More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5200 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5200  putative ABC transporter, ATP binding component  100 
 
 
238 aa  473  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0864003  normal  0.0646011 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2850  hypothetical protein  55.11 
 
 
229 aa  237  2e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2990  hypothetical protein  55.11 
 
 
229 aa  236  3e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3983  ABC transporter related  54.5 
 
 
233 aa  234  7e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  52.21 
 
 
226 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  54.09 
 
 
226 aa  231  9e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  52.21 
 
 
226 aa  230  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3735  ABC transporter related  56.25 
 
 
233 aa  229  3e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  53.64 
 
 
226 aa  228  5e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  52.73 
 
 
226 aa  228  9e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  52.73 
 
 
226 aa  228  9e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  52.73 
 
 
226 aa  228  9e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  52.73 
 
 
226 aa  228  9e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  52.73 
 
 
226 aa  228  9e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  52.73 
 
 
226 aa  228  9e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  51.33 
 
 
226 aa  227  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  47.83 
 
 
236 aa  226  3e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  49.55 
 
 
236 aa  226  3e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4028  ABC transporter related  58.05 
 
 
228 aa  226  4e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  51.35 
 
 
244 aa  225  5.0000000000000005e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  48.86 
 
 
224 aa  225  6e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  48.86 
 
 
224 aa  225  6e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  48.86 
 
 
224 aa  224  8e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  49.55 
 
 
247 aa  224  9e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  48.86 
 
 
224 aa  224  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  48.86 
 
 
224 aa  224  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  52.25 
 
 
246 aa  224  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  48.86 
 
 
224 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  54.63 
 
 
230 aa  224  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5234  ABC transporter ATP-binding protein  53.15 
 
 
237 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  48.86 
 
 
224 aa  223  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  49.55 
 
 
237 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  48.4 
 
 
224 aa  223  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  50.88 
 
 
226 aa  223  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60790  ABC transporter ATP-binding protein  53.15 
 
 
228 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  50.44 
 
 
239 aa  222  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4094  ABC transporter related  54.09 
 
 
226 aa  222  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  50 
 
 
242 aa  221  6e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  51.09 
 
 
247 aa  221  6e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4155  ABC transporter, ATPase subunit  55.07 
 
 
241 aa  221  6e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4308  ABC transporter related  55.07 
 
 
241 aa  221  6e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  48.4 
 
 
224 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4286  ABC transporter-related protein  54.63 
 
 
241 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  47.77 
 
 
224 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  48.32 
 
 
277 aa  219  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4296  ABC transporter related  60.89 
 
 
242 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0438871  normal  0.557698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  50.46 
 
 
238 aa  219  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  52.23 
 
 
233 aa  219  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  47.03 
 
 
224 aa  218  5e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3521  ABC transporter related protein  52.8 
 
 
254 aa  218  7.999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.185776 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  49.08 
 
 
225 aa  217  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  46.22 
 
 
232 aa  217  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  49.07 
 
 
250 aa  217  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0905  ABC transporter related  53.12 
 
 
243 aa  217  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.072369  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  51.75 
 
 
233 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  52.34 
 
 
258 aa  217  1e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  48.89 
 
 
225 aa  216  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1667  ABC transporter related  46.85 
 
 
233 aa  216  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1167  ABC transporter related  50.21 
 
 
235 aa  216  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  49.09 
 
 
252 aa  216  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0268  ABC transporter related  51.33 
 
 
277 aa  215  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000875319 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2439  ABC transporter related  54.17 
 
 
280 aa  215  4e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110449  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  46.09 
 
 
266 aa  215  4e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1767  ATPase  48.25 
 
 
248 aa  215  5e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132988  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  52.84 
 
 
253 aa  215  5e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0411  ABC transporter related  54.02 
 
 
287 aa  215  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1414  ATPase  51.33 
 
 
241 aa  214  7e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  51.17 
 
 
248 aa  214  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06281  ABC transporter ATP-binding protein  49.12 
 
 
246 aa  214  7e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0807317 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  51.17 
 
 
248 aa  214  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  49.33 
 
 
259 aa  214  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0892  ABC transporter related  54.5 
 
 
221 aa  214  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.783252 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  52.84 
 
 
253 aa  214  8e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1889  ABC transporter related  50.23 
 
 
238 aa  214  9e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.236618  normal  0.569597 
 
 
-
 
NC_003296  RS03080  ABC transporter ATP-binding protein  49.77 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.953982  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  52.43 
 
 
229 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  46.85 
 
 
225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  49.12 
 
 
228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  48.46 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  52.05 
 
 
233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  54.67 
 
 
226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  48.46 
 
 
232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  47.98 
 
 
228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  50.23 
 
 
235 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  53.14 
 
 
227 aa  212  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0321  ABC transporter related  50.86 
 
 
271 aa  212  2.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  51.14 
 
 
231 aa  213  2.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1663  ABC transporter, ATP-binding protein  50.23 
 
 
219 aa  212  3.9999999999999995e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.557172 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  49.57 
 
 
252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  48.26 
 
 
653 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  48.28 
 
 
648 aa  212  4.9999999999999996e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2270  ABC transporter related  53.36 
 
 
250 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  44.69 
 
 
238 aa  211  5.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  49.78 
 
 
649 aa  211  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  48.46 
 
 
239 aa  211  7e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  50.7 
 
 
224 aa  211  7.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  50.88 
 
 
248 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  48.88 
 
 
234 aa  211  1e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  49.78 
 
 
241 aa  211  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  48.21 
 
 
238 aa  210  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>