More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1530 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  100 
 
 
224 aa  453  1.0000000000000001e-126  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0701501 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  64.55 
 
 
225 aa  301  6.000000000000001e-81  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  52.23 
 
 
235 aa  243  9.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  50.45 
 
 
228 aa  243  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  55.25 
 
 
230 aa  241  6e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  51.82 
 
 
246 aa  234  7e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  50.67 
 
 
230 aa  231  5e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  51.35 
 
 
237 aa  231  8.000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  50.23 
 
 
266 aa  230  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  51.58 
 
 
235 aa  229  2e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  51.6 
 
 
224 aa  229  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  50 
 
 
248 aa  228  6e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  48.86 
 
 
236 aa  228  6e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  50.45 
 
 
234 aa  227  1e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  52.51 
 
 
225 aa  227  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  50.45 
 
 
234 aa  227  1e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  50.67 
 
 
242 aa  226  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  48 
 
 
231 aa  226  2e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  51.14 
 
 
225 aa  226  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  48.86 
 
 
230 aa  226  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1744  ABC transporter related protein  54.84 
 
 
246 aa  225  3e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  50.91 
 
 
238 aa  225  5.0000000000000005e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  48.23 
 
 
239 aa  223  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  51.35 
 
 
230 aa  224  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  50.23 
 
 
225 aa  224  1e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  53.18 
 
 
237 aa  223  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  46.64 
 
 
242 aa  222  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  48.85 
 
 
237 aa  222  4e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50.67 
 
 
234 aa  221  4.9999999999999996e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  49.09 
 
 
228 aa  221  4.9999999999999996e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0384  ABC transporter related protein  49.32 
 
 
237 aa  220  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  50.23 
 
 
226 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  48.43 
 
 
233 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 
226 aa  218  5e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  47.49 
 
 
252 aa  218  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  48.64 
 
 
248 aa  218  7e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  48.64 
 
 
248 aa  218  7e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1061  ABC transporter related  47.98 
 
 
239 aa  217  1e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.691054  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 
226 aa  217  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  49.32 
 
 
226 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 
226 aa  217  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 
226 aa  217  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  50.67 
 
 
229 aa  217  1e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  49.32 
 
 
226 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  47.51 
 
 
240 aa  217  1e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  48.21 
 
 
255 aa  217  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 
226 aa  217  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  46.64 
 
 
244 aa  216  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  48.86 
 
 
226 aa  216  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  48.86 
 
 
226 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 
226 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2038  ABC transporter related  49.54 
 
 
233 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.376795  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  48.43 
 
 
233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  50 
 
 
241 aa  215  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  47.77 
 
 
715 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  48.64 
 
 
254 aa  215  4e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  46.36 
 
 
224 aa  215  4e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  47.95 
 
 
253 aa  215  4e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  47.95 
 
 
253 aa  215  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0367  ABC transporter related  52.04 
 
 
244 aa  215  5e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  47.96 
 
 
238 aa  214  5.9999999999999996e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  47.06 
 
 
277 aa  214  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  47.95 
 
 
226 aa  214  5.9999999999999996e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0772  ABC transporter related  45.5 
 
 
238 aa  214  9e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  48.4 
 
 
252 aa  214  9e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1404  ABC transporter related  47.75 
 
 
243 aa  214  9e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0229  ABC transporter related  49.32 
 
 
264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.772392  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  47.06 
 
 
236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  49.78 
 
 
233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  48.86 
 
 
259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  46.15 
 
 
230 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  48.18 
 
 
236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  50.23 
 
 
653 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1701  ATPase  46.19 
 
 
240 aa  212  3.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.620814 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  48.64 
 
 
238 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  47.27 
 
 
229 aa  211  4.9999999999999996e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1775  ABC transporter related  49.32 
 
 
298 aa  211  4.9999999999999996e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  49.32 
 
 
653 aa  212  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  47.73 
 
 
241 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3374  ABC efflux transporter, ATPase subunit  50.49 
 
 
211 aa  211  7e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  46.36 
 
 
658 aa  211  7e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  47.73 
 
 
244 aa  211  7.999999999999999e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3501  ABC transporter related  47.51 
 
 
241 aa  211  9e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  47.27 
 
 
241 aa  211  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  47.06 
 
 
234 aa  211  1e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.42 
 
 
647 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  50.68 
 
 
227 aa  210  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  48.18 
 
 
225 aa  211  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  47.51 
 
 
241 aa  211  1e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5234  ABC transporter ATP-binding protein  47.53 
 
 
237 aa  210  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  45.98 
 
 
244 aa  211  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  48.18 
 
 
225 aa  211  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  46.46 
 
 
237 aa  209  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  49.32 
 
 
244 aa  209  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  49.32 
 
 
242 aa  209  2e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  47.03 
 
 
644 aa  209  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  45.21 
 
 
224 aa  209  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8342  ABC transporter related  49.51 
 
 
234 aa  209  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4456  ABC transporter related protein  47.3 
 
 
239 aa  209  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1950  ABC transporter related  45.33 
 
 
238 aa  209  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.458128  normal  0.0230529 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>