More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2351 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  100 
 
 
255 aa  520  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  96.08 
 
 
255 aa  483  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  76.99 
 
 
256 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  71.37 
 
 
455 aa  355  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  70.89 
 
 
266 aa  352  4e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  72.69 
 
 
247 aa  349  3e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  71.07 
 
 
264 aa  348  5e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  71.37 
 
 
256 aa  344  7e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  76.11 
 
 
257 aa  342  4e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  67.08 
 
 
250 aa  340  1e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  72.25 
 
 
445 aa  335  3.9999999999999995e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  67.08 
 
 
262 aa  333  2e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  64.9 
 
 
255 aa  331  6e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  65.69 
 
 
277 aa  327  8e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  65.85 
 
 
253 aa  325  3e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  64.43 
 
 
277 aa  324  7e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  64.56 
 
 
291 aa  322  3e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  63.82 
 
 
258 aa  319  3e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  66.24 
 
 
255 aa  315  4e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  65.65 
 
 
268 aa  312  3.9999999999999997e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  61.86 
 
 
258 aa  310  1e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  62 
 
 
258 aa  309  2e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  62.61 
 
 
280 aa  309  2.9999999999999997e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  61.98 
 
 
271 aa  308  5.9999999999999995e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  63.05 
 
 
258 aa  308  8e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  60.43 
 
 
263 aa  306  3e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  67.52 
 
 
258 aa  305  3e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  64.91 
 
 
253 aa  305  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  61.09 
 
 
259 aa  302  3.0000000000000004e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  61.45 
 
 
274 aa  301  5.000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  62.61 
 
 
247 aa  299  4e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  62.34 
 
 
252 aa  298  6e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  60.7 
 
 
279 aa  297  9e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  63.16 
 
 
261 aa  297  1e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  63.48 
 
 
264 aa  296  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  60.08 
 
 
288 aa  293  2e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  62.39 
 
 
302 aa  292  3e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  60.42 
 
 
257 aa  289  3e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  61.83 
 
 
312 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  63.4 
 
 
255 aa  280  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  62.05 
 
 
244 aa  278  8e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  58.7 
 
 
279 aa  276  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  61.29 
 
 
250 aa  272  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  58.77 
 
 
256 aa  270  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  55.83 
 
 
255 aa  270  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  59.05 
 
 
293 aa  266  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  55.82 
 
 
252 aa  267  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  55.04 
 
 
243 aa  265  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  56.22 
 
 
269 aa  265  5.999999999999999e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  56.65 
 
 
266 aa  261  8.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  59.35 
 
 
245 aa  261  1e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  54.85 
 
 
245 aa  258  5.0000000000000005e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  52.74 
 
 
253 aa  256  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  55.83 
 
 
249 aa  252  4.0000000000000004e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  52.32 
 
 
243 aa  247  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  56.22 
 
 
244 aa  246  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  58.01 
 
 
277 aa  243  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  56.25 
 
 
249 aa  241  9e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  57.14 
 
 
241 aa  240  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  49.08 
 
 
230 aa  240  2e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  49.59 
 
 
255 aa  240  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  50.82 
 
 
271 aa  239  4e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  55.07 
 
 
272 aa  237  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  51.32 
 
 
240 aa  234  8e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  50 
 
 
279 aa  229  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  53.74 
 
 
269 aa  228  7e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  53.88 
 
 
248 aa  228  8e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  46.79 
 
 
228 aa  228  9e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4805  ABC transporter related protein  58.62 
 
 
249 aa  228  9e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  53.95 
 
 
224 aa  227  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  50.81 
 
 
247 aa  223  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  51.27 
 
 
239 aa  223  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  47.64 
 
 
229 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2457  ABC transporter related protein  52.42 
 
 
247 aa  214  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0887865  hitchhiker  0.00000290657 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  50.93 
 
 
238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  46.76 
 
 
234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  47.09 
 
 
252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  46.05 
 
 
225 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  49.52 
 
 
225 aa  212  5.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  46.3 
 
 
234 aa  211  7e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  46.76 
 
 
234 aa  210  1e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  46.33 
 
 
227 aa  211  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  46.67 
 
 
227 aa  210  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2319  ABC transporter related  50.7 
 
 
245 aa  210  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  45.95 
 
 
235 aa  209  3e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  45.33 
 
 
230 aa  209  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  44.7 
 
 
286 aa  209  4e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  47.81 
 
 
252 aa  209  4e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0908  ABC transporter related  49.76 
 
 
235 aa  208  7e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  47.73 
 
 
266 aa  208  8e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  42.17 
 
 
240 aa  208  8e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0314  ABC transporter, ATP-binding protein  43.24 
 
 
253 aa  207  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.924183  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 
319 aa  207  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  52.63 
 
 
248 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  51.16 
 
 
240 aa  207  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  47.62 
 
 
241 aa  207  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  46.79 
 
 
225 aa  207  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  48.25 
 
 
657 aa  207  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0699  ABC transporter related  42.48 
 
 
253 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.184929  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  45.54 
 
 
238 aa  207  2e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>