More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11004 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11004  adhesion ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
237 aa  479  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.7798e-57  normal  0.515996 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  61.5 
 
 
235 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  54.84 
 
 
233 aa  236  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2017  ABC transporter related  56.94 
 
 
234 aa  236  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000531605 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  56.16 
 
 
234 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3044  ABC transporter related  57.01 
 
 
239 aa  232  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2431  ABC transporter related  57.01 
 
 
246 aa  230  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823093  decreased coverage  0.000192607 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1273  ABC transporter, ATPase subunit  57.89 
 
 
229 aa  229  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  54.5 
 
 
229 aa  225  4e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2188  ABC transporter, ATP-binding protein  56.46 
 
 
232 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1311  ABC transporter related  56.48 
 
 
243 aa  209  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.355082  normal  0.912591 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  45.97 
 
 
221 aa  201  9e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  48.83 
 
 
227 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  44.55 
 
 
225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  44.55 
 
 
225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  48.83 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1579  ABC transporter component  46.3 
 
 
252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132522  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  45.97 
 
 
237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  46.6 
 
 
234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  42.53 
 
 
234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  48.83 
 
 
230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  46.73 
 
 
226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  45.54 
 
 
231 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  40.18 
 
 
242 aa  195  5.000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  42.92 
 
 
224 aa  195  7e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  41.63 
 
 
235 aa  194  8.000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0217  ABC transporter related protein  47.14 
 
 
234 aa  193  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.941766  normal  0.16938 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  42.31 
 
 
231 aa  193  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  40.97 
 
 
242 aa  192  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  43.54 
 
 
241 aa  192  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  42.34 
 
 
234 aa  191  6e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  46.51 
 
 
388 aa  191  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  42.67 
 
 
233 aa  191  6e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0335  ABC transporter related  47.87 
 
 
248 aa  191  7e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000938347 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1212  ABC transporter related  45.05 
 
 
251 aa  191  8e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777209 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  46.15 
 
 
239 aa  190  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  43 
 
 
237 aa  191  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  46.67 
 
 
249 aa  191  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7810  ABC transporter related  48.26 
 
 
261 aa  190  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  45.07 
 
 
246 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  45.27 
 
 
240 aa  190  2e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3580  ABC transporter related protein  46.7 
 
 
254 aa  189  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.76 
 
 
236 aa  190  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  45.07 
 
 
231 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  47.26 
 
 
248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  48.47 
 
 
236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  42.2 
 
 
234 aa  189  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3212  cyclic nucleotide-binding protein  47.26 
 
 
388 aa  189  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 
246 aa  189  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1518  ABC transporter-related protein  44.93 
 
 
228 aa  189  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0437  ABC transporter related protein  45.41 
 
 
229 aa  189  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  47.42 
 
 
244 aa  189  5e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3555  ABC transporter, ATP-binding protein  46.45 
 
 
224 aa  188  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.287436  normal  0.628784 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1291  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  46.23 
 
 
235 aa  188  5e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.286185 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3203  ABC transporter related  46.67 
 
 
242 aa  189  5e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  42.52 
 
 
230 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0415  ABC transporter, ATPase subunit  44.91 
 
 
240 aa  188  5.999999999999999e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35006  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2540  ABC transporter related  45.02 
 
 
241 aa  188  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.656818  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  42.34 
 
 
234 aa  188  5.999999999999999e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1479  ABC transporter-related protein  43.17 
 
 
244 aa  188  7e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  42.06 
 
 
227 aa  188  7e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  42.92 
 
 
225 aa  188  8e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  43.33 
 
 
220 aa  187  9e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  44.59 
 
 
253 aa  187  9e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  44.29 
 
 
233 aa  187  9e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1689  ABC transporter related protein  50.72 
 
 
242 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0942959 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  44.1 
 
 
247 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0428  ABC transporter, ATPase subunit  46.31 
 
 
239 aa  187  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  44.76 
 
 
225 aa  187  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  45.5 
 
 
241 aa  187  1e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2270  ABC transporter related  46.63 
 
 
234 aa  187  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00112546  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0456  ABC transporter related  45.15 
 
 
229 aa  187  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1100  ABC transporter related  46.73 
 
 
235 aa  187  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1661  ABC transporter related  43.89 
 
 
247 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.044489  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  42.52 
 
 
230 aa  186  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0986  ABC transporter, ATPase subunit  40.95 
 
 
232 aa  187  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  47.57 
 
 
249 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1509  ABC transporter related  45.33 
 
 
248 aa  186  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (lipoprotein)  45.79 
 
 
229 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00216433  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0285  ABC transporter related  44.13 
 
 
246 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.0597012 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2966  ABC transporter-like protein  44.89 
 
 
234 aa  186  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  43.13 
 
 
230 aa  186  3e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02303  putative Lipoprotein releasing system ATP-binding component of ABC transporter  42.23 
 
 
232 aa  186  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  44.6 
 
 
238 aa  186  3e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  46.19 
 
 
249 aa  185  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1920  ABC transporter related  44.39 
 
 
235 aa  186  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  46.48 
 
 
253 aa  186  4e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  44.08 
 
 
241 aa  186  4e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  45.02 
 
 
230 aa  185  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2109  Sigma 54 interacting domain protein  47.66 
 
 
226 aa  185  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  46.41 
 
 
232 aa  185  6e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1176  ABC transporter related  44.29 
 
 
235 aa  185  6e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000377551 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  43.4 
 
 
246 aa  185  6e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  42.53 
 
 
259 aa  185  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  44.65 
 
 
252 aa  184  7e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  43.4 
 
 
319 aa  184  7e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0388  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.54 
 
 
235 aa  185  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  43.19 
 
 
228 aa  184  8e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3651  ABC transporter component  47.26 
 
 
237 aa  184  8e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1457  ABC transporter related  45.07 
 
 
228 aa  184  8e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>