More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001466 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
238 aa  494  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  89.45 
 
 
237 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1431  ABC transporter related  78.57 
 
 
227 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2658  ABC transporter-related protein  78.12 
 
 
227 aa  365  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3195  putative ABC transporter, ATP-binding protein  77.43 
 
 
227 aa  365  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  54.95 
 
 
230 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50.9 
 
 
234 aa  236  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5302  ABC transporter related  53.36 
 
 
234 aa  234  6e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.155471  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1662  ABC transporter related  52.91 
 
 
234 aa  231  6e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.822676  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2507  ABC transporter related  49.55 
 
 
231 aa  230  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5040  ABC transporter, ATP-binding protein  51.9 
 
 
246 aa  229  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0855  ABC transporter related  54.23 
 
 
228 aa  226  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00113999  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2375  ABC-type transport system, ATPase component  50 
 
 
229 aa  225  6e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797432  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0433  ABC transporter related  54.05 
 
 
233 aa  224  7e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  49.55 
 
 
237 aa  221  7e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4048  ABC transporter-related protein  49.77 
 
 
237 aa  221  8e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4081  ABC transporter related  49.77 
 
 
237 aa  221  8e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3939  ABC transporter, ATPase subunit  49.32 
 
 
236 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.920707  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2653  ABC transporter, ATP-binding protein  50.5 
 
 
214 aa  214  7e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.670995  normal  0.0652814 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  47.47 
 
 
237 aa  213  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  48.86 
 
 
231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  47.49 
 
 
230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  46.29 
 
 
242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  48.2 
 
 
266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  44.59 
 
 
239 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29510  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.06 
 
 
250 aa  209  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  47.49 
 
 
231 aa  209  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  45.76 
 
 
241 aa  208  6e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  46.4 
 
 
221 aa  208  7e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2019  ABC transporter related protein  44.84 
 
 
228 aa  207  9e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0275435  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  46.61 
 
 
226 aa  207  9e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  45.29 
 
 
224 aa  207  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  45.29 
 
 
224 aa  207  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  45.29 
 
 
224 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1802  ABC transporter related  48.28 
 
 
234 aa  207  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  45.78 
 
 
252 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  45.29 
 
 
224 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  46.15 
 
 
252 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  47.09 
 
 
228 aa  207  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  43.17 
 
 
260 aa  206  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  47.32 
 
 
227 aa  206  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  42.68 
 
 
249 aa  206  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  47.12 
 
 
228 aa  206  3e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2540  ABC transporter related  45.09 
 
 
241 aa  206  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.656818  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0756  ABC transporter related  48.2 
 
 
226 aa  206  3e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.688421  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  44.64 
 
 
246 aa  206  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  44.84 
 
 
224 aa  205  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  44.84 
 
 
224 aa  205  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  44.84 
 
 
224 aa  205  4e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3285  ABC transporter related  47.73 
 
 
249 aa  205  5e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  41.18 
 
 
240 aa  205  5e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2437  ABC transporter related  44.29 
 
 
231 aa  205  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  46.85 
 
 
222 aa  205  6e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  46.82 
 
 
229 aa  204  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19670  ABC transporter related  45.5 
 
 
232 aa  204  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  46.08 
 
 
239 aa  204  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2904  ABC transporter-like protein  47.96 
 
 
224 aa  204  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.108903 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  45.29 
 
 
224 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0461  ABC transporter-related protein  46.85 
 
 
227 aa  204  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.880159  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  44.39 
 
 
220 aa  203  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.271834 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  44.2 
 
 
242 aa  203  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  43.95 
 
 
224 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  44.39 
 
 
224 aa  203  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  44.25 
 
 
244 aa  203  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3170  ABC transporter related protein  47.5 
 
 
217 aa  203  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0178954  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  44.75 
 
 
248 aa  202  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  47.27 
 
 
229 aa  202  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  46.4 
 
 
225 aa  202  3e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  44.75 
 
 
248 aa  202  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1893  ABC transporter related  45.5 
 
 
225 aa  202  4e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3559  ABC transporter related  46.22 
 
 
239 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  45 
 
 
242 aa  201  6e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2531  ABC transporter related  46.15 
 
 
228 aa  201  6e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.799962  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1457  ABC transporter related  46.12 
 
 
228 aa  201  7e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  43.5 
 
 
224 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  43.75 
 
 
225 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  43.75 
 
 
225 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  44.44 
 
 
225 aa  200  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3149  ABC transporter related  44.09 
 
 
563 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  43.95 
 
 
228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0425  ABC transporter related  46.22 
 
 
234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  44.24 
 
 
231 aa  199  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  46.36 
 
 
231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  46.85 
 
 
668 aa  200  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  46.85 
 
 
668 aa  200  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6690  ABC transporter, ATPase subunit  45.25 
 
 
234 aa  199  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.810231  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  47.2 
 
 
288 aa  199  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4072  ABC transporter related  44.26 
 
 
253 aa  199  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  45.05 
 
 
239 aa  199  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2391  ABC transporter related  47.27 
 
 
253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0723  ABC transporter-related protein  45.09 
 
 
240 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  44.64 
 
 
388 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  47.06 
 
 
233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  45.91 
 
 
230 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3826  ABC transporter related  45.25 
 
 
225 aa  198  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  42.79 
 
 
244 aa  198  5e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  44.59 
 
 
232 aa  198  6e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1414  ATPase  44.69 
 
 
241 aa  198  6e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  45.45 
 
 
715 aa  198  6e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  42.86 
 
 
280 aa  198  6e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>