More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0086 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0086  ABC transporter related  100 
 
 
231 aa  459  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0522946  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3881  ABC transporter related  62.39 
 
 
229 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.770849  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3826  ABC transporter related  60.99 
 
 
225 aa  275  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3410  ABC transporter, ATPase subunit  61.47 
 
 
239 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.072759  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3559  ABC transporter related  62.61 
 
 
239 aa  269  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1471  ABC transporter related  60.54 
 
 
232 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4228  ABC transporter related  60.89 
 
 
229 aa  266  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  0.619304 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  61.61 
 
 
246 aa  266  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1841  ABC transporter related  58.3 
 
 
226 aa  264  7e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.656554  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2827  ABC transporter related  63.23 
 
 
243 aa  262  4e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1849  lipoprotein-releasing system (ABC transporter), ATP-binding protein lolD  59.73 
 
 
234 aa  252  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.115729  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3253  ABC transporter-related protein  56.5 
 
 
230 aa  238  9e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12235  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  53.33 
 
 
225 aa  221  4.9999999999999996e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.67 
 
 
227 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  47.79 
 
 
227 aa  218  7e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  52.02 
 
 
233 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  52.02 
 
 
233 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  52.02 
 
 
233 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  52.02 
 
 
233 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  52.02 
 
 
233 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.22 
 
 
236 aa  214  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  51.56 
 
 
233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2670  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.44 
 
 
233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  51.8 
 
 
224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  51.56 
 
 
233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  51.56 
 
 
233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  51.79 
 
 
224 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.56 
 
 
233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  51.56 
 
 
233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  51.56 
 
 
233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  51.56 
 
 
233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  51.56 
 
 
233 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1176  ABC transporter related  51.57 
 
 
225 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495851  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  51.11 
 
 
233 aa  210  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.98 
 
 
233 aa  211  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2039  ABC transporter related  52.02 
 
 
237 aa  209  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  50.23 
 
 
224 aa  208  5e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1377  ABC transporter related  52.94 
 
 
229 aa  208  6e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0531793  normal  0.0760119 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4410  ABC transporter related  51.56 
 
 
234 aa  208  6e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0776  ABC lipoprotein efflux transporter, ATPase subunit, LolD  51.8 
 
 
224 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.11 
 
 
230 aa  207  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  48.43 
 
 
227 aa  206  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  50.22 
 
 
223 aa  206  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  49.32 
 
 
230 aa  206  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  47.98 
 
 
227 aa  205  4e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.2 
 
 
234 aa  205  5e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2345  ABC transporter related  51.58 
 
 
223 aa  205  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.144574  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.2 
 
 
234 aa  205  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4146  ABC transporter related  50.22 
 
 
234 aa  205  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2784  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.77 
 
 
235 aa  204  6e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0359571  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3315  ABC transporter related  50.9 
 
 
227 aa  205  6e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.0682474 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.88 
 
 
234 aa  205  6e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.2 
 
 
234 aa  204  8e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  47.56 
 
 
234 aa  204  8e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1579  ABC transporter component  53.1 
 
 
252 aa  204  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132522  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.93 
 
 
239 aa  204  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1064  ABC transporter related  54.05 
 
 
236 aa  202  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.608919  normal  0.101956 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1845  ABC transporter related  51.58 
 
 
227 aa  202  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141516  normal  0.653489 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1194  ABC transporter related  54.05 
 
 
236 aa  202  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  49.55 
 
 
229 aa  202  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4461  ABC transporter related  51.56 
 
 
247 aa  202  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.856819  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0748  ABC transporter related  50.22 
 
 
227 aa  202  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2748  ABC transporter component  51.57 
 
 
231 aa  202  5e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00767275  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  47.98 
 
 
238 aa  202  5e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  48.87 
 
 
230 aa  201  6e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2476  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.87 
 
 
235 aa  201  6e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.55 
 
 
233 aa  201  6e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  50.22 
 
 
648 aa  201  6e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  50.22 
 
 
648 aa  201  7e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1473  ABC transporter, ATP-binding protein  48.87 
 
 
228 aa  201  7e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  49.1 
 
 
230 aa  201  8e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.75 
 
 
238 aa  201  8e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.98 
 
 
253 aa  201  8e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1042  ABC transporter related  50.67 
 
 
229 aa  201  9e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  49.78 
 
 
648 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  49.78 
 
 
648 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  49.78 
 
 
648 aa  200  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  49.78 
 
 
648 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1250  putative ATP-binding component of a transport system  47.98 
 
 
227 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.40949e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1766  ABC transporter related  52.7 
 
 
224 aa  200  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0656003  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  49.78 
 
 
648 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0941  ABC transporter related  51.79 
 
 
225 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  48.43 
 
 
235 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  49.78 
 
 
648 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1251  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.94 
 
 
238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.37 
 
 
233 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0747  ABC transporter related  48.43 
 
 
221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2810  ABC transporter related  48.44 
 
 
230 aa  199  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0257216  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.53 
 
 
253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0999  ABC transporter related  53.6 
 
 
236 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.115476 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3345  ABC transporter related  53.85 
 
 
237 aa  198  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  50 
 
 
648 aa  198  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.53 
 
 
253 aa  198  5e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  50 
 
 
648 aa  198  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  50 
 
 
648 aa  198  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  50 
 
 
648 aa  198  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  50 
 
 
648 aa  198  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4094  ABC transporter related  51.35 
 
 
226 aa  198  6e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0699  ABC transporter related  51.09 
 
 
229 aa  198  7e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (lipoprotein)  50.22 
 
 
229 aa  198  7.999999999999999e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00216433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>