More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0892 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0892  ABC transporter related  100 
 
 		 221 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.783252 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3983  ABC transporter related  69.52 
 
 		 233 aa  287  8e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3735  ABC transporter related  65.78 
 
 		 233 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4028  ABC transporter related  64.35 
 
 		 228 aa  270  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60790  ABC transporter ATP-binding protein  60.37 
 
 		 228 aa  247  9e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5234  ABC transporter ATP-binding protein  60.37 
 
 		 237 aa  244  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5200  putative ABC transporter, ATP binding component  54.5 
 
 		 238 aa  222  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0864003  normal  0.0646011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  57.5 
 
 		 277 aa  219  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3214  ABC transporter related  50.92 
 
 		 233 aa  212  2.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.418962  normal  0.11192 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  51.26 
 
 		 242 aa  212  3.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2583  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.54 
 
 		 249 aa  210  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.484423  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  46.82 
 
 		 238 aa  210  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1695  ABC transporter, ATP-binding protein  53.54 
 
 		 227 aa  210  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1888  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.54 
 
 		 249 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  51.78 
 
 		 237 aa  210  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2200  ABC transporter, ATP-binding protein  53.54 
 
 		 240 aa  210  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2638  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.54 
 
 		 249 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3118  ABC transporter, ATP-binding protein  53.54 
 
 		 240 aa  210  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  53.54 
 
 		 249 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  47.47 
 
 		 236 aa  209  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  53.37 
 
 		 233 aa  208  4e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  51.27 
 
 		 237 aa  209  4e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2023  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.03 
 
 		 231 aa  208  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2150  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53.03 
 
 		 252 aa  208  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0659015  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  50 
 
 		 237 aa  207  7e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3521  ABC transporter related protein  52.53 
 
 		 254 aa  207  8e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.185776 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  51.01 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2439  ABC transporter related  54.73 
 
 		 280 aa  207  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0411  ABC transporter related  53.77 
 
 		 287 aa  206  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5419  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.53 
 
 		 252 aa  206  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.912303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2042  ABC transporter-related protein  47.93 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  52.53 
 
 		 227 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0268  ABC transporter related  55.33 
 
 		 277 aa  206  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000875319 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4094  ABC transporter related  56.28 
 
 		 226 aa  206  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5964  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.53 
 
 		 253 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115719  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 		 253 aa  206  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2113  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.53 
 
 		 253 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0436359  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2131  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.53 
 
 		 253 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.099841  normal  0.052889 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4034  ABC transporter related  52.05 
 
 		 236 aa  206  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.530357  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.97 
 
 		 236 aa  205  4e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  43.75 
 
 		 235 aa  205  5e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  51.58 
 
 		 227 aa  205  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1567  ABC lipoprotein efflux pump, ATPase subunit  52.53 
 
 		 247 aa  204  8e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  46.08 
 
 		 266 aa  204  8e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8342  ABC transporter related  54.31 
 
 		 234 aa  204  9e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1604  ABC transporter related  54.37 
 
 		 242 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2270  ABC transporter related  51.12 
 
 		 250 aa  203  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2566  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.02 
 
 		 247 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0799342  normal  0.05105 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  47.98 
 
 		 226 aa  204  1e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1041  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  54.04 
 
 		 249 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1157  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.52 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.572225  normal  0.0166271 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  48.85 
 
 		 242 aa  203  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  48.4 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  50.76 
 
 		 246 aa  203  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1889  ABC transporter related  48.86 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.236618  normal  0.569597 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  47 
 
 		 234 aa  202  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  46.67 
 
 		 260 aa  202  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  49.55 
 
 		 238 aa  202  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3351  ABC transporter related  50 
 
 		 230 aa  202  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  49.75 
 
 		 242 aa  202  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  49.25 
 
 		 715 aa  202  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1167  ABC transporter related  52.48 
 
 		 235 aa  202  5e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2425  ABC transporter related  53.47 
 
 		 228 aa  202  5e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  49.09 
 
 		 229 aa  202  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2150  ABC transporter related  49.77 
 
 		 242 aa  201  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0225  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.75 
 
 		 235 aa  201  7e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  46.08 
 
 		 240 aa  201  7e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  51.52 
 
 		 237 aa  201  8e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  50.76 
 
 		 220 aa  201  8e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  48.86 
 
 		 247 aa  201  9e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  44.7 
 
 		 229 aa  201  9e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 228 aa  201  9e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1445  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 		 247 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3180  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  55.05 
 
 		 234 aa  200  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1542  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.25 
 
 		 237 aa  200  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  47.47 
 
 		 229 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2094  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.53 
 
 		 225 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0980636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 240 aa  200  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  51.52 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4308  ABC transporter related  52.05 
 
 		 241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  49.25 
 
 		 235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  53.3 
 
 		 239 aa  199  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4155  ABC transporter, ATPase subunit  52.05 
 
 		 241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  49.08 
 
 		 233 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  51.52 
 
 		 234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  52.53 
 
 		 233 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  51.52 
 
 		 234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  50 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4286  ABC transporter-related protein  51.6 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.85 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0961  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.53 
 
 		 242 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00749478  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  53.3 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1057  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  52.53 
 
 		 242 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  50.68 
 
 		 227 aa  199  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  47.74 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1211  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.52 
 
 		 225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  46.82 
 
 		 249 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  50.76 
 
 		 231 aa  199  3.9999999999999996e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>