More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_4028 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_4028  ABC transporter related  100 
 
 		 228 aa  454  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3983  ABC transporter related  71.95 
 
 		 233 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3735  ABC transporter related  69.64 
 
 		 233 aa  284  7e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0892  ABC transporter related  64.35 
 
 		 221 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.783252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5234  ABC transporter ATP-binding protein  59.46 
 
 		 237 aa  241  6e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60790  ABC transporter ATP-binding protein  59.28 
 
 		 228 aa  241  9e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4094  ABC transporter related  58.71 
 
 		 226 aa  229  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  52.7 
 
 		 277 aa  228  5e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  47.14 
 
 		 235 aa  228  5e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  50 
 
 		 224 aa  227  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  50 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5200  putative ABC transporter, ATP binding component  58.05 
 
 		 238 aa  226  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0864003  normal  0.0646011 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  48.65 
 
 		 715 aa  222  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  52.51 
 
 		 252 aa  221  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  51.87 
 
 		 242 aa  220  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0268  ABC transporter related  56.78 
 
 		 277 aa  219  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000875319 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  49.32 
 
 		 244 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8342  ABC transporter related  57.71 
 
 		 234 aa  219  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  49.1 
 
 		 251 aa  218  5e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  48.64 
 
 		 246 aa  216  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0411  ABC transporter related  58.79 
 
 		 287 aa  216  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  49.33 
 
 		 238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0747  ABC transporter related  48.4 
 
 		 221 aa  215  5e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0038  ABC transporter ATP-binding protein  48.4 
 
 		 221 aa  215  5e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  50.67 
 
 		 228 aa  214  9e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  48.2 
 
 		 238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  49.33 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  46.4 
 
 		 260 aa  211  5.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  48.87 
 
 		 248 aa  211  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  50.45 
 
 		 244 aa  211  7.999999999999999e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  48.87 
 
 		 248 aa  211  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2811  ABC transporter, ATP-binding protein  48.4 
 
 		 223 aa  211  9e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0179867  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  48.42 
 
 		 242 aa  211  9e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  49.31 
 
 		 220 aa  211  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3083  ABC transporter, ATP-binding protein  49.55 
 
 		 223 aa  210  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.760416  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2771  ABC transporter, ATP-binding protein  49.09 
 
 		 223 aa  211  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3064  ABC transporter, ATP-binding protein  48.86 
 
 		 227 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3081  ABC transporter, ATP-binding protein  49.09 
 
 		 223 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.501337  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2990  hypothetical protein  47.73 
 
 		 229 aa  209  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2850  hypothetical protein  47.73 
 
 		 229 aa  210  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  49.75 
 
 		 236 aa  209  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  50 
 
 		 233 aa  209  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  48.85 
 
 		 242 aa  210  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4456  ABC transporter related protein  57.64 
 
 		 239 aa  209  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  46.61 
 
 		 225 aa  210  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  50 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2837  ABC transporter ATP-binding protein  48.86 
 
 		 223 aa  209  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000357321  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0318  ABC transporter related  48.25 
 
 		 229 aa  209  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3052  ABC transporter ATP-binding protein  48.86 
 
 		 223 aa  209  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  44.7 
 
 		 229 aa  209  3e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  46.61 
 
 		 231 aa  208  5e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  44.55 
 
 		 237 aa  208  6e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  46.61 
 
 		 226 aa  208  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  45.91 
 
 		 266 aa  208  7e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  46.61 
 
 		 226 aa  208  7e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0612  ABC transporter related  46.88 
 
 		 228 aa  208  7e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0037706  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  53.5 
 
 		 233 aa  207  7e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2199  ABC transporter, ATP-binding protein  48.64 
 
 		 221 aa  208  7e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517578  hitchhiker  0.0000000011345 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  53.47 
 
 		 228 aa  207  7e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  48.62 
 
 		 237 aa  207  8e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  46.15 
 
 		 226 aa  207  8e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  47.32 
 
 		 234 aa  207  8e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  46.15 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  47.95 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  46.15 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  49.1 
 
 		 229 aa  207  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 		 232 aa  206  2e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  54.46 
 
 		 238 aa  207  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1414  ATPase  48.7 
 
 		 241 aa  206  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  48.86 
 
 		 244 aa  207  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2202  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.75 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.15426 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  49.09 
 
 		 248 aa  206  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  50.88 
 
 		 253 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1211  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  50.48 
 
 		 247 aa  206  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  53 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  45.7 
 
 		 226 aa  206  4e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3382  ABC transporter related  48.21 
 
 		 225 aa  205  4e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2439  ABC transporter related  54.27 
 
 		 280 aa  205  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2406  ABC transporter related  47.06 
 
 		 247 aa  206  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  53 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  53 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  53 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  50.92 
 
 		 241 aa  205  5e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0961  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.98 
 
 		 242 aa  205  5e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00749478  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  50.88 
 
 		 253 aa  205  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  53 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  53 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  49.77 
 
 		 658 aa  205  5e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  53 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1057  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.98 
 
 		 242 aa  205  5e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  53 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  55.5 
 
 		 227 aa  204  7e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.79 
 
 		 258 aa  204  7e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.37 
 
 		 239 aa  204  8e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  53.5 
 
 		 233 aa  204  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>