More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2269 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
224 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  82.88 
 
 
225 aa  374  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  75.23 
 
 
223 aa  344  7e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  72.97 
 
 
224 aa  326  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  72.07 
 
 
224 aa  324  5e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3016  ABC transporter related  70.98 
 
 
227 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  65.32 
 
 
230 aa  297  8e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1250  putative ATP-binding component of a transport system  60.27 
 
 
227 aa  271  8.000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.40949e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1139  ABC transporter-related protein  60.63 
 
 
225 aa  259  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1208  ABC transporter related  60.63 
 
 
225 aa  259  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2845  ABC transporter-related protein  59.53 
 
 
246 aa  256  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  54.79 
 
 
233 aa  254  7e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3973  ABC transporter related protein  62.2 
 
 
275 aa  254  8e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155103  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1119  ABC transporter related  61.54 
 
 
224 aa  252  3e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.986751  normal  0.0229909 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  54.3 
 
 
230 aa  248  4e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3744  ABC transporter related  55.25 
 
 
230 aa  248  4e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.319618  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0612  ABC transporter related  55.41 
 
 
228 aa  246  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0037706  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  54.79 
 
 
233 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  54.79 
 
 
233 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  54.79 
 
 
233 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  54.79 
 
 
233 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  54.79 
 
 
233 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.39 
 
 
239 aa  246  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.39 
 
 
231 aa  246  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2361  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.15 
 
 
227 aa  244  4.9999999999999997e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0014315  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.18 
 
 
253 aa  244  6e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.88 
 
 
238 aa  244  8e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  53.1 
 
 
234 aa  244  9e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.18 
 
 
253 aa  244  9e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.18 
 
 
253 aa  244  9e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  53.88 
 
 
233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.88 
 
 
233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  53.88 
 
 
233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  53.88 
 
 
233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  53.88 
 
 
233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  53.88 
 
 
233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  53.88 
 
 
233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  53.88 
 
 
233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  54.26 
 
 
227 aa  242  3e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  52.89 
 
 
234 aa  242  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  53.42 
 
 
233 aa  241  9e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  52.44 
 
 
234 aa  240  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  54.79 
 
 
227 aa  240  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2094  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  56.56 
 
 
225 aa  240  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0980636  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  52.44 
 
 
234 aa  240  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  57.48 
 
 
236 aa  240  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  53.88 
 
 
229 aa  240  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3478  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  50.9 
 
 
258 aa  238  6.999999999999999e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.741929  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1034  ABC transporter related  54.79 
 
 
232 aa  237  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1649  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  52.89 
 
 
235 aa  236  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  53.42 
 
 
233 aa  235  5.0000000000000005e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.46 
 
 
231 aa  234  7e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.6 
 
 
225 aa  234  8e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711904  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3382  ABC transporter related  54.95 
 
 
225 aa  234  9e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.18 
 
 
230 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2476  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  52.89 
 
 
235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1473  ABC transporter, ATP-binding protein  50.91 
 
 
228 aa  232  3e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1955  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.39 
 
 
231 aa  232  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00212141  normal  0.0513198 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.39 
 
 
231 aa  232  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.214498  normal  0.0731118 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2392  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.39 
 
 
231 aa  232  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000179176  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2403  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.39 
 
 
231 aa  232  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.017802  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00596  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  54.3 
 
 
236 aa  232  4.0000000000000004e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820221  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.36 
 
 
236 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  53.05 
 
 
227 aa  231  8.000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0982  ABC transporter related protein  50.91 
 
 
220 aa  230  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.452379 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2784  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  52.04 
 
 
235 aa  230  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0359571  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.6 
 
 
233 aa  228  5e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  52.97 
 
 
256 aa  228  5e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  52.11 
 
 
227 aa  227  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1760  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  56.54 
 
 
226 aa  226  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.585377  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  49.78 
 
 
238 aa  226  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2670  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.4 
 
 
233 aa  226  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0943  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.64 
 
 
227 aa  226  3e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  49.55 
 
 
235 aa  225  4e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (lipoprotein)  51.79 
 
 
229 aa  225  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00216433  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3345  ABC transporter related  56.54 
 
 
237 aa  225  5.0000000000000005e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01531  hypothetical protein  50.45 
 
 
235 aa  225  5.0000000000000005e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2835  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  55.45 
 
 
225 aa  224  7e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.21843  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  50.47 
 
 
242 aa  224  8e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2995  ABC transporter related  55.25 
 
 
254 aa  223  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1367  ATPase  52.05 
 
 
231 aa  223  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.137437  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1542  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.42 
 
 
237 aa  223  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1810  putative ATP-binding component of ABC transporter  50.23 
 
 
228 aa  223  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.512088  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1796  ABC transporter related protein  56.11 
 
 
229 aa  222  3e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5400  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.99 
 
 
238 aa  222  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122098  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4461  ABC transporter related  51.83 
 
 
247 aa  222  4.9999999999999996e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.856819  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  53.74 
 
 
227 aa  221  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0642  ABC transporter related  50.91 
 
 
231 aa  221  6e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0483  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  50.91 
 
 
231 aa  221  6e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.74 
 
 
227 aa  221  6e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0890  ABC transporter related  54.98 
 
 
233 aa  221  6e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.999916  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3231  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.99 
 
 
258 aa  221  7e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.15277  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2202  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.91 
 
 
227 aa  221  8e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.15426 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2232  ABC transporter related  53.6 
 
 
229 aa  221  9e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0939  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.68 
 
 
233 aa  220  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2233  ABC-type lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51 
 
 
201 aa  221  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.991286 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1047  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  50.68 
 
 
233 aa  220  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  51.57 
 
 
234 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  51.57 
 
 
234 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1480  ATPase  48.29 
 
 
235 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>