More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1995 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  100 
 
 
229 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  59.03 
 
 
235 aa  248  6e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  57.53 
 
 
233 aa  241  5e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  62.84 
 
 
234 aa  240  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2017  ABC transporter related  60.55 
 
 
234 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000531605 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2431  ABC transporter related  58.33 
 
 
246 aa  233  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823093  decreased coverage  0.000192607 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2188  ABC transporter, ATP-binding protein  63.13 
 
 
232 aa  228  6e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3044  ABC transporter related  57.4 
 
 
239 aa  228  7e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1311  ABC transporter related  62.04 
 
 
243 aa  227  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.355082  normal  0.912591 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11004  adhesion ABC transporter ATP-binding protein  54.5 
 
 
237 aa  225  4e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.7798e-57  normal  0.515996 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1273  ABC transporter, ATPase subunit  57.41 
 
 
229 aa  222  4e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1518  ABC transporter-related protein  49.1 
 
 
228 aa  216  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  49.78 
 
 
225 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  49.78 
 
 
225 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  52.19 
 
 
233 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  45.25 
 
 
226 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  52.36 
 
 
244 aa  211  5.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  51.75 
 
 
233 aa  211  7e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2458  ABC transporter related  51.1 
 
 
225 aa  209  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  44.8 
 
 
227 aa  208  5e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0437  ABC transporter related protein  48.2 
 
 
229 aa  207  9e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  45.87 
 
 
230 aa  207  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0456  ABC transporter related  47.75 
 
 
229 aa  207  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  44.8 
 
 
227 aa  206  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  44.64 
 
 
242 aa  205  6e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  44.8 
 
 
228 aa  204  7e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  45.09 
 
 
229 aa  204  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0335  ABC transporter related  49.12 
 
 
248 aa  203  2e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000938347 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  45.21 
 
 
225 aa  202  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0955  ABC transporter related protein  48.89 
 
 
240 aa  202  3e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0487401  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  45.54 
 
 
231 aa  202  4e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  49.76 
 
 
225 aa  201  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1657  ABC transporter related  46.64 
 
 
258 aa  201  6e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  48.26 
 
 
236 aa  201  7e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  46.19 
 
 
230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  48.87 
 
 
236 aa  199  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1920  ABC transporter related  50.9 
 
 
227 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0842487  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  44.64 
 
 
237 aa  198  3.9999999999999996e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  45.58 
 
 
241 aa  198  6e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1835  ABC transporter-related protein  50.9 
 
 
227 aa  198  6e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0817226  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  46.58 
 
 
233 aa  198  7e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  46.26 
 
 
252 aa  197  9e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  46.08 
 
 
221 aa  197  9e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5154  ABC transporter related  50.23 
 
 
238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.792432 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1640  ABC lipoprotein exporter, ATPase subunit  48.37 
 
 
245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147012 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1291  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  46.46 
 
 
235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.286185 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  47.3 
 
 
230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  44.14 
 
 
227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  44.25 
 
 
225 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1041  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.81 
 
 
249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  48.26 
 
 
236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  47.06 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  48.13 
 
 
262 aa  196  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.74 
 
 
236 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1689  ABC transporter related protein  50 
 
 
242 aa  196  3e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0942959 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2035  ABC transporter, ATP-binding protein  52.36 
 
 
219 aa  196  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.522762  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  45.74 
 
 
252 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4805  ABC transporter related  50.89 
 
 
245 aa  195  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5007  ABC transporter related  47.91 
 
 
243 aa  195  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.283517  normal  0.0370159 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3214  ABC transporter related  51.01 
 
 
214 aa  195  6e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808237  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  43.69 
 
 
233 aa  194  8.000000000000001e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  45.61 
 
 
240 aa  194  8.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3627  ABC transporter related  49.09 
 
 
238 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1077  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.78 
 
 
244 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0335181  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  47.75 
 
 
240 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  40.09 
 
 
233 aa  194  1e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  47.79 
 
 
248 aa  194  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  50.23 
 
 
239 aa  194  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1154  ABC transporter related  49.77 
 
 
215 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.496221  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0756  ABC transporter related  46.43 
 
 
226 aa  193  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.688421  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  46.67 
 
 
231 aa  193  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  46.89 
 
 
291 aa  193  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3469  ABC transporter related  50.23 
 
 
216 aa  193  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.297333  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  48.17 
 
 
245 aa  193  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3112  ABC transporter related  50.73 
 
 
225 aa  193  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.45 
 
 
264 aa  192  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.05 
 
 
227 aa  192  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3374  ABC efflux transporter, ATPase subunit  52.68 
 
 
211 aa  192  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  48.62 
 
 
266 aa  192  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2043  ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
227 aa  192  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.062878  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  44.14 
 
 
236 aa  192  3e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  47.95 
 
 
279 aa  192  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  47.42 
 
 
455 aa  192  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  44.1 
 
 
235 aa  192  4e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  44.39 
 
 
319 aa  192  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8875  ABC transporter-related protein  45.41 
 
 
243 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0534003  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  48.39 
 
 
226 aa  192  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.05 
 
 
236 aa  192  4e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  43.59 
 
 
233 aa  192  5e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  45.54 
 
 
255 aa  192  5e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  47.95 
 
 
230 aa  192  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1057  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.39 
 
 
242 aa  191  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  42.47 
 
 
240 aa  191  6e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0961  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.39 
 
 
242 aa  191  6e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00749478  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  44 
 
 
227 aa  191  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  46.72 
 
 
653 aa  191  7e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0833  ABC transporter related  43.32 
 
 
236 aa  191  7e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  45 
 
 
258 aa  191  7e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3507  ABC transporter related  43.32 
 
 
236 aa  191  7e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  46.58 
 
 
224 aa  191  7e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>