More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0318 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0318  ABC transporter related  100 
 
 
229 aa  464  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  58.82 
 
 
225 aa  271  5.000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  57.53 
 
 
266 aa  266  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  54.91 
 
 
230 aa  266  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  53.6 
 
 
248 aa  265  4e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  57.47 
 
 
225 aa  263  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  54.84 
 
 
226 aa  263  2e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  54.84 
 
 
244 aa  263  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  55.45 
 
 
247 aa  262  3e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  55.05 
 
 
228 aa  260  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  53.85 
 
 
242 aa  259  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  55.41 
 
 
254 aa  259  2e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  55.96 
 
 
246 aa  259  3e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  53.39 
 
 
239 aa  256  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  52.44 
 
 
260 aa  255  4e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  53.12 
 
 
252 aa  255  4e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  53.21 
 
 
236 aa  255  4e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  54.95 
 
 
239 aa  254  8e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  52.94 
 
 
244 aa  254  9e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  53.85 
 
 
224 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  53.85 
 
 
224 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  53.85 
 
 
224 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  54.3 
 
 
224 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  53.85 
 
 
224 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  53.7 
 
 
228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  53.64 
 
 
255 aa  253  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  54.3 
 
 
224 aa  252  3e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  53.39 
 
 
224 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  53.39 
 
 
224 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  53.39 
 
 
224 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  53.39 
 
 
224 aa  251  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  50.93 
 
 
228 aa  251  9.000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  53.42 
 
 
229 aa  250  1e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  56.22 
 
 
235 aa  250  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  54.13 
 
 
227 aa  250  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  54.3 
 
 
230 aa  250  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  52.29 
 
 
228 aa  250  1e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  53.6 
 
 
232 aa  249  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  52.31 
 
 
229 aa  249  2e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  52.94 
 
 
224 aa  249  3e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  53.85 
 
 
226 aa  249  3e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  53.67 
 
 
233 aa  248  4e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  53.24 
 
 
236 aa  248  4e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  50.9 
 
 
252 aa  248  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  51.38 
 
 
242 aa  248  5e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  54.3 
 
 
233 aa  248  6e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  54.17 
 
 
291 aa  248  6e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  52.75 
 
 
234 aa  248  6e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  52.75 
 
 
234 aa  248  6e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  53.85 
 
 
226 aa  248  7e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  53.39 
 
 
226 aa  247  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1766  ATPase  55.35 
 
 
228 aa  247  1e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104306  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  53.39 
 
 
226 aa  246  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4296  ABC transporter related  53.64 
 
 
242 aa  246  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0438871  normal  0.557698 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  53.39 
 
 
226 aa  246  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0433  ATPase  53.77 
 
 
228 aa  246  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.526748  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  52.7 
 
 
277 aa  246  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  53.39 
 
 
226 aa  246  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3270  ABC transporter-like protein  52.49 
 
 
248 aa  246  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.180128 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04881  ABC transporter ATP-binding protein  54.88 
 
 
235 aa  246  2e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134366  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  52.94 
 
 
226 aa  246  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  52.94 
 
 
226 aa  246  3e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  52.94 
 
 
226 aa  246  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  52.94 
 
 
226 aa  246  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  52.94 
 
 
226 aa  246  3e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  53.15 
 
 
241 aa  245  4.9999999999999997e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  52.51 
 
 
231 aa  244  6e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  52 
 
 
238 aa  244  6e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1451  ABC transporter related  53.85 
 
 
254 aa  244  6.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.388057  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04891  ABC transporter ATP-binding protein  53.02 
 
 
228 aa  244  6.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04581  ABC transporter ATP-binding protein  53.3 
 
 
228 aa  244  8e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1024  ABC transporter related  53.39 
 
 
234 aa  244  9e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.306992 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  52.49 
 
 
230 aa  244  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  50.92 
 
 
237 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4286  ABC transporter-related protein  53.21 
 
 
241 aa  243  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  54.72 
 
 
228 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  50.46 
 
 
240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4308  ABC transporter related  52.75 
 
 
241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  52.49 
 
 
226 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4155  ABC transporter, ATPase subunit  52.75 
 
 
241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  55.19 
 
 
228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  53.42 
 
 
715 aa  243  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  52 
 
 
236 aa  242  3e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  52.05 
 
 
225 aa  242  3.9999999999999997e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0222  ABC transporter related  52.04 
 
 
247 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256244  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  51.34 
 
 
253 aa  241  5e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1414  ATPase  52 
 
 
241 aa  241  5e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  50.92 
 
 
238 aa  241  5e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0211  ABC transporter related  52.94 
 
 
256 aa  241  6e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0199  ABC transporter related  54.63 
 
 
291 aa  241  7e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.500002  normal  0.26855 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  51.35 
 
 
232 aa  241  9e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  53.24 
 
 
244 aa  241  9e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0229  ABC transporter related  52.97 
 
 
264 aa  240  2e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.772392  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  49.1 
 
 
259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0595  ATPase  51.15 
 
 
228 aa  239  2.9999999999999997e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0833962  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0366  ABC-type transport system, ATPase component PhnL  51.35 
 
 
245 aa  238  5e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1767  ATPase  51.42 
 
 
248 aa  238  5e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132988  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  49.54 
 
 
248 aa  238  5e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  51.13 
 
 
233 aa  238  5e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  49.54 
 
 
248 aa  238  5e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>