More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4185 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  100 
 
 		 258 aa  504  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  72.17 
 
 		 255 aa  332  3e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  68.12 
 
 		 255 aa  325  6e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  69.23 
 
 		 455 aa  322  4e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  66.25 
 
 		 264 aa  322  4e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  68.56 
 
 		 255 aa  321  8e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  65.38 
 
 		 256 aa  320  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  67.65 
 
 		 247 aa  318  7e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  62.99 
 
 		 277 aa  317  9e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  68.22 
 
 		 256 aa  317  9e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  70.61 
 
 		 253 aa  317  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  69.16 
 
 		 445 aa  311  6.999999999999999e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  66.53 
 
 		 280 aa  308  8e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  64.08 
 
 		 262 aa  307  9e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  65.37 
 
 		 266 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  64.37 
 
 		 277 aa  305  5.0000000000000004e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  62.3 
 
 		 291 aa  305  7e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  64.41 
 
 		 252 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  60.8 
 
 		 258 aa  301  5.000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  62.92 
 
 		 258 aa  301  5.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  63.93 
 
 		 250 aa  301  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  63.01 
 
 		 255 aa  295  5e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  64.41 
 
 		 253 aa  294  7e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  65.65 
 
 		 268 aa  293  2e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  65.11 
 
 		 258 aa  293  3e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  63.03 
 
 		 264 aa  293  3e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  62.03 
 
 		 271 aa  292  3e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  64.68 
 
 		 245 aa  291  7e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  62.81 
 
 		 247 aa  291  9e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  65.2 
 
 		 244 aa  290  1e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  60 
 
 		 259 aa  290  1e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  61.48 
 
 		 258 aa  290  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  65.79 
 
 		 256 aa  289  4e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  62.55 
 
 		 252 aa  288  5.0000000000000004e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  63.6 
 
 		 261 aa  286  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  56.96 
 
 		 263 aa  285  4e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  69.47 
 
 		 257 aa  283  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  60.94 
 
 		 253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  60.5 
 
 		 274 aa  281  5.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  63.71 
 
 		 288 aa  281  7.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  67.09 
 
 		 312 aa  277  1e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  60.17 
 
 		 243 aa  277  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  62.66 
 
 		 257 aa  275  4e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  52.44 
 
 		 279 aa  275  5e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  63.64 
 
 		 302 aa  270  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  63.9 
 
 		 255 aa  271  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  64.14 
 
 		 277 aa  270  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  63.47 
 
 		 250 aa  264  8.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  58.01 
 
 		 279 aa  264  8.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  58.68 
 
 		 243 aa  264  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  59.82 
 
 		 245 aa  262  4e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  56.52 
 
 		 269 aa  262  4.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  54.77 
 
 		 266 aa  260  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  55.56 
 
 		 271 aa  257  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  59.74 
 
 		 249 aa  255  4e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  60.54 
 
 		 272 aa  254  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  56.9 
 
 		 244 aa  253  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  62.01 
 
 		 241 aa  250  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  55.88 
 
 		 293 aa  244  6.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  59.4 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  60.25 
 
 		 249 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  58.08 
 
 		 247 aa  238  8e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  54.78 
 
 		 255 aa  237  1e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  51.85 
 
 		 279 aa  236  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  47.69 
 
 		 228 aa  235  5.0000000000000005e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  55.65 
 
 		 248 aa  235  7e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  61.08 
 
 		 224 aa  233  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  50.23 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  57.85 
 
 		 269 aa  226  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4805  ABC transporter related protein  61.67 
 
 		 249 aa  226  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  44.2 
 
 		 230 aa  224  1e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  45.37 
 
 		 226 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  45.69 
 
 		 240 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 240 aa  220  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  46.61 
 
 		 229 aa  219  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  43.88 
 
 		 248 aa  219  5e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  46.99 
 
 		 251 aa  217  1e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  54.03 
 
 		 239 aa  217  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  50 
 
 		 241 aa  215  4e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  46.02 
 
 		 238 aa  216  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  47.64 
 
 		 225 aa  215  5.9999999999999996e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2319  ABC transporter related  55.09 
 
 		 245 aa  214  9e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  49.78 
 
 		 658 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0836  peptide ABC transporter ATPase  46.12 
 
 		 251 aa  212  4.9999999999999996e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.506405  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  45.7 
 
 		 229 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  47.62 
 
 		 230 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0222  ABC transporter related  52.19 
 
 		 247 aa  211  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256244  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2175  ABC transporter related protein  48.19 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  48 
 
 		 231 aa  210  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  44.39 
 
 		 227 aa  209  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  42.74 
 
 		 255 aa  208  5e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  49.54 
 
 		 235 aa  208  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  48.77 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  50.47 
 
 		 653 aa  207  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  48.64 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  47.22 
 
 		 225 aa  207  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  46.46 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  48.98 
 
 		 654 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  43.6 
 
 		 227 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  50.46 
 
 		 252 aa  206  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>