More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4094 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4094  ABC transporter related  100 
 
 
226 aa  448  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  52.47 
 
 
230 aa  244  9e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  52.73 
 
 
224 aa  238  8e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  52.73 
 
 
224 aa  238  8e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  52.73 
 
 
224 aa  236  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  52.05 
 
 
248 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  52.27 
 
 
224 aa  236  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  52.05 
 
 
248 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  51.82 
 
 
224 aa  235  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  51.82 
 
 
224 aa  234  7e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  51.82 
 
 
224 aa  234  7e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  51.82 
 
 
224 aa  234  7e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  51.82 
 
 
224 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  51.36 
 
 
228 aa  232  4.0000000000000004e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  51.36 
 
 
224 aa  231  5e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  50.45 
 
 
224 aa  229  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  52.65 
 
 
663 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4028  ABC transporter related  58.71 
 
 
228 aa  229  3e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  51.16 
 
 
235 aa  228  5e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  48.9 
 
 
235 aa  228  6e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  51.6 
 
 
226 aa  228  7e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  52.21 
 
 
663 aa  227  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  51.14 
 
 
226 aa  226  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  51.14 
 
 
226 aa  227  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  52.63 
 
 
654 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  51.15 
 
 
242 aa  226  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  52.7 
 
 
648 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  52.7 
 
 
648 aa  225  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  52.7 
 
 
648 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  52.7 
 
 
648 aa  225  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  52.7 
 
 
648 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  50 
 
 
230 aa  225  4e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  51.1 
 
 
252 aa  225  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  52.73 
 
 
222 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  51.14 
 
 
226 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  50 
 
 
229 aa  224  6e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  50.44 
 
 
259 aa  224  7e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  51.14 
 
 
226 aa  224  8e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  51.14 
 
 
226 aa  224  8e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 
226 aa  223  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 
226 aa  223  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  50.68 
 
 
226 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 
226 aa  223  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 
226 aa  223  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  50.68 
 
 
226 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2219  ABC transporter related  49.12 
 
 
652 aa  223  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  50.68 
 
 
246 aa  223  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5200  putative ABC transporter, ATP binding component  54.09 
 
 
238 aa  222  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0864003  normal  0.0646011 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  47.27 
 
 
266 aa  222  4e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3983  ABC transporter related  54.79 
 
 
233 aa  221  4.9999999999999996e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3521  ABC transporter related protein  52.27 
 
 
254 aa  221  4.9999999999999996e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.185776 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  50.23 
 
 
224 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0747  ABC transporter related  50.23 
 
 
221 aa  221  4.9999999999999996e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  51.35 
 
 
646 aa  221  4.9999999999999996e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  49.12 
 
 
254 aa  221  8e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  50.68 
 
 
244 aa  221  8e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  50 
 
 
225 aa  221  9e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  50.45 
 
 
648 aa  220  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  52.51 
 
 
242 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0595  ATPase  51.14 
 
 
228 aa  220  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0833962  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  54.88 
 
 
240 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  49.55 
 
 
226 aa  220  1.9999999999999999e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  49.09 
 
 
247 aa  220  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  47.49 
 
 
236 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  50 
 
 
226 aa  220  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 
233 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  51.75 
 
 
661 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  49.12 
 
 
252 aa  219  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  50.45 
 
 
239 aa  219  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  49.78 
 
 
649 aa  219  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4456  ABC transporter related protein  56.88 
 
 
239 aa  219  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  49.78 
 
 
253 aa  219  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  52.68 
 
 
233 aa  219  3.9999999999999997e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 
236 aa  218  3.9999999999999997e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  50.23 
 
 
228 aa  218  3.9999999999999997e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  47.73 
 
 
225 aa  218  5e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  48.64 
 
 
225 aa  218  5e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  50.91 
 
 
644 aa  218  6e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  50.88 
 
 
654 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  53.46 
 
 
241 aa  218  7e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  52 
 
 
291 aa  218  7e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  49.33 
 
 
649 aa  217  8.999999999999998e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3735  ABC transporter related  56.16 
 
 
233 aa  217  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  52.26 
 
 
260 aa  217  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1414  ATPase  49.12 
 
 
241 aa  217  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  50.68 
 
 
230 aa  217  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  47.93 
 
 
229 aa  216  2e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  49.77 
 
 
239 aa  216  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  48.85 
 
 
244 aa  216  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0199  ABC transporter related  54.67 
 
 
291 aa  216  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.500002  normal  0.26855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  48.88 
 
 
220 aa  216  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  49.77 
 
 
232 aa  216  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  47.51 
 
 
228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  49.78 
 
 
236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  51.82 
 
 
648 aa  215  5e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  51.35 
 
 
648 aa  215  5e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  48.42 
 
 
237 aa  215  5e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27880  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50.45 
 
 
235 aa  215  5.9999999999999996e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal  0.542219 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  50.23 
 
 
238 aa  215  5.9999999999999996e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  49.55 
 
 
230 aa  214  7e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>