More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0132 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0132  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 233 aa  481  1e-135  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1515  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  80.69 
 
 		 233 aa  397  9.999999999999999e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  61.64 
 
 		 234 aa  301  4.0000000000000003e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  60.34 
 
 		 234 aa  297  8e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  56.65 
 
 		 233 aa  287  1e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  58.8 
 
 		 233 aa  284  1.0000000000000001e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0745  ABC transporter, ATP-binding protein  58.37 
 
 		 233 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0728  ABC transporter, ATP-binding protein  58.37 
 
 		 233 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  57.08 
 
 		 233 aa  282  3.0000000000000004e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  57.51 
 
 		 233 aa  282  4.0000000000000003e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  59.57 
 
 		 234 aa  277  9e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  56.22 
 
 		 233 aa  276  2e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  58.37 
 
 		 233 aa  274  7e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  55.79 
 
 		 233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  54.51 
 
 		 236 aa  269  2e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  55.79 
 
 		 233 aa  265  4e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  51.07 
 
 		 233 aa  265  5e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1125  ATPase  53.48 
 
 		 245 aa  256  2e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.237557 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2874  ABC transporter related  53.04 
 
 		 236 aa  249  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.675054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1715  ATPase  52.17 
 
 		 236 aa  247  9e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1212  ABC transporter related  52.21 
 
 		 251 aa  246  2e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777209 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4501  ABC transporter related  51.56 
 
 		 234 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.293779 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4369  ABC transporter related  51.56 
 
 		 234 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1509  ABC transporter related  51.11 
 
 		 248 aa  239  4e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  49.33 
 
 		 245 aa  235  5.0000000000000005e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  48.51 
 
 		 235 aa  233  3e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6252  ABC transporter related  49.33 
 
 		 234 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  0.438945 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  51.56 
 
 		 235 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  48.7 
 
 		 232 aa  230  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  50.88 
 
 		 235 aa  229  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3436  putative ABC transporter, ATP-binding protein  51.57 
 
 		 245 aa  229  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  49.57 
 
 		 244 aa  228  4e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  54.22 
 
 		 244 aa  228  5e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  54.22 
 
 		 244 aa  228  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0062  ABC transporter, ATP-binding protein  48.7 
 
 		 234 aa  228  6e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  47.62 
 
 		 232 aa  227  1e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1479  ABC transporter-related protein  47.58 
 
 		 244 aa  226  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  51.56 
 
 		 236 aa  226  3e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  50.67 
 
 		 253 aa  225  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  52.91 
 
 		 248 aa  224  7e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  50.67 
 
 		 238 aa  224  8e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  51.77 
 
 		 253 aa  224  8e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  49.14 
 
 		 254 aa  224  9e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  50.22 
 
 		 236 aa  223  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  50.67 
 
 		 243 aa  223  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  52.02 
 
 		 238 aa  222  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3583  ABC transporter related  49.14 
 
 		 241 aa  220  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2206  ABC transporter related  48.44 
 
 		 251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  47.3 
 
 		 239 aa  218  5e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  48 
 
 		 240 aa  217  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1056  ABC transporter related  53.55 
 
 		 240 aa  217  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  53.08 
 
 		 245 aa  216  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01810  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.97 
 
 		 236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2064  ABC transporter related protein  51.92 
 
 		 244 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.325549  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0216  hypothetical protein  48.23 
 
 		 236 aa  214  8e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0324  ABC transporter related protein  50.22 
 
 		 235 aa  214  8e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5173  ABC transporter related  50 
 
 		 238 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  48.46 
 
 		 240 aa  211  5.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1583  ABC transporter related  42.42 
 
 		 232 aa  211  7.999999999999999e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0109  ABC transporter related  49.32 
 
 		 243 aa  210  2e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.112558  normal  0.0826339 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1583  ABC transporter ATPase  49.78 
 
 		 241 aa  206  3e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.929196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0302  ABC transporter related  49.33 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  46.67 
 
 		 236 aa  201  7e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  49.53 
 
 		 256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  45.78 
 
 		 234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  46.9 
 
 		 253 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  39.91 
 
 		 233 aa  192  3e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.684387  normal  0.338705 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  44.44 
 
 		 252 aa  191  6e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0955  ABC transporter related protein  45.7 
 
 		 240 aa  188  5.999999999999999e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0487401  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  39.08 
 
 		 604 aa  186  2e-46  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  43.11 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0268  ABC transporter related  42.04 
 
 		 277 aa  185  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000875319 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  45.7 
 
 		 235 aa  185  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  41.59 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  38.84 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  42.99 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  44.95 
 
 		 248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  44.95 
 
 		 248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf119  ABC transporter ATP-binding protein  41.67 
 
 		 299 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  39.66 
 
 		 345 aa  182  3e-45  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  42.67 
 
 		 247 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  41.39 
 
 		 259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2097  ABC transporter related protein  43.64 
 
 		 231 aa  181  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.531887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  46.51 
 
 		 266 aa  180  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  43.38 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  36.73 
 
 		 226 aa  181  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  42.92 
 
 		 255 aa  180  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  42.6 
 
 		 230 aa  181  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3219  ABC transporter, ATP-binding protein  40.89 
 
 		 248 aa  179  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  42.66 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  41.18 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  42.06 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  44.75 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  43.84 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  39.19 
 
 		 242 aa  179  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  44.65 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  42.22 
 
 		 455 aa  180  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  42.2 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  43.89 
 
 		 268 aa  179  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  42.48 
 
 		 255 aa  178  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>