More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4501 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4369  ABC transporter related  100 
 
 		 234 aa  473  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4501  ABC transporter related  100 
 
 		 234 aa  473  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.293779 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0062  ABC transporter, ATP-binding protein  80.77 
 
 		 234 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6252  ABC transporter related  80.77 
 
 		 234 aa  368  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  0.438945 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  67.53 
 
 		 238 aa  324  7e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2206  ABC transporter related  65.24 
 
 		 251 aa  314  6e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  66.96 
 
 		 248 aa  310  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1056  ABC transporter related  66.23 
 
 		 240 aa  308  4e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  66.52 
 
 		 244 aa  306  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  66.09 
 
 		 244 aa  305  6e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5173  ABC transporter related  63.64 
 
 		 238 aa  300  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  63.52 
 
 		 240 aa  295  4e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  62.77 
 
 		 245 aa  295  4e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  64.38 
 
 		 236 aa  294  6e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0324  ABC transporter related protein  62.23 
 
 		 235 aa  294  7e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2064  ABC transporter related protein  61.8 
 
 		 244 aa  293  2e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.325549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  61.47 
 
 		 254 aa  291  7e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  61.47 
 
 		 253 aa  290  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1212  ABC transporter related  60.61 
 
 		 251 aa  290  1e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777209 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  58.8 
 
 		 244 aa  290  2e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  61.47 
 
 		 238 aa  289  3e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1125  ATPase  60.61 
 
 		 245 aa  288  5.0000000000000004e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.237557 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1583  ABC transporter ATPase  64.94 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.929196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3436  putative ABC transporter, ATP-binding protein  60.17 
 
 		 245 aa  285  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  60.17 
 
 		 253 aa  284  8e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  59.74 
 
 		 240 aa  284  8e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1509  ABC transporter related  57.14 
 
 		 248 aa  279  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1479  ABC transporter-related protein  56.28 
 
 		 244 aa  278  4e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  58.87 
 
 		 243 aa  276  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  57.94 
 
 		 235 aa  275  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0302  ABC transporter related  62.56 
 
 		 250 aa  271  5.000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  57.08 
 
 		 235 aa  270  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3583  ABC transporter related  59.57 
 
 		 241 aa  270  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  61.37 
 
 		 236 aa  270  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0216  hypothetical protein  54.35 
 
 		 236 aa  268  4e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  56.09 
 
 		 245 aa  264  8.999999999999999e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2874  ABC transporter related  56.76 
 
 		 236 aa  259  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.675054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1715  ATPase  55.05 
 
 		 236 aa  247  9e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  47.01 
 
 		 234 aa  241  6e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0132  ABC transporter, ATP-binding protein  51.56 
 
 		 233 aa  241  1e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  55.56 
 
 		 236 aa  238  6.999999999999999e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  46.93 
 
 		 233 aa  238  6.999999999999999e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  49.78 
 
 		 234 aa  237  9e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  46.19 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  46.12 
 
 		 233 aa  235  5.0000000000000005e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  46.93 
 
 		 232 aa  234  6e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  48.66 
 
 		 233 aa  234  7e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  46.67 
 
 		 234 aa  234  8e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  50.23 
 
 		 239 aa  232  5e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  45.61 
 
 		 236 aa  231  5e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0745  ABC transporter, ATP-binding protein  48 
 
 		 233 aa  231  6e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0728  ABC transporter, ATP-binding protein  48 
 
 		 233 aa  231  6e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1515  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  47.56 
 
 		 233 aa  229  4e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  48.02 
 
 		 234 aa  228  6e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1583  ABC transporter related  45.85 
 
 		 232 aa  228  8e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  49.09 
 
 		 235 aa  227  1e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  45.26 
 
 		 233 aa  225  5.0000000000000005e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  46.49 
 
 		 233 aa  224  1e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  48.18 
 
 		 232 aa  223  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  51.94 
 
 		 233 aa  221  7e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  50 
 
 		 233 aa  221  7e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  49.51 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01810  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.61 
 
 		 236 aa  210  2e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.61 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.684387  normal  0.338705 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  46.54 
 
 		 242 aa  204  8e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0109  ABC transporter related  47.71 
 
 		 243 aa  197  9e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.112558  normal  0.0826339 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  41.35 
 
 		 604 aa  196  3e-49  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  47.22 
 
 		 252 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  47.06 
 
 		 224 aa  194  8.000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  40.34 
 
 		 345 aa  192  3e-48  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1252  ABC transporter related  45.05 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.252759 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4336  ABC transporter related  49.15 
 
 		 268 aa  190  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0133  ABC Transporter  40 
 
 		 300 aa  189  2e-47  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  42.86 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  40.36 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  47.89 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  42.98 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  41.99 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  44.59 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  45.98 
 
 		 235 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  45.78 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0968  ABC transporter related  46.19 
 
 		 254 aa  186  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0806647  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  46.3 
 
 		 229 aa  185  4e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  45.25 
 
 		 232 aa  186  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  48.51 
 
 		 217 aa  186  4e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2658  ABC transporter-related protein  40.97 
 
 		 227 aa  186  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3973  ABC transporter related protein  46.7 
 
 		 275 aa  185  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  42.92 
 
 		 225 aa  184  7e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  43.95 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  40.17 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  42.99 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.33 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  40.43 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  42.8 
 
 		 654 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  45.37 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  46.73 
 
 		 255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  40.79 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  41.35 
 
 		 256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  45.58 
 
 		 222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2540  ABC transporter related  42.34 
 
 		 241 aa  182  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.656818  normal  0.632823 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>