More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1692 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1692  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 219 aa  439  9.999999999999999e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.623229 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0982  ABC transporter related protein  59.91 
 
 		 220 aa  273  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.452379 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0341  ABC transporter related  60.65 
 
 		 226 aa  264  7e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3012  ABC transporter related  58.14 
 
 		 217 aa  262  3e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.134737 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08621  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  61.19 
 
 		 222 aa  256  1e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6890  ABC transporter related  55.5 
 
 		 226 aa  248  6e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2735  ABC transporter related  56.94 
 
 		 223 aa  241  7.999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.31749  normal  0.728727 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2233  ABC-type lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  56 
 
 		 201 aa  238  4e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.991286 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  50.23 
 
 		 224 aa  236  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1250  putative ATP-binding component of a transport system  55.3 
 
 		 227 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.40949e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  49.77 
 
 		 224 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1796  ABC transporter related protein  53.36 
 
 		 229 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.22 
 
 		 236 aa  231  9e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.1 
 
 		 231 aa  229  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.09 
 
 		 238 aa  228  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.55 
 
 		 233 aa  228  7e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  51.36 
 
 		 229 aa  227  8e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  49.54 
 
 		 227 aa  226  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  52.97 
 
 		 235 aa  226  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3973  ABC transporter related protein  57 
 
 		 275 aa  225  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.85 
 
 		 227 aa  226  3e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.58 
 
 		 239 aa  226  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01531  hypothetical protein  52.97 
 
 		 235 aa  225  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.73 
 
 		 231 aa  223  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0759  hypothetical protein  51.63 
 
 		 231 aa  223  2e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  48.18 
 
 		 230 aa  222  4e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3016  ABC transporter related  50.23 
 
 		 227 aa  222  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  49.31 
 
 		 225 aa  221  4.9999999999999996e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.27 
 
 		 253 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.27 
 
 		 253 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.27 
 
 		 253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  48.65 
 
 		 238 aa  218  7e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  48.85 
 
 		 223 aa  217  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1577  ABC transporter related  48.89 
 
 		 226 aa  217  1e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.039457 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1473  ABC transporter, ATP-binding protein  52.24 
 
 		 228 aa  217  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  46.12 
 
 		 223 aa  216  2e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1810  putative ATP-binding component of ABC transporter  46.12 
 
 		 228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.512088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.76 
 
 		 233 aa  215  4e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2202  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.03 
 
 		 227 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.15426 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  45.05 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  46.95 
 
 		 230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  48.39 
 
 		 224 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  44.14 
 
 		 227 aa  212  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3744  ABC transporter related  51.2 
 
 		 230 aa  212  2.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.319618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  50.22 
 
 		 246 aa  211  7e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0860  ABC transporter-related protein  48 
 
 		 228 aa  210  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0674344  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2625  lipoprotein ABC transporter, ATP-binding protein LolD  50.68 
 
 		 224 aa  209  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1118  lipoprotein releasing system ATP-binding ABC transporter  49.1 
 
 		 244 aa  209  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107348  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.23 
 
 		 225 aa  209  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711904  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2403  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.27 
 
 		 231 aa  208  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.017802  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1955  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.27 
 
 		 231 aa  208  4e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00212141  normal  0.0513198 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2392  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.27 
 
 		 231 aa  208  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000179176  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.27 
 
 		 231 aa  208  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.214498  normal  0.0731118 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1034  ABC transporter related  47.47 
 
 		 232 aa  208  5e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2397  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.5 
 
 		 232 aa  208  6e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1057  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.88 
 
 		 242 aa  207  9e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2638  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.85 
 
 		 249 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2670  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.43 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1564  ABC transporter related protein  47.27 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1041  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.76 
 
 		 249 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 		 221 aa  207  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0961  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.1 
 
 		 242 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00749478  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2583  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.85 
 
 		 249 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.484423  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  46.85 
 
 		 249 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1695  ABC transporter, ATP-binding protein  46.85 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3118  ABC transporter, ATP-binding protein  46.85 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2845  ABC transporter-related protein  48.85 
 
 		 246 aa  206  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  46.58 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2200  ABC transporter, ATP-binding protein  46.85 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50.25 
 
 		 234 aa  206  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1685  ABC transporter related  49.12 
 
 		 237 aa  205  5e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000384234  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50.25 
 
 		 234 aa  205  5e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.75 
 
 		 236 aa  205  5e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50.25 
 
 		 234 aa  205  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  45.7 
 
 		 256 aa  205  5e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1480  ATPase  48.23 
 
 		 235 aa  204  6e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1701  ATPase  46.76 
 
 		 240 aa  204  6e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.620814 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.95 
 
 		 230 aa  204  8e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.19 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1888  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.4 
 
 		 249 aa  204  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.64 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  46.64 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.64 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.64 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.64 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.64 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  46.61 
 
 		 227 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  46.61 
 
 		 646 aa  202  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2754  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.91 
 
 		 226 aa  202  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  46.64 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1077  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.13 
 
 		 244 aa  203  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0335181  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.64 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0943  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.61 
 
 		 227 aa  202  2e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.61 
 
 		 227 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  45.05 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3420  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.91 
 
 		 226 aa  202  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0399135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.64 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2131  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.05 
 
 		 253 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.099841  normal  0.052889 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2023  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.05 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  47.77 
 
 		 234 aa  202  3e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>