More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3521 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3521  ABC transporter related protein  100 
 
 
254 aa  515  1.0000000000000001e-145  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.185776 
 
 
-
 
NC_002950  PG1663  ABC transporter, ATP-binding protein  62.96 
 
 
219 aa  278  5e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.557172 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01135  ABC transporter, ATP-binding protein  57.53 
 
 
233 aa  278  7e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1667  ABC transporter related  57.99 
 
 
233 aa  276  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2280  ABC transporter, ATP-binding protein  59.73 
 
 
233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0760186 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  54.55 
 
 
246 aa  250  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  52.7 
 
 
232 aa  246  3e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  56.36 
 
 
236 aa  246  3e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  55.96 
 
 
230 aa  245  4e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  53.88 
 
 
230 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  53.6 
 
 
228 aa  241  9e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  50.46 
 
 
248 aa  240  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  50.46 
 
 
248 aa  240  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  51.09 
 
 
228 aa  240  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  51.56 
 
 
233 aa  239  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  53.6 
 
 
239 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  54.59 
 
 
258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  52.25 
 
 
228 aa  239  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  52.34 
 
 
242 aa  239  4e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  50.45 
 
 
224 aa  238  6.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  52.75 
 
 
260 aa  238  9e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  50 
 
 
237 aa  237  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  52.68 
 
 
244 aa  236  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  49.35 
 
 
242 aa  236  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  54.95 
 
 
238 aa  236  3e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  50.93 
 
 
228 aa  235  4e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  51.83 
 
 
226 aa  235  6e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  52.75 
 
 
253 aa  234  7e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  52.05 
 
 
224 aa  234  7e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  51.6 
 
 
224 aa  234  8e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  51.6 
 
 
224 aa  234  8e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  51.6 
 
 
224 aa  234  8e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  52.75 
 
 
226 aa  234  8e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  51.6 
 
 
224 aa  234  8e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4155  ABC transporter, ATPase subunit  55 
 
 
241 aa  234  8e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  51.6 
 
 
224 aa  234  8e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4308  ABC transporter related  55 
 
 
241 aa  234  8e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  53.21 
 
 
226 aa  234  9e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  52.75 
 
 
253 aa  234  9e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  52.73 
 
 
247 aa  234  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  51.6 
 
 
224 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  53.12 
 
 
233 aa  234  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  53.21 
 
 
226 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  53.7 
 
 
238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  51.14 
 
 
224 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  51.6 
 
 
224 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4286  ABC transporter-related protein  54.55 
 
 
241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  53.21 
 
 
226 aa  233  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  52.25 
 
 
228 aa  233  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2038  ABC transporter related  53.67 
 
 
233 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.376795  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0595  ATPase  52.31 
 
 
228 aa  232  5e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0833962  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  52.75 
 
 
226 aa  232  5e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  49.8 
 
 
657 aa  231  6e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  52.29 
 
 
226 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  52.29 
 
 
226 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  52.29 
 
 
226 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  52.29 
 
 
226 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  50.68 
 
 
259 aa  231  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  52.29 
 
 
226 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  50.92 
 
 
230 aa  231  8.000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  51.68 
 
 
241 aa  231  9e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  51.26 
 
 
241 aa  231  9e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  50.9 
 
 
229 aa  231  9e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1766  ATPase  51.15 
 
 
228 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104306  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  49.58 
 
 
291 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  52.29 
 
 
226 aa  230  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  50.68 
 
 
224 aa  230  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  50.23 
 
 
224 aa  229  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  52.29 
 
 
236 aa  230  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  49.37 
 
 
241 aa  230  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04881  ABC transporter ATP-binding protein  51.15 
 
 
235 aa  230  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134366  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0211  ABC transporter related  54.05 
 
 
256 aa  230  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0038  ABC transporter ATP-binding protein  51.82 
 
 
221 aa  229  3e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  48.94 
 
 
252 aa  229  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  52.97 
 
 
230 aa  229  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  54.85 
 
 
236 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  51.85 
 
 
249 aa  229  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  52.29 
 
 
226 aa  229  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  51.38 
 
 
240 aa  228  6e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  50.65 
 
 
238 aa  228  7e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  50.66 
 
 
236 aa  228  7e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0222  ABC transporter related  54.46 
 
 
247 aa  228  9e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256244  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  47.45 
 
 
277 aa  227  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  50 
 
 
236 aa  227  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0723  ABC transporter-related protein  49.77 
 
 
240 aa  227  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  49.33 
 
 
225 aa  227  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  51.38 
 
 
228 aa  228  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  50.46 
 
 
237 aa  226  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0199  ABC transporter related  52.89 
 
 
291 aa  227  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.500002  normal  0.26855 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  48 
 
 
230 aa  227  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1792  ABC transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 
233 aa  226  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0321  ABC transporter related  48.85 
 
 
271 aa  226  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3692  ABC transporter, ATP-binding protein  48.86 
 
 
246 aa  226  4e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  50.65 
 
 
244 aa  225  4e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4072  ABC transporter related  49.77 
 
 
253 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4094  ABC transporter related  52 
 
 
226 aa  225  6e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  50.23 
 
 
225 aa  225  6e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3037  ABC transporter-related protein  49.39 
 
 
241 aa  225  7e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000724399  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06281  ABC transporter ATP-binding protein  48.46 
 
 
246 aa  225  7e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0807317 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  47.98 
 
 
229 aa  224  7e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>