More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0354 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  100 
 
 		 249 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  79.24 
 
 		 249 aa  388  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  76.37 
 
 		 244 aa  382  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  51.12 
 
 		 239 aa  250  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  50.88 
 
 		 234 aa  246  2e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  50.88 
 
 		 234 aa  246  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 286 aa  241  6e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  50.67 
 
 		 231 aa  241  7.999999999999999e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  52.02 
 
 		 222 aa  237  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  52.97 
 
 		 246 aa  237  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  50.91 
 
 		 244 aa  234  8e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  49.32 
 
 		 252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  50.91 
 
 		 226 aa  233  3e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  48.88 
 
 		 242 aa  232  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  50.23 
 
 		 230 aa  230  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  46.96 
 
 		 230 aa  230  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  49.33 
 
 		 248 aa  228  6e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  50.67 
 
 		 230 aa  228  6e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  49.55 
 
 		 238 aa  228  8e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  49.55 
 
 		 236 aa  228  9e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 228 aa  227  1e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  48.89 
 
 		 228 aa  228  1e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  50.23 
 
 		 266 aa  227  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  48.66 
 
 		 232 aa  227  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  50.9 
 
 		 255 aa  227  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  48.42 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3555  ABC transporter, ATP-binding protein  50.23 
 
 		 224 aa  227  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.287436  normal  0.628784 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  51.61 
 
 		 250 aa  227  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  50.23 
 
 		 230 aa  226  3e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 229 aa  226  3e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  49.32 
 
 		 239 aa  226  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  46.12 
 
 		 235 aa  226  4e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  48.83 
 
 		 225 aa  225  6e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3219  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 248 aa  224  7e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  50.66 
 
 		 240 aa  224  8e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2391  ABC transporter related  50 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  49.33 
 
 		 319 aa  224  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  46.82 
 
 		 228 aa  223  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  49.11 
 
 		 242 aa  223  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  47.96 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  49.78 
 
 		 249 aa  223  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  48.88 
 
 		 225 aa  223  3e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  44 
 
 		 240 aa  222  4e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  47.95 
 
 		 241 aa  222  4e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  49.54 
 
 		 715 aa  222  4e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0211  ABC transporter related  45.68 
 
 		 256 aa  222  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  47.95 
 
 		 259 aa  221  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  50.23 
 
 		 228 aa  221  7e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  49.77 
 
 		 225 aa  221  7e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  47 
 
 		 221 aa  221  7e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  47.51 
 
 		 227 aa  221  7e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  47.51 
 
 		 277 aa  221  9e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  47.93 
 
 		 244 aa  221  9e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3285  ABC transporter related  51.36 
 
 		 249 aa  220  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  46.9 
 
 		 241 aa  221  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  44.74 
 
 		 237 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  48.88 
 
 		 239 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  46.82 
 
 		 236 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  48.9 
 
 		 228 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  44.78 
 
 		 230 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  48.02 
 
 		 247 aa  219  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0411  ABC transporter related  49.08 
 
 		 287 aa  219  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  47.73 
 
 		 228 aa  218  7e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  45.91 
 
 		 248 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  45.91 
 
 		 248 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  46.67 
 
 		 229 aa  217  1e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  47.49 
 
 		 256 aa  217  1e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5234  ABC transporter ATP-binding protein  49.32 
 
 		 237 aa  217  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  45.81 
 
 		 229 aa  216  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  49.32 
 
 		 253 aa  217  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  49.77 
 
 		 253 aa  216  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  44.93 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  45.66 
 
 		 252 aa  217  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  48.6 
 
 		 224 aa  217  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  47.73 
 
 		 233 aa  217  2e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1414  ATPase  48.42 
 
 		 241 aa  216  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  46.29 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  46.44 
 
 		 248 aa  216  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3214  ABC transporter related  47.81 
 
 		 233 aa  217  2e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.418962  normal  0.11192 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  49.1 
 
 		 248 aa  216  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  47.37 
 
 		 235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  48 
 
 		 288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  45.22 
 
 		 247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  45.54 
 
 		 251 aa  215  5e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  47.03 
 
 		 244 aa  215  5e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  48.9 
 
 		 237 aa  215  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  49.53 
 
 		 228 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  47.49 
 
 		 237 aa  215  5.9999999999999996e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8342  ABC transporter related  44.55 
 
 		 234 aa  214  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  49.08 
 
 		 220 aa  214  8e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.271834 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1473  ABC-transporter ATP binding protein  48.89 
 
 		 233 aa  214  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3258  ABC transporter, ATP-binding protein  48.89 
 
 		 233 aa  214  8e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.219344  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3144  ABC transporter, ATP-binding protein  48.89 
 
 		 233 aa  214  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  46.64 
 
 		 228 aa  214  8e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60790  ABC transporter ATP-binding protein  47.95 
 
 		 228 aa  214  9e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  48.4 
 
 		 241 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1810  putative ATP-binding component of ABC transporter  44.8 
 
 		 228 aa  214  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.512088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  49.32 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  44.75 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>