More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3583 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3583  ABC transporter related  100 
 
 		 241 aa  486  1e-136  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  68.26 
 
 		 235 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  64.14 
 
 		 254 aa  310  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  64.78 
 
 		 235 aa  306  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  65.8 
 
 		 248 aa  304  7e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  63.93 
 
 		 244 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  64.41 
 
 		 240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  65.15 
 
 		 240 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  63.52 
 
 		 244 aa  300  9e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  63.83 
 
 		 236 aa  300  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  62.66 
 
 		 238 aa  298  4e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  64.78 
 
 		 253 aa  296  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  63.87 
 
 		 238 aa  295  4e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2064  ABC transporter related protein  60.49 
 
 		 244 aa  293  2e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.325549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  63.48 
 
 		 245 aa  290  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  64.78 
 
 		 236 aa  289  3e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  60.49 
 
 		 243 aa  288  5.0000000000000004e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3436  putative ABC transporter, ATP-binding protein  64.35 
 
 		 245 aa  287  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  62.87 
 
 		 245 aa  287  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1479  ABC transporter-related protein  59.29 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1583  ABC transporter ATPase  63.6 
 
 		 241 aa  285  5e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.929196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0324  ABC transporter related protein  63.11 
 
 		 235 aa  282  4.0000000000000003e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2206  ABC transporter related  62.17 
 
 		 251 aa  281  7.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0216  hypothetical protein  59.31 
 
 		 236 aa  279  2e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5173  ABC transporter related  62.78 
 
 		 238 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1125  ATPase  59.66 
 
 		 245 aa  280  2e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.237557 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0302  ABC transporter related  62.03 
 
 		 250 aa  271  7e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0062  ABC transporter, ATP-binding protein  60.44 
 
 		 234 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1212  ABC transporter related  58.15 
 
 		 251 aa  271  8.000000000000001e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777209 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4369  ABC transporter related  59.57 
 
 		 234 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4501  ABC transporter related  59.57 
 
 		 234 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.293779 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1509  ABC transporter related  55.65 
 
 		 248 aa  266  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  57.78 
 
 		 244 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1056  ABC transporter related  64.19 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  56.22 
 
 		 253 aa  261  6e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  53.48 
 
 		 239 aa  256  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6252  ABC transporter related  60.09 
 
 		 234 aa  256  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  0.438945 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  51.75 
 
 		 234 aa  249  4e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2874  ABC transporter related  53.28 
 
 		 236 aa  248  6e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.675054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  55.16 
 
 		 236 aa  245  4.9999999999999997e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  53.36 
 
 		 233 aa  243  3e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  47.79 
 
 		 233 aa  239  2e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1715  ATPase  52.89 
 
 		 236 aa  239  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  50.22 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  49.33 
 
 		 233 aa  236  3e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  46.64 
 
 		 234 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  49.57 
 
 		 236 aa  233  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  48.46 
 
 		 233 aa  233  3e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  50.22 
 
 		 235 aa  233  3e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  47.56 
 
 		 233 aa  232  3e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  47.56 
 
 		 234 aa  230  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  46.9 
 
 		 233 aa  230  1e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0745  ABC transporter, ATP-binding protein  49.33 
 
 		 233 aa  229  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0728  ABC transporter, ATP-binding protein  49.33 
 
 		 233 aa  229  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  51.34 
 
 		 233 aa  229  2e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  48.9 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  48.88 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  45.58 
 
 		 604 aa  224  1e-57  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0132  ABC transporter, ATP-binding protein  49.14 
 
 		 233 aa  220  1.9999999999999999e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  44.89 
 
 		 232 aa  217  1e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1515  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  48.43 
 
 		 233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  43.42 
 
 		 345 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  45.78 
 
 		 232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0109  ABC transporter related  48.23 
 
 		 243 aa  216  2.9999999999999998e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.112558  normal  0.0826339 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.3 
 
 		 233 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.684387  normal  0.338705 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1583  ABC transporter related  41.78 
 
 		 232 aa  207  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  46.48 
 
 		 230 aa  206  4e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  43.23 
 
 		 242 aa  203  2e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  47.71 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01810  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.71 
 
 		 236 aa  201  8e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  48.13 
 
 		 232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  45.65 
 
 		 235 aa  198  7.999999999999999e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2221  ABC transporter related  49.77 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  45.54 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2600  ABC transporter related  47.95 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  44.2 
 
 		 246 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  45.41 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  44.81 
 
 		 228 aa  196  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  46.46 
 
 		 247 aa  196  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  46.7 
 
 		 229 aa  195  5.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  46.88 
 
 		 255 aa  195  7e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0133  ABC Transporter  40.79 
 
 		 300 aa  194  8.000000000000001e-49  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  49.04 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  49.3 
 
 		 264 aa  193  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.39 
 
 		 264 aa  193  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  48.43 
 
 		 239 aa  193  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  45.79 
 
 		 220 aa  193  2e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  49.28 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  46.46 
 
 		 277 aa  192  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  46.26 
 
 		 288 aa  192  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  45.89 
 
 		 252 aa  192  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  45.41 
 
 		 253 aa  192  4e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  47.91 
 
 		 455 aa  192  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  46.45 
 
 		 227 aa  192  5e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  46.92 
 
 		 225 aa  191  7e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  46.01 
 
 		 230 aa  191  8e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  48.53 
 
 		 217 aa  191  8e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  49.07 
 
 		 240 aa  191  9e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  48.8 
 
 		 255 aa  191  9e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  44.19 
 
 		 228 aa  190  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>