More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6252 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6252  ABC transporter related  100 
 
 
234 aa  474  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  0.438945 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0062  ABC transporter, ATP-binding protein  86.32 
 
 
234 aa  411  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4369  ABC transporter related  80.77 
 
 
234 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4501  ABC transporter related  80.77 
 
 
234 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.293779 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  66.67 
 
 
238 aa  323  2e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  64.5 
 
 
253 aa  306  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2206  ABC transporter related  62.66 
 
 
251 aa  303  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3436  putative ABC transporter, ATP-binding protein  62.34 
 
 
245 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  64.38 
 
 
240 aa  301  6.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  64.78 
 
 
248 aa  300  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  61.9 
 
 
238 aa  300  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1583  ABC transporter ATPase  66.67 
 
 
241 aa  298  4e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.929196  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0324  ABC transporter related protein  61.37 
 
 
235 aa  298  7e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  64.35 
 
 
244 aa  297  1e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  62.34 
 
 
254 aa  296  3e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  63.91 
 
 
244 aa  295  5e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  61.9 
 
 
245 aa  294  7e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  59.66 
 
 
244 aa  293  1e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5173  ABC transporter related  62.34 
 
 
238 aa  293  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  61.47 
 
 
243 aa  291  5e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  63.52 
 
 
236 aa  291  6e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  61.9 
 
 
240 aa  291  6e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1056  ABC transporter related  63.27 
 
 
240 aa  289  2e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  60.17 
 
 
253 aa  289  3e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1125  ATPase  60.17 
 
 
245 aa  287  8e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.237557 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1509  ABC transporter related  58.01 
 
 
248 aa  287  9e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1479  ABC transporter-related protein  58.01 
 
 
244 aa  286  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2064  ABC transporter related protein  60.09 
 
 
244 aa  286  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.325549  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1212  ABC transporter related  58.87 
 
 
251 aa  286  2e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777209 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  59.31 
 
 
235 aa  280  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  57.51 
 
 
235 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0216  hypothetical protein  53.48 
 
 
236 aa  271  8.000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  61.37 
 
 
236 aa  270  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0302  ABC transporter related  61.5 
 
 
250 aa  263  1e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3583  ABC transporter related  57.39 
 
 
241 aa  261  8.999999999999999e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  53.91 
 
 
245 aa  258  8e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2874  ABC transporter related  54.95 
 
 
236 aa  250  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.675054  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1715  ATPase  56.42 
 
 
236 aa  248  4e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  48.29 
 
 
234 aa  234  8e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  48 
 
 
236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  47.11 
 
 
233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  50.23 
 
 
239 aa  232  4.0000000000000004e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0132  ABC transporter, ATP-binding protein  48.26 
 
 
233 aa  230  1e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1583  ABC transporter related  45.41 
 
 
232 aa  229  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  49.33 
 
 
233 aa  227  1e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  45.26 
 
 
233 aa  227  1e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  44.02 
 
 
234 aa  226  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  48.21 
 
 
233 aa  226  2e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.44 
 
 
233 aa  226  2e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0745  ABC transporter, ATP-binding protein  46.22 
 
 
233 aa  225  4e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0728  ABC transporter, ATP-binding protein  46.22 
 
 
233 aa  225  4e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  45.26 
 
 
233 aa  225  5.0000000000000005e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  45.78 
 
 
233 aa  224  6e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  45.29 
 
 
233 aa  224  7e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  45.33 
 
 
234 aa  224  1e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  47.62 
 
 
232 aa  222  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  46.22 
 
 
234 aa  221  8e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  43.86 
 
 
232 aa  220  9.999999999999999e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  46.22 
 
 
233 aa  220  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  48.93 
 
 
236 aa  219  3.9999999999999997e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1515  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  45.78 
 
 
233 aa  218  6e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  43.83 
 
 
235 aa  216  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01810  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.3 
 
 
236 aa  207  1e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  50 
 
 
235 aa  207  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0109  ABC transporter related  49.08 
 
 
243 aa  206  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.112558  normal  0.0826339 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.91 
 
 
233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.684387  normal  0.338705 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  40.93 
 
 
604 aa  198  6e-50  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  44.3 
 
 
252 aa  198  7e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  44.2 
 
 
229 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  46.22 
 
 
232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  45.85 
 
 
246 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  41.2 
 
 
345 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  44.64 
 
 
229 aa  194  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  45.98 
 
 
227 aa  193  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0968  ABC transporter related  49.77 
 
 
254 aa  193  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0806647  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  45.16 
 
 
252 aa  192  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  42.41 
 
 
230 aa  191  6e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  47.51 
 
 
224 aa  191  9e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  44.95 
 
 
242 aa  190  1e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  48.36 
 
 
239 aa  190  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  42.41 
 
 
231 aa  189  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  44.34 
 
 
247 aa  189  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  44.25 
 
 
226 aa  189  5e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  45.66 
 
 
222 aa  188  5.999999999999999e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  44.09 
 
 
225 aa  188  7e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  46.26 
 
 
255 aa  188  7e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  44.44 
 
 
255 aa  187  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4336  ABC transporter related  50.7 
 
 
268 aa  187  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2600  ABC transporter related  45.58 
 
 
227 aa  186  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  39.91 
 
 
235 aa  186  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2017  ABC transporter related  45.41 
 
 
234 aa  186  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000531605 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  41.81 
 
 
225 aa  185  6e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  44.69 
 
 
228 aa  185  7e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  44.39 
 
 
256 aa  184  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2540  ABC transporter related  42.22 
 
 
241 aa  185  7e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.656818  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  43.86 
 
 
225 aa  184  7e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  43.17 
 
 
225 aa  184  8e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1252  ABC transporter related  44.44 
 
 
234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.252759 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  40.52 
 
 
234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0133  ABC Transporter  39.57 
 
 
300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>