More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0539 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  100 
 
 		 227 aa  454  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  81.94 
 
 		 227 aa  387  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  65.49 
 
 		 228 aa  322  4e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1536  ABC transporter related  70.85 
 
 		 226 aa  322  4e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38165  normal  0.0345919 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  58.74 
 
 		 226 aa  280  2e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  56.95 
 
 		 225 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  54.26 
 
 		 230 aa  268  7e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  53.88 
 
 		 225 aa  265  5e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  55.45 
 
 		 229 aa  256  2e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  49.1 
 
 		 293 aa  246  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  47.69 
 
 		 255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.12 
 
 		 245 aa  232  4.0000000000000004e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  50.23 
 
 		 244 aa  231  7.000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  46.61 
 
 		 291 aa  231  9e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  49.3 
 
 		 263 aa  229  3e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  49.33 
 
 		 230 aa  228  5e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  49.31 
 
 		 255 aa  228  7e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  47.47 
 
 		 252 aa  226  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50 
 
 		 264 aa  226  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  50 
 
 		 237 aa  226  3e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  47.58 
 
 		 248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  48.62 
 
 		 259 aa  224  1e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  47.22 
 
 		 264 aa  223  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  47.98 
 
 		 223 aa  224  1e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  46.43 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  49.3 
 
 		 279 aa  223  2e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  46.36 
 
 		 266 aa  222  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  47.25 
 
 		 277 aa  223  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  47.09 
 
 		 277 aa  222  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  45.91 
 
 		 258 aa  221  9e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  45.37 
 
 		 262 aa  221  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 		 227 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  47.27 
 
 		 224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  48.4 
 
 		 279 aa  219  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  46.67 
 
 		 253 aa  219  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  45.91 
 
 		 258 aa  219  3.9999999999999997e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  46.26 
 
 		 242 aa  219  3.9999999999999997e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  47.27 
 
 		 224 aa  218  6e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  46.51 
 
 		 271 aa  218  7e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  48.02 
 
 		 225 aa  218  7.999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1701  ATPase  45.85 
 
 		 240 aa  217  8.999999999999998e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.620814 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  46.61 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  45.41 
 
 		 288 aa  217  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  46.48 
 
 		 253 aa  217  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  45.37 
 
 		 255 aa  217  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  46.02 
 
 		 233 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  47.37 
 
 		 268 aa  217  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  43.81 
 
 		 233 aa  215  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  47.93 
 
 		 221 aa  214  5.9999999999999996e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.95 
 
 		 274 aa  214  5.9999999999999996e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  45.37 
 
 		 455 aa  214  7e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  44.89 
 
 		 247 aa  214  7e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0481  ABC transporter related  45.18 
 
 		 241 aa  214  8e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  45.41 
 
 		 312 aa  214  9e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.26 
 
 		 280 aa  214  9.999999999999999e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  52.09 
 
 		 249 aa  213  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  46.05 
 
 		 269 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  47.22 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  45.79 
 
 		 258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  48.64 
 
 		 234 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  45.66 
 
 		 220 aa  213  2.9999999999999995e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6890  ABC transporter related  47.27 
 
 		 226 aa  212  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  46.64 
 
 		 225 aa  212  2.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  44.14 
 
 		 230 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  48.64 
 
 		 234 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  47.44 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  43.5 
 
 		 237 aa  212  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  47.32 
 
 		 642 aa  212  3.9999999999999995e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  45.54 
 
 		 226 aa  212  3.9999999999999995e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  44.59 
 
 		 658 aa  211  4.9999999999999996e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2018  ABC transporter related  46.26 
 
 		 238 aa  211  4.9999999999999996e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  49.32 
 
 		 228 aa  211  4.9999999999999996e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  44 
 
 		 239 aa  211  5.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  44.39 
 
 		 233 aa  211  7e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 		 228 aa  211  7.999999999999999e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  45.78 
 
 		 225 aa  210  1e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.25 
 
 		 227 aa  211  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  46.19 
 
 		 236 aa  211  1e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.03 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  45.95 
 
 		 248 aa  210  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  44.25 
 
 		 235 aa  210  1e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0425  ABC transporter related  46.12 
 
 		 234 aa  211  1e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  47.09 
 
 		 244 aa  210  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  44.81 
 
 		 247 aa  210  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  45.54 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  47.66 
 
 		 255 aa  210  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 256 aa  209  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  46.79 
 
 		 255 aa  209  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  47.09 
 
 		 653 aa  209  2e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0264  ATPase  43.86 
 
 		 246 aa  209  2e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  44.29 
 
 		 256 aa  210  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2196  ABC transporter related  45.98 
 
 		 230 aa  210  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.439888  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  44.64 
 
 		 228 aa  210  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  44.91 
 
 		 247 aa  209  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  46.4 
 
 		 642 aa  209  3e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  44.89 
 
 		 266 aa  209  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  47.09 
 
 		 653 aa  209  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0335  ABC transporter related  43.18 
 
 		 248 aa  209  4e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000938347 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  47.73 
 
 		 240 aa  209  4e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  46.73 
 
 		 255 aa  208  5e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>