More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3345 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3345  ABC transporter related  100 
 
 
237 aa  459  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0941  ABC transporter related  71.36 
 
 
225 aa  294  9e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (lipoprotein)  61.82 
 
 
229 aa  265  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00216433  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0920  ABC transporter related  61.61 
 
 
228 aa  264  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4410  ABC transporter related  63.64 
 
 
234 aa  264  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1042  ABC transporter related  63.35 
 
 
229 aa  263  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4146  ABC transporter related  63.96 
 
 
234 aa  262  4e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1579  ABC transporter component  62.56 
 
 
252 aa  261  8e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132522  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4461  ABC transporter related  60 
 
 
247 aa  259  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.856819  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2345  ABC transporter related  61.82 
 
 
223 aa  258  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.144574  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1795  ABC transporter related  61.26 
 
 
229 aa  258  5.0000000000000005e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.219829  normal  0.943815 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1377  ABC transporter related  63.68 
 
 
229 aa  258  5.0000000000000005e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0531793  normal  0.0760119 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1281  ABC transporter related  61.36 
 
 
227 aa  257  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0118107  normal  0.276429 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3203  ABC transporter related  62.44 
 
 
242 aa  256  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2039  ABC transporter related  57.63 
 
 
237 aa  256  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1373  ABC transporter related  60.45 
 
 
227 aa  255  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0748  ABC transporter related  58.8 
 
 
227 aa  255  4e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1194  ABC transporter related  60.34 
 
 
236 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3274  ABC transporter related  58.74 
 
 
232 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991934  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1064  ABC transporter related  60.34 
 
 
236 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.608919  normal  0.101956 
 
 
-
 
NC_004310  BR0824  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  59.73 
 
 
227 aa  250  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.617096  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2429  ABC transporter related  59.36 
 
 
232 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.506044  normal  0.0627468 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0699  ABC transporter related  58.82 
 
 
229 aa  249  2e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2403  ABC transporter related  58.9 
 
 
227 aa  249  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155422  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2599  ABC transporter related  58.3 
 
 
232 aa  248  5e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.215852  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0818  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  59.28 
 
 
227 aa  248  6e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2863  ABC transporter related  57.4 
 
 
232 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.479401  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1839  ABC transporter related  61.57 
 
 
220 aa  246  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0776  ABC lipoprotein efflux transporter, ATPase subunit, LolD  60.91 
 
 
224 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3315  ABC transporter related  58.37 
 
 
227 aa  244  9.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.0682474 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1863  ABC transporter, ATPase subunit  57.01 
 
 
232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0577867  normal  0.0321889 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1766  ABC transporter related  61.54 
 
 
224 aa  243  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0656003  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0999  ABC transporter related  59.49 
 
 
236 aa  243  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.115476 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2195  ABC transporter related  57.4 
 
 
232 aa  242  3e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0336091  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2810  ABC transporter related  57.08 
 
 
230 aa  242  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0257216  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1176  ABC transporter related  58.26 
 
 
225 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495851  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  58.45 
 
 
225 aa  241  9e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0796  ABC transporter, ATP-binding protein  56.11 
 
 
226 aa  240  1e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.109288  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4529  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein lolD  56.5 
 
 
233 aa  238  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.830407  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2432  ABC transporter related  61.36 
 
 
224 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.109204  normal  0.0982915 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  56.54 
 
 
224 aa  231  7.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1845  ABC transporter related  58.37 
 
 
227 aa  225  6e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141516  normal  0.653489 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  50 
 
 
224 aa  223  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1796  ABC transporter related protein  57.41 
 
 
229 aa  222  4e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.28 
 
 
236 aa  222  4.9999999999999996e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0403  ABC transporter related  61.36 
 
 
224 aa  221  8e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  50 
 
 
224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  50.92 
 
 
223 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  48.17 
 
 
227 aa  218  6e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.95 
 
 
227 aa  218  6e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.2 
 
 
253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1542  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.61 
 
 
237 aa  215  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  46.12 
 
 
238 aa  214  5.9999999999999996e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01531  hypothetical protein  49.07 
 
 
235 aa  215  5.9999999999999996e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.2 
 
 
253 aa  214  7e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.77 
 
 
233 aa  214  8e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14700  lipoprotein-releasing ABC transporter  52.21 
 
 
232 aa  214  8e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.072484  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  46.79 
 
 
227 aa  214  9e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1473  ABC transporter, ATP-binding protein  48.39 
 
 
228 aa  214  9e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1608  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.94 
 
 
237 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109115  normal  0.0760989 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 
233 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48 
 
 
239 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  47.3 
 
 
227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00596  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 
236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820221  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.18 
 
 
238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.75 
 
 
253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  48.17 
 
 
230 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.67 
 
 
232 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390667  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  47.69 
 
 
235 aa  211  7e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3587  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.22 
 
 
232 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  49.32 
 
 
229 aa  210  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2835  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.57 
 
 
225 aa  209  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.21843  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3858  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.87 
 
 
232 aa  210  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1672  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.67 
 
 
232 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.50356  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1905  ABC transporter  49.78 
 
 
232 aa  209  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.030671  hitchhiker  0.00477686 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1696  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.78 
 
 
232 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0743106 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3016  ABC transporter related  54.21 
 
 
227 aa  209  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0086  ABC transporter related  53.85 
 
 
231 aa  209  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0522946  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.71 
 
 
231 aa  208  5e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2094  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.8 
 
 
225 aa  208  6e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0980636  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  48.88 
 
 
227 aa  208  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  50.46 
 
 
230 aa  208  7e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2110  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  50.45 
 
 
227 aa  207  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327519  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2670  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.45 
 
 
233 aa  207  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  45.33 
 
 
256 aa  207  1e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.43 
 
 
227 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.12 
 
 
233 aa  206  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.12 
 
 
233 aa  206  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  46.12 
 
 
233 aa  206  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.73 
 
 
231 aa  206  4e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  46.12 
 
 
233 aa  206  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.12 
 
 
233 aa  206  4e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.12 
 
 
233 aa  205  6e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.12 
 
 
233 aa  205  6e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.12 
 
 
233 aa  205  6e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.12 
 
 
233 aa  205  6e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.64 
 
 
230 aa  204  7e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.33 
 
 
234 aa  203  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1810  putative ATP-binding component of ABC transporter  46.26 
 
 
228 aa  204  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.512088  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.58 
 
 
233 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>