More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3735 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3735  ABC transporter related  100 
 
 		 233 aa  463  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3983  ABC transporter related  79.28 
 
 		 233 aa  352  2e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4028  ABC transporter related  69.03 
 
 		 228 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60790  ABC transporter ATP-binding protein  62.9 
 
 		 228 aa  278  5e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5234  ABC transporter ATP-binding protein  63.35 
 
 		 237 aa  277  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0892  ABC transporter related  65.78 
 
 		 221 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.783252 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5200  putative ABC transporter, ATP binding component  56.25 
 
 		 238 aa  244  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0864003  normal  0.0646011 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  56.62 
 
 		 233 aa  235  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  52.05 
 
 		 224 aa  230  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0038  ABC transporter ATP-binding protein  50.23 
 
 		 221 aa  229  2e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  49.1 
 
 		 235 aa  228  6e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  50.23 
 
 		 226 aa  228  9e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4094  ABC transporter related  56.16 
 
 		 226 aa  227  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  50.23 
 
 		 226 aa  227  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 226 aa  226  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  52.49 
 
 		 252 aa  226  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  50.23 
 
 		 226 aa  226  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0411  ABC transporter related  55.4 
 
 		 287 aa  226  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 226 aa  226  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 226 aa  226  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  49.77 
 
 		 226 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 226 aa  226  3e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 226 aa  226  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  49.77 
 
 		 226 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 226 aa  225  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  51.15 
 
 		 238 aa  225  5.0000000000000005e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 		 224 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  50.68 
 
 		 224 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  50.68 
 
 		 224 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 		 224 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 		 224 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  50.68 
 
 		 224 aa  225  6e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 		 224 aa  225  6e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  49.32 
 
 		 226 aa  224  7e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2850  hypothetical protein  52.97 
 
 		 229 aa  224  9e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  50.23 
 
 		 224 aa  224  9e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2990  hypothetical protein  52.97 
 
 		 229 aa  224  1e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  48.4 
 
 		 237 aa  223  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0961  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.07 
 
 		 242 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00749478  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1057  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.07 
 
 		 242 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  49.77 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  49.55 
 
 		 242 aa  223  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2202  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 		 227 aa  223  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.15426 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  50.23 
 
 		 224 aa  222  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  48.86 
 
 		 266 aa  222  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  51.6 
 
 		 230 aa  223  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  49.09 
 
 		 226 aa  222  4e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1118  lipoprotein releasing system ATP-binding ABC transporter  51.57 
 
 		 244 aa  222  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107348  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  50.23 
 
 		 224 aa  222  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  49.33 
 
 		 224 aa  222  4e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2406  ABC transporter related  49.55 
 
 		 247 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  51.6 
 
 		 248 aa  221  9e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  49.56 
 
 		 258 aa  221  9.999999999999999e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  51.14 
 
 		 248 aa  220  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  50.67 
 
 		 715 aa  220  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  51.14 
 
 		 248 aa  220  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  48.85 
 
 		 237 aa  219  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3231  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.35 
 
 		 258 aa  219  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.15277  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3374  ABC efflux transporter, ATPase subunit  57.79 
 
 		 211 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  49.77 
 
 		 240 aa  219  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0268  ABC transporter related  52.51 
 
 		 277 aa  218  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000875319 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  50.68 
 
 		 277 aa  218  6e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4456  ABC transporter related protein  55.87 
 
 		 239 aa  218  6e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  49.77 
 
 		 239 aa  218  7e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  49.77 
 
 		 230 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  49.33 
 
 		 225 aa  218  7.999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2425  ABC transporter related  52.4 
 
 		 228 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1041  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.78 
 
 		 249 aa  218  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  49.07 
 
 		 236 aa  218  7.999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  49.34 
 
 		 252 aa  218  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4296  ABC transporter related  54.34 
 
 		 242 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0438871  normal  0.557698 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  50.45 
 
 		 247 aa  217  1e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  47.16 
 
 		 251 aa  217  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1015  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.31 
 
 		 224 aa  217  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  46.82 
 
 		 229 aa  217  1e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  52.97 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3214  ABC transporter related  49.77 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.418962  normal  0.11192 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.22 
 
 		 238 aa  216  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  48.87 
 
 		 238 aa  216  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0747  ABC transporter related  50.23 
 
 		 221 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  51.82 
 
 		 229 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  49.78 
 
 		 234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  50.91 
 
 		 230 aa  216  2.9999999999999998e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  52.05 
 
 		 244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  49.09 
 
 		 237 aa  215  4e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8342  ABC transporter related  52.78 
 
 		 234 aa  215  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  49.77 
 
 		 247 aa  215  5e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.95 
 
 		 233 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4034  ABC transporter related  52.42 
 
 		 236 aa  214  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.530357  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0366  ABC-type transport system, ATPase component PhnL  52.73 
 
 		 245 aa  214  7e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  47.96 
 
 		 225 aa  214  8e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  49.78 
 
 		 225 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  50.23 
 
 		 220 aa  214  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0318  ABC transporter related  51.87 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  48.42 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  49.78 
 
 		 238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.2 
 
 		 231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  47.53 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  48.9 
 
 		 653 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1889  ABC transporter related  50.23 
 
 		 238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.236618  normal  0.569597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>