More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1900 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  100 
 
 
234 aa  478  1e-134  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  71.43 
 
 
240 aa  343  1e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0308  ABC transporter ATP-binding protein  65.18 
 
 
237 aa  306  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0332817 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0095  ABC transporter related  66.22 
 
 
235 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0080  ABC transporter related  67.12 
 
 
235 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2119  ABC transporter, ATP-binding protein  66.08 
 
 
241 aa  290  9e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0329  putative ABC transport system, ATP-binding protein  55.11 
 
 
226 aa  268  4e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4838  ABC transporter related  58.74 
 
 
225 aa  267  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4589  ABC transporter related protein  58.3 
 
 
225 aa  266  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00504379  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4416  ABC transporter, ATP-binding protein  55.16 
 
 
244 aa  266  2.9999999999999995e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  55.56 
 
 
230 aa  265  2.9999999999999995e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  58.26 
 
 
219 aa  263  1e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  56.16 
 
 
220 aa  263  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1330  ABC transporter related  56.05 
 
 
235 aa  261  6e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.514657  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4072  ABC transporter related  57.4 
 
 
253 aa  259  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  55.25 
 
 
220 aa  259  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0956  ABC transporter related  55.8 
 
 
229 aa  259  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0775  ABC transporter, ATP-binding protein  57.89 
 
 
243 aa  258  6e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2991  ABC transporter related  56.05 
 
 
246 aa  256  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0898  ABC transporter related  55.61 
 
 
232 aa  256  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3722  ABC transporter related  56.5 
 
 
263 aa  256  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.323053 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3364  ABC transporter related  55.61 
 
 
243 aa  256  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0573  ABC transporter, ATP-binding protein  51.3 
 
 
253 aa  254  6e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0863  ABC transporter related  55.16 
 
 
246 aa  254  9e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3159  ABC transporter related  55.16 
 
 
246 aa  254  9e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3260  ABC transporter related  55.16 
 
 
246 aa  254  9e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  52.25 
 
 
225 aa  253  1.0000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2864  ABC transporter related  55.25 
 
 
230 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2850  ABC transporter related  55.25 
 
 
240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0723  ABC transporter-related protein  57.08 
 
 
240 aa  252  3e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3692  ABC transporter, ATP-binding protein  54.71 
 
 
246 aa  251  5.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1031  ABC transporter related  55.16 
 
 
246 aa  251  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3501  ABC transporter related  53.02 
 
 
241 aa  251  5.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3341  ABC transporter related  55.16 
 
 
247 aa  251  6e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0998  ABC transporter related  55.16 
 
 
247 aa  251  7e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1019  ABC transporter related  55.16 
 
 
247 aa  251  7e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2239  ABC transporter related  51.1 
 
 
233 aa  250  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0471  ABC transporter related  53.36 
 
 
236 aa  249  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  54.78 
 
 
238 aa  249  3e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  55.8 
 
 
238 aa  246  2e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  55.11 
 
 
258 aa  245  4.9999999999999997e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  53.15 
 
 
225 aa  244  6e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  52.68 
 
 
228 aa  244  9e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  50.66 
 
 
228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  52.86 
 
 
237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  51.58 
 
 
230 aa  242  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  50.66 
 
 
248 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  50.45 
 
 
237 aa  241  6e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  51.35 
 
 
242 aa  241  7e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2406  ABC transporter related  51.38 
 
 
247 aa  240  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  50.66 
 
 
230 aa  239  4e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  48.7 
 
 
235 aa  235  4e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  48.46 
 
 
236 aa  234  6e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  52.61 
 
 
233 aa  234  7e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  51.15 
 
 
228 aa  234  9e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  53.21 
 
 
253 aa  233  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  48.47 
 
 
238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2600  ABC transporter related  54.34 
 
 
227 aa  233  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  48.26 
 
 
260 aa  232  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  53.21 
 
 
253 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  51.39 
 
 
246 aa  232  4.0000000000000004e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  50.9 
 
 
235 aa  231  5e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  52.75 
 
 
244 aa  231  7.000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  50.23 
 
 
224 aa  231  9e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  50.23 
 
 
224 aa  231  9e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  50.67 
 
 
255 aa  230  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3506  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 
238 aa  230  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2038  ABC transporter related  51.82 
 
 
233 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.376795  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  50.91 
 
 
234 aa  229  3e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  48.21 
 
 
244 aa  229  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  49.32 
 
 
224 aa  229  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  51.8 
 
 
233 aa  229  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  50.91 
 
 
234 aa  229  3e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  48.86 
 
 
231 aa  228  5e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  49.1 
 
 
266 aa  228  5e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  46.55 
 
 
236 aa  228  6e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  50.23 
 
 
224 aa  228  6e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  46.85 
 
 
239 aa  228  6e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 
224 aa  228  7e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  49.78 
 
 
239 aa  228  7e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4308  ABC transporter related  51.12 
 
 
241 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2042  ABC transporter-related protein  50.23 
 
 
236 aa  227  1e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  50.23 
 
 
224 aa  227  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4155  ABC transporter, ATPase subunit  51.12 
 
 
241 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  49.33 
 
 
232 aa  227  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0384  ABC transporter related protein  45.11 
 
 
237 aa  227  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  47.16 
 
 
236 aa  226  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  46.52 
 
 
242 aa  226  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  49.32 
 
 
224 aa  226  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  49.32 
 
 
224 aa  226  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  49.32 
 
 
224 aa  226  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  51.12 
 
 
236 aa  227  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 
224 aa  226  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  46.96 
 
 
244 aa  226  3e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  51.98 
 
 
233 aa  226  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  47.75 
 
 
227 aa  226  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  46.15 
 
 
230 aa  226  3e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4286  ABC transporter-related protein  50.67 
 
 
241 aa  225  4e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  54.41 
 
 
236 aa  225  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  49.33 
 
 
233 aa  225  4e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>