.66 
 
 
225 aa  257  9e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4410  ABC transporter related  56.25 
 
 
234 aa  256  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4146  ABC transporter related  56.25 
 
 
234 aa  256  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0824  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  58.18 
 
 
227 aa  255  4e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.617096  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (lipoprotein)  57.52 
 
 
229 aa  255  4e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00216433  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0818  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  58.18 
 
 
227 aa  255  5e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2403  ABC transporter related  58.18 
 
 
227 aa  254  6e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155422  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0699  ABC transporter related  55.75 
 
 
229 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1579  ABC transporter component  59.19 
 
 
252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132522  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1373  ABC transporter related  56.36 
 
 
227 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1042  ABC transporter related  54.71 
 
 
229 aa  252  4.0000000000000004e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1281  ABC transporter related  56.36 
 
 
227 aa  250  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0118107  normal  0.276429 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0999  ABC transporter related  56.7 
 
 
236 aa  248  5e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.115476 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1194  ABC transporter related  56.25 
 
 
236 aa  247  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1064  ABC transporter related  56.25 
 
 
236 aa  247  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.608919  normal  0.101956 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0920  ABC transporter related  54.46 
 
 
228 aa  246  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0748  ABC transporter related  56.11 
 
 
227 aa  243  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2195  ABC transporter related  53.85 
 
 
232 aa  240  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0336091  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2599  ABC transporter related  53.85 
 
 
232 aa  238  4e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.215852  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2863  ABC transporter related  52.49 
 
 
232 aa  238  8e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.479401  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1795  ABC transporter related  51.77 
 
 
229 aa  237  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.219829  normal  0.943815 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0796  ABC transporter, ATP-binding protein  53.92 
 
 
226 aa  236  2e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.109288  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.8 
 
 
236 aa  235  4e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3274  ABC transporter related  52.49 
 
 
232 aa  235  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991934  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1863  ABC transporter, ATPase subunit  52.25 
 
 
232 aa  234  6e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0577867  normal  0.0321889 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1839  ABC transporter related  54.84 
 
 
220 aa  234  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 
238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2429  ABC transporter related  54.38 
 
 
232 aa  232  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.506044  normal  0.0627468 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2345  ABC transporter related  54.75 
 
 
223 aa  231  9e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.144574  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3345  ABC transporter related  57.08 
 
 
237 aa  230  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1766  ABC transporter related  54.75 
 
 
224 aa  231  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0656003  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4529  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein lolD  52.94 
 
 
233 aa  230  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.830407  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3315  ABC transporter related  53.64 
 
 
227 aa  229  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.0682474 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.68 
 
 
239 aa  228  8e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0776  ABC lipoprotein efflux transporter, ATPase subunit, LolD  53.36 
 
 
224 aa  226  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.33 
 
 
253 aa  225  6e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1176  ABC transporter related  51.14 
 
 
225 aa  224  7e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495851  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.33 
 
 
253 aa  224  8e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  47.56 
 
 
230 aa  224  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.64 
 
 
231 aa  223  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  50.45 
 
 
225 aa  223  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.89 
 
 
253 aa  222  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  49.32 
 
 
223 aa  222  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.55 
 
 
236 aa  222  4e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  49.11 
 
 
230 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1845  ABC transporter related  54.55 
 
 
227 aa  221  4.9999999999999996e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141516  normal  0.653489 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  45.85 
 
 
238 aa  221  6e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.32 
 
 
231 aa  221  9e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  48.4 
 
 
227 aa  220  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2432  ABC transporter related  52.91 
 
 
224 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.109204  normal  0.0982915 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.31 
 
 
233 aa  219  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  47.49 
 
 
227 aa  219  3.9999999999999997e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  50.45 
 
 
229 aa  218  6e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  46.85 
 
 
224 aa  218  7e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.87 
 
 
233 aa  218  7e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  44.29 
 
 
223 aa  218  8.999999999999998e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2835  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.27 
 
 
225 aa  217  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.21843  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1118  lipoprotein releasing system ATP-binding ABC transporter  48.87 
 
 
244 aa  216  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107348  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1041  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.68 
 
 
249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  50.22 
 
 
224 aa  215  5e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1057  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.4 
 
 
242 aa  215  5e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_002978  WD0707  ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 
224 aa  215  5.9999999999999996e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0961  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.4 
 
 
242 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00749478  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  40.79 
 
 
227 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  45.5 
 
 
224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  47.32 
 
 
227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.32 
 
 
231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.214498  normal  0.0731118 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2403  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.32 
 
 
231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.017802  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2392  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.32 
 
 
231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000179176  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.32 
 
 
227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1955  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.32 
 
 
231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00212141  normal  0.0513198 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1608  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.67 
 
 
237 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109115  normal  0.0760989 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3012  ABC transporter related  45.91 
 
 
217 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.134737 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3858  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.96 
 
 
232 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.18 
 
 
230 aa  211  5.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1796  ABC transporter related protein  50 
 
 
229 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.23 
 
 
227 aa  211  9e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1077  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.23 
 
 
244 aa  209  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0335181  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14700  lipoprotein-releasing ABC transporter  49.1 
 
 
232 aa  210  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.072484  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.67 
 
 
234 aa  209  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  44.14 
 
 
256 aa  210  2e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1696  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.18 
 
 
232 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0743106 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  49.02 
 
 
233 aa  209  4e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.02 
 
 
233 aa  209  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.02 
 
 
233 aa  209  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2670  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.5 
 
 
233 aa  209  4e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.02 
 
 
233 aa  209  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.02 
 
 
233 aa  209  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.02 
 
 
233 aa  209  4e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.02 
 
 
233 aa  209  4e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  49.02 
 
 
233 aa  209  4e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2583  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.32 
 
 
249 aa  208  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.484423  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2200  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 
240 aa  208  5e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3118  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 
240 aa  208  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 
249 aa  208  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>