More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0346 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  100 
 
 
302 aa  597  1e-170  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  75.32 
 
 
264 aa  357  9.999999999999999e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  73.28 
 
 
259 aa  349  3e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  73.62 
 
 
288 aa  338  7e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  73.5 
 
 
255 aa  323  3e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  73.93 
 
 
312 aa  322  4e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  65.79 
 
 
253 aa  315  5e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  63.64 
 
 
266 aa  308  6.999999999999999e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  62.56 
 
 
256 aa  304  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  66.23 
 
 
277 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  65.35 
 
 
247 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  57.46 
 
 
291 aa  303  3.0000000000000004e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  59.76 
 
 
258 aa  302  5.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  63.11 
 
 
255 aa  301  9e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  63.76 
 
 
264 aa  300  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  62.67 
 
 
255 aa  299  3e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  61.45 
 
 
262 aa  299  4e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  61.48 
 
 
268 aa  296  3e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  64.86 
 
 
258 aa  295  6e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  62.61 
 
 
250 aa  294  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  61.22 
 
 
255 aa  293  2e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  62.39 
 
 
277 aa  292  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  63.32 
 
 
455 aa  292  6e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  63.39 
 
 
445 aa  291  7e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  65.02 
 
 
253 aa  290  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  61.9 
 
 
256 aa  288  8e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  60.36 
 
 
263 aa  288  9e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  58.37 
 
 
271 aa  287  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  63.72 
 
 
244 aa  286  4e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  56.08 
 
 
274 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  60.42 
 
 
252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  61.97 
 
 
280 aa  282  5.000000000000001e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  58.85 
 
 
255 aa  281  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  61.28 
 
 
250 aa  280  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  57.63 
 
 
258 aa  281  1e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  61.9 
 
 
247 aa  279  4e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  63.06 
 
 
261 aa  278  7e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  65.45 
 
 
257 aa  275  7e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  57.85 
 
 
279 aa  275  8e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  63.64 
 
 
258 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  59.47 
 
 
258 aa  267  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  55.56 
 
 
245 aa  260  2e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  61.95 
 
 
293 aa  259  3e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  56.97 
 
 
257 aa  255  7e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  55.56 
 
 
245 aa  253  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  57.14 
 
 
243 aa  253  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  57.92 
 
 
243 aa  251  8.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  57.21 
 
 
256 aa  250  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  51.02 
 
 
269 aa  250  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  55.08 
 
 
271 aa  248  9e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  53.19 
 
 
279 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  53.78 
 
 
252 aa  245  6e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  55.45 
 
 
266 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  54.2 
 
 
255 aa  241  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  57.27 
 
 
249 aa  240  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  57.08 
 
 
277 aa  240  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  50.2 
 
 
253 aa  238  6.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  57.4 
 
 
241 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  47.91 
 
 
228 aa  230  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  46.08 
 
 
230 aa  226  5.0000000000000005e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  53 
 
 
279 aa  225  6e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  54.79 
 
 
272 aa  224  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  47 
 
 
227 aa  221  9e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  46.76 
 
 
229 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  49.06 
 
 
225 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  56.5 
 
 
269 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  59.81 
 
 
249 aa  219  6e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  51.14 
 
 
240 aa  218  7e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  56.58 
 
 
247 aa  218  8.999999999999998e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  47.22 
 
 
225 aa  217  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  44.04 
 
 
226 aa  217  2e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  48.86 
 
 
244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  51.33 
 
 
255 aa  216  4e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  46.79 
 
 
230 aa  215  7e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  58.33 
 
 
224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  56.67 
 
 
248 aa  211  7.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  47.71 
 
 
225 aa  210  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  45.12 
 
 
227 aa  210  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  47.47 
 
 
225 aa  209  5e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0908  ABC transporter related  50.45 
 
 
235 aa  209  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  41.38 
 
 
240 aa  208  7e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  50 
 
 
238 aa  208  9e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  43.5 
 
 
293 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  46.33 
 
 
238 aa  206  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  47.66 
 
 
266 aa  206  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  49.77 
 
 
235 aa  206  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  47.56 
 
 
251 aa  207  3e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  51.71 
 
 
244 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  45.85 
 
 
229 aa  205  6e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2781  ABC transporter related  42.36 
 
 
252 aa  205  7e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2724  ABC transporter related  42.36 
 
 
252 aa  205  7e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  49.34 
 
 
238 aa  204  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  46.36 
 
 
241 aa  204  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  45.66 
 
 
255 aa  204  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  51.28 
 
 
248 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1427  ABC transporter related  46.76 
 
 
241 aa  203  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0799296  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  44.34 
 
 
229 aa  204  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  44.93 
 
 
229 aa  204  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3583  ABC transporter related  48.9 
 
 
241 aa  204  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1056  ABC transporter related  48.67 
 
 
240 aa  204  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>