More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2064 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2064  ABC transporter related protein  100 
 
 		 244 aa  496  1e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.325549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  71.31 
 
 		 240 aa  347  1e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2206  ABC transporter related  68.35 
 
 		 251 aa  336  1.9999999999999998e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  70.56 
 
 		 245 aa  335  3.9999999999999995e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  70.56 
 
 		 236 aa  329  2e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  70.82 
 
 		 236 aa  329  3e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  67.39 
 
 		 248 aa  323  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  65.84 
 
 		 244 aa  321  6e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  65.81 
 
 		 238 aa  321  7e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  65.43 
 
 		 244 aa  320  9.000000000000001e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  67.97 
 
 		 235 aa  318  5e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0324  ABC transporter related protein  66.09 
 
 		 235 aa  316  2e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  65.8 
 
 		 235 aa  313  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1583  ABC transporter ATPase  68.44 
 
 		 241 aa  312  2.9999999999999996e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.929196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5173  ABC transporter related  64.1 
 
 		 238 aa  311  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0216  hypothetical protein  64.78 
 
 		 236 aa  310  1e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1056  ABC transporter related  63.22 
 
 		 240 aa  306  1.0000000000000001e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  60.83 
 
 		 254 aa  304  8.000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  64.07 
 
 		 240 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1479  ABC transporter-related protein  61.47 
 
 		 244 aa  302  3.0000000000000004e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1212  ABC transporter related  60 
 
 		 251 aa  301  4.0000000000000003e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777209 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0302  ABC transporter related  67.24 
 
 		 250 aa  298  4e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  60 
 
 		 245 aa  296  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3436  putative ABC transporter, ATP-binding protein  61.47 
 
 		 245 aa  294  7e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1509  ABC transporter related  60.78 
 
 		 248 aa  294  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4501  ABC transporter related  61.8 
 
 		 234 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.293779 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4369  ABC transporter related  61.8 
 
 		 234 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3583  ABC transporter related  60.49 
 
 		 241 aa  293  3e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  62.93 
 
 		 238 aa  290  1e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0062  ABC transporter, ATP-binding protein  59.66 
 
 		 234 aa  290  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  61.04 
 
 		 243 aa  289  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  55.74 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1125  ATPase  60.33 
 
 		 245 aa  283  1.0000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.237557 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  57.74 
 
 		 253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  60.61 
 
 		 253 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6252  ABC transporter related  60.09 
 
 		 234 aa  279  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  0.438945 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2874  ABC transporter related  56.17 
 
 		 236 aa  264  8.999999999999999e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.675054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  56.56 
 
 		 239 aa  263  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  49.33 
 
 		 234 aa  249  3e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1715  ATPase  52.36 
 
 		 236 aa  249  3e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  49.34 
 
 		 233 aa  249  4e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  51.11 
 
 		 236 aa  248  7e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  52 
 
 		 233 aa  247  1e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  51.91 
 
 		 236 aa  246  2e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  49.78 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  50.43 
 
 		 234 aa  246  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0745  ABC transporter, ATP-binding protein  52 
 
 		 233 aa  246  3e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0728  ABC transporter, ATP-binding protein  52 
 
 		 233 aa  246  3e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  51.57 
 
 		 233 aa  244  9.999999999999999e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  51.07 
 
 		 234 aa  242  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  48.91 
 
 		 234 aa  241  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  50.89 
 
 		 233 aa  240  2e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  50.67 
 
 		 233 aa  239  4e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  47.62 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  52.7 
 
 		 233 aa  235  5.0000000000000005e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  50.67 
 
 		 233 aa  234  8e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1583  ABC transporter related  46.72 
 
 		 232 aa  228  7e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  47.86 
 
 		 235 aa  228  9e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1515  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  50.22 
 
 		 233 aa  220  9.999999999999999e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  45.33 
 
 		 232 aa  218  7e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0132  ABC transporter, ATP-binding protein  51.92 
 
 		 233 aa  215  5.9999999999999996e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  41.6 
 
 		 604 aa  214  9.999999999999999e-55  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 345 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  44.83 
 
 		 232 aa  211  5.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.51 
 
 		 233 aa  210  2e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.684387  normal  0.338705 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0109  ABC transporter related  51.13 
 
 		 243 aa  209  4e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.112558  normal  0.0826339 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  44 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  43.69 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0133  ABC Transporter  41.49 
 
 		 300 aa  202  4e-51  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01810  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.11 
 
 		 236 aa  202  4e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  44.95 
 
 		 221 aa  202  6e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  44.44 
 
 		 252 aa  201  7e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  46.7 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  45.09 
 
 		 237 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  46.19 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  44.89 
 
 		 247 aa  198  6e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3219  ABC transporter, ATP-binding protein  43.4 
 
 		 248 aa  197  9e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  43.24 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  43.78 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  46.82 
 
 		 240 aa  196  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  45.58 
 
 		 232 aa  195  5.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  41.53 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  42.13 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  42.15 
 
 		 319 aa  193  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  43.84 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  41.92 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  47.44 
 
 		 253 aa  194  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  43.11 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  47.69 
 
 		 661 aa  192  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  43.67 
 
 		 246 aa  192  5e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  42.47 
 
 		 229 aa  192  5e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 256 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  42.34 
 
 		 223 aa  191  6e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  45.25 
 
 		 232 aa  191  7e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  44.84 
 
 		 262 aa  191  8e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1629  ABC transporter related  43.62 
 
 		 315 aa  191  8e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  43.78 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  43.24 
 
 		 230 aa  191  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  42.24 
 
 		 251 aa  189  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  45.58 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>