More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0745 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0745  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
233 aa  475  1e-133  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0728  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
233 aa  475  1e-133  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  64.81 
 
 
233 aa  328  5.0000000000000004e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  66.95 
 
 
233 aa  325  5e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  66.38 
 
 
234 aa  322  3e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  65.24 
 
 
233 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  63.52 
 
 
233 aa  319  1.9999999999999998e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  63.52 
 
 
233 aa  313  9.999999999999999e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  62.23 
 
 
233 aa  310  2e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  64.38 
 
 
233 aa  306  1.0000000000000001e-82  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  62.61 
 
 
234 aa  299  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  60.52 
 
 
236 aa  298  4e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  59.23 
 
 
233 aa  295  4e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1515  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  60.09 
 
 
233 aa  288  6e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0132  ABC transporter, ATP-binding protein  58.37 
 
 
233 aa  283  2.0000000000000002e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  59.91 
 
 
234 aa  279  2e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  58.37 
 
 
233 aa  276  2e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  53.54 
 
 
239 aa  263  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  52.44 
 
 
248 aa  255  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  52.91 
 
 
254 aa  255  4e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  54.26 
 
 
240 aa  255  4e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  52 
 
 
238 aa  255  5e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  52.44 
 
 
244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2874  ABC transporter related  52.44 
 
 
236 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.675054  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  53.1 
 
 
238 aa  253  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  52 
 
 
244 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  49.78 
 
 
232 aa  251  9.000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  52 
 
 
236 aa  250  1e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  53.81 
 
 
243 aa  250  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  51.57 
 
 
240 aa  250  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1715  ATPase  51.3 
 
 
236 aa  249  3e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3436  putative ABC transporter, ATP-binding protein  54.26 
 
 
245 aa  246  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2064  ABC transporter related protein  52 
 
 
244 aa  246  3e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.325549  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  50.67 
 
 
236 aa  246  3e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  50 
 
 
244 aa  245  4e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1509  ABC transporter related  51.3 
 
 
248 aa  245  4e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1583  ABC transporter related  46.32 
 
 
232 aa  244  6.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1212  ABC transporter related  50 
 
 
251 aa  244  6.999999999999999e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777209 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  49.57 
 
 
253 aa  244  8e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0216  hypothetical protein  54.26 
 
 
236 aa  243  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1583  ABC transporter ATPase  52.91 
 
 
241 aa  239  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.929196  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1125  ATPase  50.67 
 
 
245 aa  239  2e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.237557 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1479  ABC transporter-related protein  50.22 
 
 
244 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  52 
 
 
253 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2206  ABC transporter related  51.12 
 
 
251 aa  239  4e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  50.43 
 
 
232 aa  238  5e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5173  ABC transporter related  51.56 
 
 
238 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0324  ABC transporter related protein  50 
 
 
235 aa  235  4e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  52.02 
 
 
245 aa  234  8e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  51.57 
 
 
235 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  46.52 
 
 
236 aa  231  5e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  49.79 
 
 
235 aa  231  5e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  47.98 
 
 
245 aa  232  5e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4501  ABC transporter related  48 
 
 
234 aa  231  6e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.293779 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4369  ABC transporter related  48 
 
 
234 aa  231  6e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  49.78 
 
 
235 aa  230  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1056  ABC transporter related  50.66 
 
 
240 aa  229  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3583  ABC transporter related  49.33 
 
 
241 aa  229  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.64 
 
 
233 aa  228  9e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.684387  normal  0.338705 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0302  ABC transporter related  50.67 
 
 
250 aa  226  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  50.67 
 
 
234 aa  226  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01810  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.29 
 
 
236 aa  223  2e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0062  ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 
234 aa  223  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6252  ABC transporter related  49.04 
 
 
234 aa  223  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  0.438945 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  45.49 
 
 
604 aa  221  9.999999999999999e-57  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0109  ABC transporter related  47.84 
 
 
243 aa  220  1.9999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.112558  normal  0.0826339 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  44.4 
 
 
345 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  44.49 
 
 
230 aa  208  7e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  43.38 
 
 
226 aa  200  9.999999999999999e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  49.08 
 
 
225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  44.5 
 
 
232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  49.08 
 
 
225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  44.7 
 
 
228 aa  196  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  45.41 
 
 
229 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  43.84 
 
 
225 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  43.23 
 
 
231 aa  193  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  44.93 
 
 
229 aa  192  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  44.81 
 
 
231 aa  191  6e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  46.23 
 
 
221 aa  190  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  44.09 
 
 
230 aa  189  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  39.56 
 
 
239 aa  190  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  45.87 
 
 
225 aa  190  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  46.33 
 
 
220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  42.79 
 
 
234 aa  189  4e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  42.79 
 
 
234 aa  189  4e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  41.82 
 
 
242 aa  188  5e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  43.05 
 
 
228 aa  188  5e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0894  ABC transporter related  44.6 
 
 
224 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.552759  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  42.01 
 
 
225 aa  188  7e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  40.67 
 
 
252 aa  188  8e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  43.98 
 
 
235 aa  188  8e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  44.39 
 
 
230 aa  187  9e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  41.07 
 
 
230 aa  187  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  41.55 
 
 
225 aa  186  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  38.33 
 
 
264 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  38.21 
 
 
244 aa  186  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  43.12 
 
 
225 aa  186  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  40.28 
 
 
229 aa  186  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1979  ABC transporter related  39.82 
 
 
240 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0302  ABC transporter related  44.14 
 
 
289 aa  186  2e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.353598 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>